More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3795 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3795  MATE efflux family protein  100 
 
 		 468 aa  877    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4118  MATE efflux family protein  97.86 
 
 		 468 aa  765    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5998  MATE efflux family protein  79.74 
 
 		 486 aa  672    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.926416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0048  MATE efflux family protein  64.27 
 
 		 460 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782578  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0048  MATE efflux family protein  64.27 
 
 		 460 aa  478  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0386984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3542  MATE efflux family protein  60.23 
 
 		 467 aa  472  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3694  MATE efflux family protein  56.68 
 
 		 472 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3317  MATE efflux family protein  47.17 
 
 		 469 aa  325  1e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2205  hypothetical protein  45.66 
 
 		 480 aa  323  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1345  multi anti extrusion protein MatE  43.1 
 
 		 459 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3623  MATE efflux family protein  40.8 
 
 		 457 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0796  multi anti extrusion protein MatE  38.93 
 
 		 484 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1888  MATE efflux family protein  41.47 
 
 		 457 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5248  multi antimicrobial extrusion protein MatE  38.14 
 
 		 478 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1675  MATE efflux family protein  40.93 
 
 		 457 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0908  multi anti extrusion protein MatE  36.98 
 
 		 483 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0522974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0771  putative cation-driven multidrug efflux pump  37.38 
 
 		 485 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00132131 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3218  multi anti extrusion protein MatE  37.33 
 
 		 455 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3060  multi anti extrusion protein MatE  37.1 
 
 		 456 aa  189  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147245  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  30.99 
 
 		 460 aa  164  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  29.52 
 
 		 470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.34 
 
 		 468 aa  126  8.000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  28.88 
 
 		 445 aa  125  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  27.78 
 
 		 455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  27.32 
 
 		 455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  27.11 
 
 		 452 aa  121  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  30.05 
 
 		 457 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  29.51 
 
 		 484 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  27.51 
 
 		 476 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  25.25 
 
 		 451 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  28.64 
 
 		 454 aa  117  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  28.35 
 
 		 453 aa  117  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 455 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 455 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  28.85 
 
 		 456 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  27.78 
 
 		 452 aa  113  9e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  28.42 
 
 		 486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  27.53 
 
 		 452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  27.05 
 
 		 452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  30.28 
 
 		 500 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  28.27 
 
 		 500 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.86 
 
 		 464 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.92 
 
 		 464 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  28.53 
 
 		 463 aa  111  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 454 aa  110  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  28.03 
 
 		 454 aa  109  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  26.89 
 
 		 457 aa  108  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 459 aa  107  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  28.4 
 
 		 467 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 456 aa  107  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  29.31 
 
 		 466 aa  106  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  28.72 
 
 		 485 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  27.87 
 
 		 458 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  27.97 
 
 		 460 aa  104  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 453 aa  103  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  26.09 
 
 		 462 aa  103  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.05 
 
 		 462 aa  102  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  30.27 
 
 		 481 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  28.1 
 
 		 478 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 464 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  27.33 
 
 		 485 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  27.51 
 
 		 458 aa  101  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  28.97 
 
 		 460 aa  100  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  26.18 
 
 		 554 aa  99.4  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  26.29 
 
 		 460 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 470 aa  98.6  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  26.2 
 
 		 463 aa  97.4  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 461 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 451 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  24.88 
 
 		 468 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  26.29 
 
 		 470 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  26.29 
 
 		 460 aa  94.4  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  26.48 
 
 		 490 aa  94.4  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  23 
 
 		 448 aa  93.6  7e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  25.35 
 
 		 459 aa  93.2  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  25.16 
 
 		 475 aa  92  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 454 aa  92.4  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  26.48 
 
 		 475 aa  91.3  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  25.13 
 
 		 475 aa  91.3  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 461 aa  90.9  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  26.61 
 
 		 461 aa  90.9  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  26.03 
 
 		 477 aa  89.7  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 525 aa  88.6  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  26.05 
 
 		 438 aa  88.6  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  21.08 
 
 		 460 aa  89  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  27.03 
 
 		 428 aa  87.8  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  23.65 
 
 		 458 aa  87.4  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 518 aa  85.9  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  29.1 
 
 		 437 aa  85.1  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  23.87 
 
 		 475 aa  84.7  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  23.47 
 
 		 451 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 499 aa  84.7  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  24.18 
 
 		 455 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  25.54 
 
 		 453 aa  84.3  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  27.63 
 
 		 467 aa  84  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 437 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  23.23 
 
 		 468 aa  83.2  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>