More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3319 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  100 
 
 		 460 aa  915    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  66.29 
 
 		 466 aa  557  1e-157  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  54.76 
 
 		 460 aa  513  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  54.76 
 
 		 464 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  40.94 
 
 		 451 aa  363  3e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  39.55 
 
 		 455 aa  306  7e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  39.55 
 
 		 455 aa  306  7e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  37.42 
 
 		 460 aa  303  5.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  39.03 
 
 		 456 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  39.03 
 
 		 456 aa  266  5e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  37.16 
 
 		 449 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  36.64 
 
 		 454 aa  252  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  34.93 
 
 		 454 aa  250  4e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  32.75 
 
 		 477 aa  249  6e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  32.7 
 
 		 442 aa  248  1e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  36.32 
 
 		 455 aa  249  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  33.48 
 
 		 447 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  34.01 
 
 		 455 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  33.03 
 
 		 447 aa  239  1e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  32.95 
 
 		 455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  32.58 
 
 		 449 aa  229  8e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  30.38 
 
 		 493 aa  220  3.9999999999999997e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  30.44 
 
 		 466 aa  216  8e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  33.83 
 
 		 496 aa  212  1e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  33.86 
 
 		 461 aa  212  1e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  32.48 
 
 		 455 aa  211  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  31.64 
 
 		 448 aa  211  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  30.34 
 
 		 452 aa  204  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  33.08 
 
 		 461 aa  204  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  32.05 
 
 		 447 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  31.54 
 
 		 462 aa  201  3e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  33.41 
 
 		 451 aa  195  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  31.12 
 
 		 456 aa  190  5e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  30.92 
 
 		 447 aa  186  5e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  30.3 
 
 		 472 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  29.28 
 
 		 496 aa  184  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  29.01 
 
 		 448 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  28.73 
 
 		 466 aa  183  6e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  30.6 
 
 		 452 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  31.22 
 
 		 454 aa  182  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  28.91 
 
 		 466 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  30.44 
 
 		 459 aa  172  9e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  32.68 
 
 		 447 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  28.29 
 
 		 451 aa  168  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  30.32 
 
 		 470 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  26.85 
 
 		 467 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  27.17 
 
 		 448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  28.51 
 
 		 455 aa  159  9e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  25.99 
 
 		 446 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  25.61 
 
 		 472 aa  158  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  29.9 
 
 		 450 aa  157  3e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 451 aa  157  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0811  efflux protein, putative  28.26 
 
 		 455 aa  154  4e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000282778  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  31.3 
 
 		 458 aa  153  7e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  24.61 
 
 		 448 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  28.03 
 
 		 452 aa  149  7e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  27.66 
 
 		 465 aa  149  9e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  28.19 
 
 		 456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  28.02 
 
 		 439 aa  147  3e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 452 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  26.5 
 
 		 451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  26.5 
 
 		 451 aa  147  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  26.5 
 
 		 451 aa  147  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  26.5 
 
 		 451 aa  147  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 451 aa  146  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  28.76 
 
 		 443 aa  146  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  26.27 
 
 		 451 aa  146  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 467 aa  146  9e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  24.71 
 
 		 468 aa  146  9e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  28.45 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  28.45 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  29.6 
 
 		 448 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  30.35 
 
 		 449 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  27.78 
 
 		 450 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  27.78 
 
 		 450 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  26.98 
 
 		 448 aa  144  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.45 
 
 		 451 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  27.25 
 
 		 450 aa  143  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  29.45 
 
 		 451 aa  143  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  25.69 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  25.42 
 
 		 464 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  24.75 
 
 		 451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  26.22 
 
 		 452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  25.46 
 
 		 451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  28.08 
 
 		 464 aa  139  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  26.76 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  26.8 
 
 		 449 aa  138  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  24.52 
 
 		 459 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.29 
 
 		 467 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  27.55 
 
 		 459 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 440 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3321  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 489 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0635825 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  23.74 
 
 		 460 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 460 aa  130  6e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  24.56 
 
 		 460 aa  130  6e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  25.65 
 
 		 454 aa  129  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  24.25 
 
 		 475 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>