More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1967 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1967  MATE efflux family protein  100 
 
 		 488 aa  981    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0778152  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2418  MATE efflux family protein  36.78 
 
 		 471 aa  263  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1841  MATE efflux family protein  35.98 
 
 		 469 aa  259  9e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2664  MATE efflux family protein  34.8 
 
 		 460 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3111  MATE efflux family protein  34.48 
 
 		 489 aa  239  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00116438 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0494  MATE efflux family protein  29.05 
 
 		 455 aa  218  1e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2355  MATE efflux family protein  29.54 
 
 		 449 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0530772  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0413  MATE efflux family protein  29.31 
 
 		 449 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1862  MATE efflux family protein  29.52 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0053  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 451 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.39001  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  27.41 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  27.41 
 
 		 451 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  26.95 
 
 		 453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  23.83 
 
 		 464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  23.62 
 
 		 464 aa  109  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  25.57 
 
 		 452 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  23.32 
 
 		 472 aa  107  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  24.78 
 
 		 456 aa  104  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  24.94 
 
 		 458 aa  99.8  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0033  MATE efflux family protein  25.98 
 
 		 463 aa  98.2  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  26.57 
 
 		 457 aa  98.2  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0252  MATE efflux family protein  27.92 
 
 		 460 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.5 
 
 		 445 aa  97.4  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  25.5 
 
 		 457 aa  97.1  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3365  multi anti extrusion protein MatE  27.46 
 
 		 452 aa  97.1  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0811  multidrug efflux protein  27.42 
 
 		 425 aa  95.9  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  24.07 
 
 		 468 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  24.07 
 
 		 468 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  24.07 
 
 		 468 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  24.07 
 
 		 468 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  24.27 
 
 		 460 aa  95.1  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  24.07 
 
 		 468 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  24.07 
 
 		 468 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  25.18 
 
 		 467 aa  94  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2334  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 459 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  25.43 
 
 		 457 aa  92.8  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  24.17 
 
 		 457 aa  92  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  24.07 
 
 		 464 aa  92  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2144  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 459 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00844779  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  23.82 
 
 		 468 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  24.21 
 
 		 475 aa  90.5  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  24.56 
 
 		 458 aa  90.5  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2226  MATE efflux family protein  26.01 
 
 		 459 aa  90.1  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00326481  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1023  multi anti extrusion protein MatE  29.22 
 
 		 464 aa  89.7  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0255  multidrug efflux protein NorA  26.15 
 
 		 461 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  26.11 
 
 		 457 aa  89  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 466 aa  89  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2180  MATE efflux family protein  26.01 
 
 		 459 aa  88.2  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00809884 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1935  MATE efflux family protein  25.25 
 
 		 460 aa  88.2  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.18016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  24.05 
 
 		 462 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 485 aa  87.8  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  22.44 
 
 		 470 aa  87.8  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2494  MATE efflux family protein  24.87 
 
 		 458 aa  87.8  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121522  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  23.53 
 
 		 466 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1131  MATE efflux family protein  23.23 
 
 		 445 aa  87.4  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.899702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  24.05 
 
 		 462 aa  87  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2021  MATE efflux family protein  26.01 
 
 		 459 aa  87.4  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.068877  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  21.93 
 
 		 463 aa  87  6e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  25.43 
 
 		 458 aa  87  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2295  MATE efflux family protein  26.21 
 
 		 459 aa  86.7  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0073  multidrug efflux protein NorA  25.62 
 
 		 460 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  26.6 
 
 		 457 aa  86.7  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  24.63 
 
 		 477 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  23.1 
 
 		 454 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  23.34 
 
 		 452 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  24.68 
 
 		 498 aa  85.1  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  24.44 
 
 		 538 aa  85.5  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  25 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  24.63 
 
 		 477 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0797  MATE efflux family protein  24.22 
 
 		 463 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  25.12 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  23.75 
 
 		 467 aa  85.1  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  21.92 
 
 		 461 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  25.12 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2212  MATE efflux family protein  24.29 
 
 		 462 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520618  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2025  MATE efflux family protein  25.95 
 
 		 459 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 478 aa  84.3  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  25.12 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  25.12 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  24.88 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  24.24 
 
 		 452 aa  84  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1041  multi anti extrusion protein MatE  24.22 
 
 		 470 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1951  MATE efflux family protein  25.95 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000663691  normal  0.290024 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0115  multidrug resistance protein NorM, putative  25.85 
 
 		 460 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0612  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 462 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 462 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1091  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 462 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427191  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2403  MATE efflux family protein  24.35 
 
 		 475 aa  83.2  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5314  multidrug efflux protein NorA  26.81 
 
 		 462 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133881 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  26.12 
 
 		 480 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2037  MATE efflux family protein  24.82 
 
 		 461 aa  82  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.01185  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1702  MATE efflux family protein  22.59 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.125502  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2031  MATE efflux family protein  24.08 
 
 		 453 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2039  MATE efflux family protein  25.7 
 
 		 459 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017072  normal  0.0193468 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1761  MATE efflux family protein  23.95 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129666  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  24.43 
 
 		 481 aa  81.3  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4308  MATE efflux family protein  24.69 
 
 		 470 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  22.66 
 
 		 454 aa  81.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 525 aa  81.3  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  23.62 
 
 		 457 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>