More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0771 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0771  putative cation-driven multidrug efflux pump  100 
 
 		 485 aa  939    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00132131 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0908  multi anti extrusion protein MatE  69.44 
 
 		 483 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0522974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5248  multi antimicrobial extrusion protein MatE  67.71 
 
 		 478 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0796  multi anti extrusion protein MatE  64.48 
 
 		 484 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3623  MATE efflux family protein  55.01 
 
 		 457 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1675  MATE efflux family protein  52.3 
 
 		 457 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1888  MATE efflux family protein  53.74 
 
 		 457 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1345  multi anti extrusion protein MatE  47.61 
 
 		 459 aa  338  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3542  MATE efflux family protein  41.98 
 
 		 467 aa  276  7e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2205  hypothetical protein  39.95 
 
 		 480 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0048  MATE efflux family protein  39.37 
 
 		 460 aa  256  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782578  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3694  MATE efflux family protein  38.31 
 
 		 472 aa  250  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5998  MATE efflux family protein  39.51 
 
 		 486 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.926416 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0048  MATE efflux family protein  41.46 
 
 		 460 aa  230  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0386984 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3317  MATE efflux family protein  36.6 
 
 		 469 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3795  MATE efflux family protein  38.3 
 
 		 468 aa  205  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4118  MATE efflux family protein  38.3 
 
 		 468 aa  203  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3218  multi anti extrusion protein MatE  36.52 
 
 		 455 aa  186  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3060  multi anti extrusion protein MatE  36.19 
 
 		 456 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147245  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.37 
 
 		 460 aa  153  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  32.91 
 
 		 470 aa  138  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  30.89 
 
 		 500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  25.72 
 
 		 454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 468 aa  126  8.000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 455 aa  125  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  28.43 
 
 		 500 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  26.25 
 
 		 455 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  25.6 
 
 		 452 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  26.25 
 
 		 455 aa  117  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  27.03 
 
 		 452 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  26.57 
 
 		 452 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  26.25 
 
 		 455 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  26.01 
 
 		 455 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  26.79 
 
 		 452 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  25.53 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  27.96 
 
 		 445 aa  114  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  27.01 
 
 		 518 aa  113  7.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  25.55 
 
 		 475 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  28.69 
 
 		 455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  30.38 
 
 		 454 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  26.49 
 
 		 451 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  27.7 
 
 		 467 aa  110  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  28.37 
 
 		 458 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.77 
 
 		 467 aa  109  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  27.53 
 
 		 463 aa  108  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  28.94 
 
 		 486 aa  108  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  24.32 
 
 		 554 aa  107  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  25.78 
 
 		 456 aa  106  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  26.79 
 
 		 454 aa  106  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  27.2 
 
 		 458 aa  106  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 485 aa  106  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  25.6 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  27.05 
 
 		 498 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  25.19 
 
 		 453 aa  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  27.75 
 
 		 464 aa  103  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  26.57 
 
 		 538 aa  103  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  27.81 
 
 		 478 aa  101  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  26.49 
 
 		 467 aa  101  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  25.33 
 
 		 477 aa  101  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  25.73 
 
 		 499 aa  101  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 451 aa  101  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  26.8 
 
 		 485 aa  100  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  27.75 
 
 		 481 aa  100  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  25.72 
 
 		 462 aa  97.4  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  26.25 
 
 		 453 aa  97.1  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  27.7 
 
 		 490 aa  97.1  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 467 aa  96.7  9e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  25.92 
 
 		 477 aa  95.9  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  27.42 
 
 		 473 aa  96.3  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  27.08 
 
 		 466 aa  95.9  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  23.1 
 
 		 448 aa  94  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  26.12 
 
 		 478 aa  94  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  22.13 
 
 		 454 aa  94  6e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  26.7 
 
 		 408 aa  92.8  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  27.64 
 
 		 463 aa  92.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  23.35 
 
 		 470 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  24.68 
 
 		 448 aa  91.7  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 440 aa  91.7  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  26.94 
 
 		 525 aa  90.5  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  26.1 
 
 		 455 aa  90.1  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.36 
 
 		 458 aa  90.1  8e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  26.94 
 
 		 484 aa  89.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  23.54 
 
 		 460 aa  89.4  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  29.31 
 
 		 452 aa  89.4  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  27.93 
 
 		 456 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  24.73 
 
 		 452 aa  89  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 466 aa  88.6  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  22.6 
 
 		 448 aa  88.6  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  22.88 
 
 		 453 aa  88.6  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  27.22 
 
 		 454 aa  89  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  23.37 
 
 		 475 aa  88.2  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  25.76 
 
 		 476 aa  87.8  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 460 aa  87.8  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.19 
 
 		 467 aa  86.7  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  25.69 
 
 		 443 aa  86.7  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4099  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273315 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  21.88 
 
 		 475 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  26.6 
 
 		 455 aa  85.9  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  29.47 
 
 		 468 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  23.27 
 
 		 453 aa  85.1  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>