More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0252 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_0252  MATE efflux family protein  100 
 
 		 460 aa  868    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0494  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 455 aa  179  1e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2664  MATE efflux family protein  33.92 
 
 		 460 aa  169  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2418  MATE efflux family protein  33.26 
 
 		 471 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1841  MATE efflux family protein  32.68 
 
 		 469 aa  156  8e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3111  MATE efflux family protein  32.01 
 
 		 489 aa  147  5e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00116438 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2355  MATE efflux family protein  29.85 
 
 		 449 aa  133  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0530772  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0413  MATE efflux family protein  29.57 
 
 		 449 aa  123  8e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0053  MATE efflux family protein  29.98 
 
 		 451 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.39001  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  31.72 
 
 		 453 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  28.73 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1862  MATE efflux family protein  28.79 
 
 		 449 aa  114  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 453 aa  113  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  30.8 
 
 		 451 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  25.79 
 
 		 461 aa  110  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  25 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  30.4 
 
 		 468 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  30.58 
 
 		 451 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1967  MATE efflux family protein  26.99 
 
 		 488 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0778152  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  30.12 
 
 		 483 aa  106  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2122  multi anti extrusion protein MatE  31.68 
 
 		 450 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000217461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  31.33 
 
 		 469 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.9 
 
 		 475 aa  103  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 459 aa  103  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3141  MATE efflux family protein  30.23 
 
 		 472 aa  100  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1023  multi anti extrusion protein MatE  26.75 
 
 		 464 aa  100  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  28.17 
 
 		 485 aa  100  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  24.41 
 
 		 450 aa  99.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  28.97 
 
 		 452 aa  98.6  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  29.16 
 
 		 456 aa  98.6  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  28.87 
 
 		 481 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  26.08 
 
 		 464 aa  98.6  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1139  MATE efflux family protein  23.9 
 
 		 452 aa  98.6  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.813977  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  26.11 
 
 		 463 aa  98.2  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  30.41 
 
 		 462 aa  97.8  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.28 
 
 		 464 aa  97.4  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.28 
 
 		 464 aa  96.7  7e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  25.72 
 
 		 475 aa  95.1  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  28.8 
 
 		 469 aa  94.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0945  MATE efflux family protein  28.83 
 
 		 453 aa  95.1  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2521  multi anti extrusion protein MatE  30.81 
 
 		 490 aa  94  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.200402 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 457 aa  94  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  29.71 
 
 		 525 aa  93.6  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3129  MATE efflux family protein  31.16 
 
 		 452 aa  93.2  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  24.88 
 
 		 458 aa  93.2  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  25.29 
 
 		 457 aa  93.2  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  29.44 
 
 		 460 aa  92.4  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0208  multidrug efflux protein NorA  30.18 
 
 		 462 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0521775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5262  multidrug efflux protein NorA  28.32 
 
 		 462 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00407645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1494  MATE efflux family protein  28.08 
 
 		 451 aa  92.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1298  MATE efflux family protein  29.23 
 
 		 467 aa  92  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1180  inner membrane transmembrane protein  29.35 
 
 		 448 aa  91.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000781542  normal  0.19952 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5314  multidrug efflux protein NorA  29.36 
 
 		 462 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133881 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2369  MATE family protein  29.16 
 
 		 459 aa  91.3  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151607  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3585  MATE efflux family protein  27.01 
 
 		 472 aa  90.9  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  25.57 
 
 		 450 aa  91.3  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2967  MATE efflux family protein  25.6 
 
 		 467 aa  91.3  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0284207 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1438  MATE efflux family protein  30.25 
 
 		 453 aa  90.9  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.805906  hitchhiker  0.00501053 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2708  MATE efflux family protein  25.84 
 
 		 467 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  31.51 
 
 		 452 aa  90.5  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 468 aa  90.5  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  26.91 
 
 		 463 aa  90.1  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1237  hypothetical protein  26.27 
 
 		 458 aa  90.5  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0290804  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  28.63 
 
 		 472 aa  89.7  9e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003772  Na+ driven multidrug efflux pump  26.89 
 
 		 458 aa  89.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  22.49 
 
 		 438 aa  89.7  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0162  MATE efflux family protein  27.78 
 
 		 486 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1746  MATE efflux family protein  29.5 
 
 		 451 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325105  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  29.79 
 
 		 470 aa  89  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1006  MATE efflux family protein  30.32 
 
 		 469 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1009  MATE efflux family protein  30.09 
 
 		 464 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2211  multidrug resistance protein NorM, putative  30.15 
 
 		 451 aa  87.4  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0676191  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0316  MATE efflux family protein  24.07 
 
 		 444 aa  87  7e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000262265  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5172  multidrug efflux protein NorA  28.54 
 
 		 462 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  28.4 
 
 		 490 aa  86.3  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  26.51 
 
 		 461 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  25.31 
 
 		 466 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 477 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1773  MATE efflux family protein  28.89 
 
 		 451 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  23.82 
 
 		 457 aa  86.3  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  29.78 
 
 		 447 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1761  MATE efflux family protein  24.56 
 
 		 453 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129666  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  26.81 
 
 		 478 aa  86.3  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  28.32 
 
 		 453 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4204  multi anti extrusion protein MatE  27.61 
 
 		 462 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0638116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  29.78 
 
 		 447 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  25.3 
 
 		 460 aa  84.7  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29880  Multidrug efflux protein  28.83 
 
 		 459 aa  84.7  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  22.31 
 
 		 460 aa  84.7  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  23.64 
 
 		 463 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  23.64 
 
 		 463 aa  84  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1818  MATE efflux family protein  26.94 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.138431 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  23.57 
 
 		 470 aa  84  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  26.85 
 
 		 464 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1225  multidrug efflux pump, NorM, MATE family  23.17 
 
 		 455 aa  82.8  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000329619  normal  0.0233556 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  27.71 
 
 		 464 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6244  MATE efflux family protein  30.08 
 
 		 450 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.813306  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  27.97 
 
 		 462 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1835  MATE efflux family protein  30.08 
 
 		 450 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2383  multidrug resistance protein  29.93 
 
 		 451 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>