More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1131 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1131  MATE efflux family protein  100 
 
 		 445 aa  900    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.899702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6233  MATE efflux family protein  32.81 
 
 		 443 aa  238  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  27.15 
 
 		 459 aa  117  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1890  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 442 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2664  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  22.73 
 
 		 453 aa  100  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2418  MATE efflux family protein  26.5 
 
 		 471 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1225  multidrug efflux pump, NorM, MATE family  23.4 
 
 		 455 aa  97.8  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000329619  normal  0.0233556 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  24.12 
 
 		 472 aa  97.8  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1967  MATE efflux family protein  23.23 
 
 		 488 aa  96.7  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0778152  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1166  MATE efflux family protein  23.64 
 
 		 455 aa  96.3  9e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0144354 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  25.57 
 
 		 453 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0162  MATE efflux family protein  25.27 
 
 		 486 aa  94  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  25.36 
 
 		 451 aa  93.6  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  21.11 
 
 		 463 aa  93.2  8e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  25.36 
 
 		 451 aa  93.2  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  23.97 
 
 		 460 aa  90.9  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  24.09 
 
 		 445 aa  90.1  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  22.57 
 
 		 438 aa  88.2  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  27.17 
 
 		 466 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  23.21 
 
 		 450 aa  88.2  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  21.54 
 
 		 464 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2039  MATE efflux family protein  27.99 
 
 		 459 aa  87.8  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017072  normal  0.0193468 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  21.79 
 
 		 464 aa  87  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  21.79 
 
 		 464 aa  87  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  21.79 
 
 		 464 aa  87  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  21.79 
 
 		 464 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  21.28 
 
 		 463 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  22.29 
 
 		 460 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  23.92 
 
 		 475 aa  85.9  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1951  MATE efflux family protein  27.99 
 
 		 459 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000663691  normal  0.290024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2025  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 459 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2295  MATE efflux family protein  26.09 
 
 		 459 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  21.54 
 
 		 464 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  21.79 
 
 		 464 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6399  MATE efflux family protein  23.47 
 
 		 425 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 462 aa  84.7  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  26.04 
 
 		 478 aa  84.7  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  21.28 
 
 		 464 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1656  MATE efflux family protein  22.74 
 
 		 456 aa  84.3  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.737178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1773  MATE efflux family protein  24.82 
 
 		 451 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  25.31 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1746  MATE efflux family protein  24.82 
 
 		 451 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325105  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  25.2 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  21.03 
 
 		 464 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2180  MATE efflux family protein  24.5 
 
 		 459 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00809884 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  23.76 
 
 		 458 aa  83.2  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2334  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 459 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1438  MATE efflux family protein  24.69 
 
 		 453 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.805906  hitchhiker  0.00501053 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  22.4 
 
 		 460 aa  82.4  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  22.2 
 
 		 475 aa  82.4  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2144  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 459 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00844779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2226  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 459 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00326481  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2037  MATE efflux family protein  23.28 
 
 		 461 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.01185  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  24.35 
 
 		 461 aa  82  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  21.79 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2031  MATE efflux family protein  24.57 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2915  multidrug resistance protein NorM  25.43 
 
 		 472 aa  81.3  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  24.33 
 
 		 477 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  23.82 
 
 		 460 aa  80.9  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5136  multi anti extrusion protein MatE  24.32 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114978  normal  0.944792 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  24.45 
 
 		 477 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  22.22 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2021  MATE efflux family protein  25.36 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.068877  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6244  MATE efflux family protein  24.32 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.813306  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1835  MATE efflux family protein  24.32 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2494  MATE efflux family protein  22.22 
 
 		 458 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121522  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  23.78 
 
 		 456 aa  79.7  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  22.8 
 
 		 458 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  23.11 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  22.06 
 
 		 452 aa  79  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  22.3 
 
 		 453 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  21.59 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  23.34 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  20.67 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  20.67 
 
 		 462 aa  77.4  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  20.67 
 
 		 463 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  22.79 
 
 		 457 aa  77.4  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  22.8 
 
 		 464 aa  77  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  22.8 
 
 		 464 aa  77  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  22.79 
 
 		 457 aa  77  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  22.79 
 
 		 457 aa  77  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  21.36 
 
 		 445 aa  76.6  0.0000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  23.97 
 
 		 458 aa  75.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  24.59 
 
 		 468 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  24.75 
 
 		 500 aa  75.5  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  23.45 
 
 		 460 aa  75.1  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0811  multidrug efflux protein  22.38 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  22.72 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28350  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  23.51 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00440405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  20.54 
 
 		 467 aa  74.7  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  22.82 
 
 		 458 aa  74.3  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.63 
 
 		 468 aa  74.3  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0494  MATE efflux family protein  23.74 
 
 		 455 aa  74.3  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  22.17 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2708  MATE efflux family protein  22.31 
 
 		 467 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29880  Multidrug efflux protein  23.99 
 
 		 459 aa  73.9  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 484 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000192336  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  21.04 
 
 		 457 aa  73.9  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  23.38 
 
 		 456 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>