More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1841 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1841  MATE efflux family protein  100 
 
 		 469 aa  932    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3111  MATE efflux family protein  60.35 
 
 		 489 aa  508  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00116438 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2418  MATE efflux family protein  55.19 
 
 		 471 aa  488  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2664  MATE efflux family protein  44.17 
 
 		 460 aa  352  8e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1967  MATE efflux family protein  35.98 
 
 		 488 aa  265  1e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0778152  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0494  MATE efflux family protein  33.63 
 
 		 455 aa  250  4e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2355  MATE efflux family protein  34.44 
 
 		 449 aa  210  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0530772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1862  MATE efflux family protein  34.23 
 
 		 449 aa  209  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0053  MATE efflux family protein  32.96 
 
 		 451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.39001  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0413  MATE efflux family protein  34.23 
 
 		 449 aa  182  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0252  MATE efflux family protein  31.66 
 
 		 460 aa  136  9e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  25.38 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  29.24 
 
 		 451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  29.24 
 
 		 451 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  29.5 
 
 		 453 aa  130  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 461 aa  130  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  28.04 
 
 		 485 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  24.67 
 
 		 475 aa  127  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  30.41 
 
 		 472 aa  124  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.66 
 
 		 464 aa  123  9e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  29.85 
 
 		 466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 438 aa  120  6e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  23.26 
 
 		 453 aa  116  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  27.84 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  27.84 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1225  multidrug efflux pump, NorM, MATE family  27.1 
 
 		 455 aa  114  5e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000329619  normal  0.0233556 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  27.42 
 
 		 470 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  27.53 
 
 		 457 aa  113  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4308  MATE efflux family protein  29.41 
 
 		 470 aa  113  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  27.4 
 
 		 466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  30.62 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  28.88 
 
 		 474 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  29.72 
 
 		 462 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  29.49 
 
 		 456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1166  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 455 aa  111  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0144354 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  27.7 
 
 		 460 aa  110  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  29.74 
 
 		 462 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0255  multidrug efflux protein NorA  30.55 
 
 		 461 aa  110  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 499 aa  110  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5517  multidrug efflux protein NorA  26.41 
 
 		 464 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  26.37 
 
 		 478 aa  110  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2967  MATE efflux family protein  28.02 
 
 		 467 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0284207 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  27.55 
 
 		 468 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  27.62 
 
 		 483 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  27.79 
 
 		 500 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 467 aa  107  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 459 aa  107  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2708  MATE efflux family protein  27.53 
 
 		 467 aa  107  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1117  MATE efflux family protein  26.89 
 
 		 483 aa  106  7e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.860788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  30.14 
 
 		 462 aa  107  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  26.51 
 
 		 480 aa  106  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  29.52 
 
 		 459 aa  106  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5262  multidrug efflux protein NorA  28.12 
 
 		 462 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00407645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2212  MATE efflux family protein  29.77 
 
 		 462 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520618  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  22.94 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  26.23 
 
 		 500 aa  104  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4204  multi anti extrusion protein MatE  29.77 
 
 		 462 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0638116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  27.89 
 
 		 470 aa  103  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  25.3 
 
 		 457 aa  103  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  24.86 
 
 		 460 aa  103  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29880  Multidrug efflux protein  28.97 
 
 		 459 aa  103  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  27.16 
 
 		 498 aa  103  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  23.65 
 
 		 450 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1656  MATE efflux family protein  26.18 
 
 		 456 aa  102  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.737178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  23.2 
 
 		 458 aa  101  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  23.66 
 
 		 464 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3141  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 472 aa  100  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 518 aa  100  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2403  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 475 aa  100  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0115  multidrug resistance protein NorM, putative  27.55 
 
 		 460 aa  100  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  30.6 
 
 		 469 aa  100  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  27.36 
 
 		 452 aa  100  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 452 aa  100  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  28.75 
 
 		 468 aa  99.8  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  26.09 
 
 		 490 aa  99.8  9e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3598  multidrug efflux protein  29.12 
 
 		 454 aa  99.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  28.75 
 
 		 468 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  28.5 
 
 		 464 aa  99.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  28.37 
 
 		 466 aa  99.8  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  28.75 
 
 		 468 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 525 aa  99.8  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  28.75 
 
 		 468 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1023  multi anti extrusion protein MatE  27.58 
 
 		 464 aa  99.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  28.75 
 
 		 468 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  28.75 
 
 		 468 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  29.26 
 
 		 462 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  28.67 
 
 		 457 aa  99  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0612  MATE efflux family protein  29.26 
 
 		 462 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  22.84 
 
 		 453 aa  98.6  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1091  MATE efflux family protein  29.26 
 
 		 462 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427191  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0208  multidrug efflux protein NorA  27.65 
 
 		 462 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0521775 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 467 aa  98.2  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3129  MATE efflux family protein  30.9 
 
 		 452 aa  97.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  22.51 
 
 		 462 aa  97.1  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5314  multidrug efflux protein NorA  28.61 
 
 		 462 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133881 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  28.32 
 
 		 468 aa  97.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  23.33 
 
 		 450 aa  97.1  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>