More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3694 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3694  MATE efflux family protein  100 
 
 		 472 aa  890    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3542  MATE efflux family protein  79.39 
 
 		 467 aa  678    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0048  MATE efflux family protein  60.13 
 
 		 460 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782578  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5998  MATE efflux family protein  57.05 
 
 		 486 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.926416 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0048  MATE efflux family protein  60.45 
 
 		 460 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0386984 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4118  MATE efflux family protein  57.33 
 
 		 468 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3795  MATE efflux family protein  56.68 
 
 		 468 aa  402  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3317  MATE efflux family protein  48.96 
 
 		 469 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2205  hypothetical protein  48.14 
 
 		 480 aa  345  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3623  MATE efflux family protein  42 
 
 		 457 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1675  MATE efflux family protein  42.54 
 
 		 457 aa  295  9e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1345  multi anti extrusion protein MatE  43.15 
 
 		 459 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0908  multi anti extrusion protein MatE  38.55 
 
 		 483 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0522974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0796  multi anti extrusion protein MatE  39.2 
 
 		 484 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1888  MATE efflux family protein  41.54 
 
 		 457 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5248  multi antimicrobial extrusion protein MatE  38.67 
 
 		 478 aa  276  8e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0771  putative cation-driven multidrug efflux pump  38.5 
 
 		 485 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00132131 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3218  multi anti extrusion protein MatE  39.46 
 
 		 455 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3060  multi anti extrusion protein MatE  39.22 
 
 		 456 aa  208  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147245  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  27.98 
 
 		 460 aa  184  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  30.4 
 
 		 462 aa  129  8.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  27 
 
 		 452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  26.74 
 
 		 455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  29.43 
 
 		 454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  27.76 
 
 		 455 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  28.15 
 
 		 451 aa  127  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  27.76 
 
 		 455 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 455 aa  126  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 455 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.32 
 
 		 468 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  26.74 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  25.75 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 454 aa  124  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  27.57 
 
 		 455 aa  123  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  27 
 
 		 452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  28.5 
 
 		 485 aa  121  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  31.23 
 
 		 453 aa  121  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.81 
 
 		 462 aa  121  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  30.48 
 
 		 467 aa  121  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  28.83 
 
 		 486 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 452 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  27 
 
 		 452 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  27.64 
 
 		 454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 458 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 476 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  27.75 
 
 		 458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  28.57 
 
 		 456 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  28.4 
 
 		 484 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  28.05 
 
 		 463 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  26.94 
 
 		 470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  28.4 
 
 		 460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 456 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  28.5 
 
 		 457 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  26.7 
 
 		 463 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  26.9 
 
 		 445 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  28.03 
 
 		 470 aa  109  9.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  28.5 
 
 		 490 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  27.4 
 
 		 470 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  24.7 
 
 		 459 aa  107  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  29.19 
 
 		 486 aa  107  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  27.13 
 
 		 475 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.77 
 
 		 464 aa  104  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.77 
 
 		 464 aa  104  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  23.82 
 
 		 469 aa  103  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  28.36 
 
 		 525 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  24.67 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  29.4 
 
 		 481 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  24 
 
 		 460 aa  102  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  25.38 
 
 		 469 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  30.02 
 
 		 496 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  25.38 
 
 		 469 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  28.35 
 
 		 460 aa  100  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 455 aa  100  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  23.65 
 
 		 468 aa  100  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  26.36 
 
 		 538 aa  100  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  26.14 
 
 		 500 aa  100  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  25.86 
 
 		 460 aa  100  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 468 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  23.14 
 
 		 469 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  25.38 
 
 		 500 aa  98.2  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  21.21 
 
 		 448 aa  97.8  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  24.21 
 
 		 469 aa  97.4  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  24.21 
 
 		 469 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  24.21 
 
 		 469 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  25.63 
 
 		 554 aa  97.4  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  25.8 
 
 		 469 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  28.11 
 
 		 461 aa  97.1  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  24.21 
 
 		 469 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  24.21 
 
 		 469 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  28.49 
 
 		 428 aa  95.1  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  28.61 
 
 		 472 aa  94.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  25 
 
 		 460 aa  94.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  26.04 
 
 		 460 aa  94  5e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  26.76 
 
 		 498 aa  93.6  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  22 
 
 		 448 aa  93.6  7e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  30.3 
 
 		 521 aa  93.6  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  26.2 
 
 		 459 aa  93.2  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  29.81 
 
 		 503 aa  92.8  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  25 
 
 		 475 aa  92.8  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>