More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2533 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2533  multi anti extrusion protein MatE  100 
 
 		 447 aa  869    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000103349  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  27.13 
 
 		 461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  27.57 
 
 		 438 aa  123  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1922  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 456 aa  122  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  30.04 
 
 		 458 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  27.34 
 
 		 438 aa  120  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  27.83 
 
 		 461 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  26.48 
 
 		 470 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  26.73 
 
 		 475 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 458 aa  107  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16054  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  25.36 
 
 		 443 aa  107  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0679405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  26.36 
 
 		 475 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  27.79 
 
 		 445 aa  106  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  26.89 
 
 		 458 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.92 
 
 		 460 aa  104  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 463 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  24.63 
 
 		 464 aa  103  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  26.14 
 
 		 475 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  27.05 
 
 		 467 aa  97.4  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  27.45 
 
 		 475 aa  97.4  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  27.6 
 
 		 483 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  26.95 
 
 		 462 aa  93.6  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  27.73 
 
 		 457 aa  93.2  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  26.6 
 
 		 505 aa  91.7  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.96 
 
 		 468 aa  91.3  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  25.6 
 
 		 499 aa  90.1  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  24.41 
 
 		 460 aa  89.7  9e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 464 aa  89  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 464 aa  86.7  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  25.78 
 
 		 446 aa  86.3  9e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  25.69 
 
 		 538 aa  86.7  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  26.59 
 
 		 463 aa  86.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  24.88 
 
 		 518 aa  85.1  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  26.85 
 
 		 477 aa  85.1  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  24.17 
 
 		 453 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  28.89 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 438 aa  84.3  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  27.78 
 
 		 463 aa  83.6  0.000000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 554 aa  82.8  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  25.58 
 
 		 469 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.85 
 
 		 461 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  29.13 
 
 		 467 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 485 aa  82.4  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  26.21 
 
 		 468 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  28.76 
 
 		 462 aa  80.9  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.78 
 
 		 467 aa  81.3  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  24.18 
 
 		 451 aa  80.5  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  24.18 
 
 		 451 aa  80.5  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 454 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 500 aa  79.7  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 525 aa  79.7  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  23.8 
 
 		 478 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  26 
 
 		 484 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  23.48 
 
 		 457 aa  79  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  26.48 
 
 		 459 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 466 aa  78.2  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  23.44 
 
 		 453 aa  78.2  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  23.52 
 
 		 468 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 457 aa  77.4  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  25.37 
 
 		 498 aa  77.4  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  27.84 
 
 		 463 aa  77  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  24.03 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  25 
 
 		 452 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  24.66 
 
 		 468 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  25.7 
 
 		 455 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  23.48 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2630  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 472 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  26.34 
 
 		 485 aa  75.1  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0162  MATE efflux family protein  26.76 
 
 		 486 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 451 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 455 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  24.83 
 
 		 463 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 455 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 453 aa  73.9  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  23.52 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0636  MATE efflux family protein  30.91 
 
 		 454 aa  73.6  0.000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.237827 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 451 aa  73.6  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  30.11 
 
 		 453 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 445 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  24.74 
 
 		 454 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  27.34 
 
 		 450 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0308  MATE efflux family protein  26.04 
 
 		 441 aa  72.8  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.426716  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  24.23 
 
 		 448 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  25 
 
 		 500 aa  72.4  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  22.6 
 
 		 469 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 454 aa  72.4  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  23.64 
 
 		 451 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  21.9 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0534  MATE efflux family protein  26.15 
 
 		 451 aa  70.9  0.00000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  25 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  25 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  27.5 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  25 
 
 		 453 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  25 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  26.92 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0255  multidrug efflux protein NorA  29.34 
 
 		 461 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0953  MATE efflux family protein  30.07 
 
 		 450 aa  70.5  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>