More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0494 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0494  MATE efflux family protein  100 
 
 		 455 aa  908    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2418  MATE efflux family protein  34.99 
 
 		 471 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1841  MATE efflux family protein  33.63 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2664  MATE efflux family protein  32.74 
 
 		 460 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3111  MATE efflux family protein  33.11 
 
 		 489 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00116438 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1967  MATE efflux family protein  29.05 
 
 		 488 aa  211  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0778152  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2355  MATE efflux family protein  29.11 
 
 		 449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0530772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1862  MATE efflux family protein  28.32 
 
 		 449 aa  160  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  28.92 
 
 		 464 aa  153  8e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 464 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0413  MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 449 aa  151  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0053  MATE efflux family protein  27.91 
 
 		 451 aa  150  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.39001  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0252  MATE efflux family protein  27.67 
 
 		 460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25.78 
 
 		 453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  26.79 
 
 		 438 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  25.92 
 
 		 461 aa  140  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  25.22 
 
 		 478 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  23.82 
 
 		 454 aa  131  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5314  multidrug efflux protein NorA  27.47 
 
 		 462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133881 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  25.6 
 
 		 470 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5262  multidrug efflux protein NorA  27.05 
 
 		 462 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00407645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  25.69 
 
 		 471 aa  126  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  25.69 
 
 		 471 aa  126  8.000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  26.88 
 
 		 477 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  26.88 
 
 		 477 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_002950  PG1117  MATE efflux family protein  30.79 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.860788 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  27.67 
 
 		 462 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1935  MATE efflux family protein  25.76 
 
 		 460 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.18016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  26.98 
 
 		 462 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  25.64 
 
 		 457 aa  124  5e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1023  multi anti extrusion protein MatE  26.15 
 
 		 464 aa  124  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0255  multidrug efflux protein NorA  27.42 
 
 		 461 aa  121  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0073  multidrug efflux protein NorA  25.88 
 
 		 460 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0208  multidrug efflux protein NorA  26.37 
 
 		 462 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0521775 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0697  multi anti extrusion protein MatE  27.64 
 
 		 468 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.596572  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  24.63 
 
 		 475 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  23.53 
 
 		 450 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2967  MATE efflux family protein  26.33 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0284207 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2212  MATE efflux family protein  26.51 
 
 		 462 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520618  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2708  MATE efflux family protein  25.56 
 
 		 467 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4204  multi anti extrusion protein MatE  26.51 
 
 		 462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0638116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3141  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 472 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5172  multidrug efflux protein NorA  27.27 
 
 		 462 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 450 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 456 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  25.13 
 
 		 452 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  26.4 
 
 		 462 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0612  MATE efflux family protein  26.4 
 
 		 462 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1091  MATE efflux family protein  26.4 
 
 		 462 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427191  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6069  multidrug efflux protein NorA  25.33 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  29.64 
 
 		 453 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  25.63 
 
 		 472 aa  114  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  25.55 
 
 		 470 aa  114  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 451 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  24.75 
 
 		 458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  24.94 
 
 		 451 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  25.93 
 
 		 468 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  25.37 
 
 		 467 aa  111  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  25.93 
 
 		 468 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  24.33 
 
 		 466 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  26.4 
 
 		 464 aa  111  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69890  multidrug efflux protein NorA  26.65 
 
 		 488 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  25.93 
 
 		 468 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5517  multidrug efflux protein NorA  25.32 
 
 		 464 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  24.19 
 
 		 461 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  25.93 
 
 		 468 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  25.93 
 
 		 468 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  25.93 
 
 		 468 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  25.93 
 
 		 468 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0115  multidrug resistance protein NorM, putative  24.95 
 
 		 460 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  24.18 
 
 		 457 aa  109  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  27.13 
 
 		 470 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  24.65 
 
 		 445 aa  109  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  26.16 
 
 		 452 aa  109  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  24.66 
 
 		 453 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 452 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1494  MATE efflux family protein  24.51 
 
 		 451 aa  106  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  24.88 
 
 		 465 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  23.16 
 
 		 485 aa  106  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0797  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 463 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2037  MATE efflux family protein  26.87 
 
 		 461 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.01185  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1298  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 467 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  25.42 
 
 		 468 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  26.44 
 
 		 452 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  26.29 
 
 		 454 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  25.18 
 
 		 466 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  24.78 
 
 		 470 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1041  multi anti extrusion protein MatE  26.67 
 
 		 470 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  23.71 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2226  MATE efflux family protein  25.24 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00326481  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  26.44 
 
 		 452 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2144  MATE efflux family protein  25.24 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00844779  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  26.07 
 
 		 452 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  23.11 
 
 		 463 aa  104  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3129  MATE efflux family protein  27.87 
 
 		 452 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  24.84 
 
 		 481 aa  103  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  27.6 
 
 		 447 aa  103  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  23.11 
 
 		 463 aa  103  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2334  MATE efflux family protein  25 
 
 		 459 aa  103  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215455  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>