More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1117 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1117  MATE efflux family protein  100 
 
 		 483 aa  964    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.860788 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  31.08 
 
 		 457 aa  223  7e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  31.77 
 
 		 454 aa  208  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  30.56 
 
 		 450 aa  199  7e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  29.82 
 
 		 451 aa  190  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  30.32 
 
 		 462 aa  189  1e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  28.26 
 
 		 461 aa  177  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  30.25 
 
 		 457 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  28.44 
 
 		 466 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2515  MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1494  MATE efflux family protein  31.82 
 
 		 451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29880  Multidrug efflux protein  32.63 
 
 		 459 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  28.91 
 
 		 456 aa  160  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  29.29 
 
 		 477 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  29.29 
 
 		 477 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2403  MATE efflux family protein  29.98 
 
 		 475 aa  156  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 466 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0162  MATE efflux family protein  28.92 
 
 		 486 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1146  multidrug efflux protein  27.61 
 
 		 461 aa  151  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292586  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  29.71 
 
 		 457 aa  149  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  30.13 
 
 		 457 aa  147  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02236  multidrug efflux protein  27.67 
 
 		 456 aa  147  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04042  multidrug efflux protein  28.26 
 
 		 441 aa  146  7.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  27.46 
 
 		 458 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2376  multidrug efflux protein  26.79 
 
 		 457 aa  143  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  0.0171948 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1534  multidrug efflux protein  26.79 
 
 		 457 aa  143  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00445038  hitchhiker  0.00117159 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1977  MATE efflux family protein  26.79 
 
 		 457 aa  143  8e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000001739  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  27.83 
 
 		 456 aa  143  8e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1743  multidrug efflux protein  26.79 
 
 		 457 aa  143  9e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000609014  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1966  multidrug efflux protein  26.79 
 
 		 457 aa  143  9e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267108 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01634  multidrug efflux protein NorM  26.79 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1861  multidrug efflux protein  26.79 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000216071  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  30.16 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1877  multidrug efflux protein  26.79 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154294  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3598  multidrug efflux protein  29 
 
 		 454 aa  142  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01624  hypothetical protein  26.79 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  30 
 
 		 457 aa  141  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  26.36 
 
 		 460 aa  139  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  26.32 
 
 		 457 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  26.56 
 
 		 457 aa  139  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  26.1 
 
 		 457 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  26.1 
 
 		 457 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  26.1 
 
 		 457 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  27.9 
 
 		 457 aa  136  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  25.96 
 
 		 460 aa  136  7.000000000000001e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0811  multidrug efflux protein  26.97 
 
 		 425 aa  136  7.000000000000001e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  27.9 
 
 		 457 aa  136  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  27.9 
 
 		 457 aa  136  8e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2146  multidrug efflux protein  29.23 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  28.23 
 
 		 451 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  26.58 
 
 		 480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2236  multidrug efflux protein  29.23 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  26.1 
 
 		 457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  28.23 
 
 		 451 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  28.71 
 
 		 453 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  28.65 
 
 		 460 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0494  MATE efflux family protein  30.93 
 
 		 455 aa  133  6.999999999999999e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1356  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 461 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  24.03 
 
 		 457 aa  124  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  24.81 
 
 		 478 aa  124  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2031  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1225  multidrug efflux pump, NorM, MATE family  27.15 
 
 		 455 aa  121  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000329619  normal  0.0233556 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2538  MATE efflux family protein  25.56 
 
 		 454 aa  121  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  27.84 
 
 		 467 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0850  MATE efflux family protein  26.43 
 
 		 439 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.313022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1166  MATE efflux family protein  27 
 
 		 455 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0144354 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1856  multidrug efflux protein  26.26 
 
 		 455 aa  120  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.30191  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2365  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 458 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.469261  normal  0.875331 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1746  MATE efflux family protein  29.25 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325105  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1935  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 460 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.18016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  25.1 
 
 		 465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2039  MATE efflux family protein  26.92 
 
 		 459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017072  normal  0.0193468 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1493  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 458 aa  117  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2025  MATE efflux family protein  26.92 
 
 		 459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2429  multidrug efflux protein  26.13 
 
 		 455 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  28.04 
 
 		 474 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2295  MATE efflux family protein  27.58 
 
 		 459 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2915  multidrug resistance protein NorM  24.74 
 
 		 472 aa  116  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1951  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 459 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000663691  normal  0.290024 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.33 
 
 		 464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2037  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.01185  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  25.33 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  28.93 
 
 		 469 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1773  MATE efflux family protein  28.18 
 
 		 451 aa  115  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  26.43 
 
 		 477 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  28.5 
 
 		 464 aa  114  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0797  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 463 aa  114  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1115  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 448 aa  113  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000487521  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1180  inner membrane transmembrane protein  27.44 
 
 		 448 aa  113  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000781542  normal  0.19952 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2369  MATE family protein  27.42 
 
 		 459 aa  113  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151607  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1023  MATE efflux family protein  28.16 
 
 		 448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00302987  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2633  MATE efflux family protein  28.02 
 
 		 458 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0913646  normal  0.0762555 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2036  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000288761  decreased coverage  0.0000000485587 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1841  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 469 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1438  MATE efflux family protein  27.7 
 
 		 453 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.805906  hitchhiker  0.00501053 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1818  MATE efflux family protein  26.35 
 
 		 459 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.138431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>