More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3091 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  100 
 
 		 451 aa  857    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  68 
 
 		 449 aa  581  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  53.88 
 
 		 466 aa  425  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  57.4 
 
 		 448 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  51.83 
 
 		 436 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  48.39 
 
 		 442 aa  363  2e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4176  MATE efflux family protein  47.39 
 
 		 460 aa  328  2.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  47.2 
 
 		 446 aa  323  3e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  49.89 
 
 		 459 aa  322  8e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1451  MATE efflux family protein  45.07 
 
 		 465 aa  308  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.815185 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4334  MATE efflux family protein  48.17 
 
 		 437 aa  296  5e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210816  normal  0.91675 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3689  MATE efflux family protein  46.42 
 
 		 470 aa  293  3e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  47.24 
 
 		 441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  45.5 
 
 		 434 aa  282  7.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  44.77 
 
 		 450 aa  282  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2521  MATE efflux family protein  44.84 
 
 		 455 aa  276  8e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  43.65 
 
 		 458 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1233  Na+-driven multidrug efflux pump  39.63 
 
 		 481 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659218  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  41.39 
 
 		 434 aa  249  5e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21540  putative efflux protein, MATE family  44.83 
 
 		 470 aa  248  2e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0074  MATE efflux family protein  35.51 
 
 		 453 aa  228  2e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286401 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  35.45 
 
 		 438 aa  222  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  37.71 
 
 		 434 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  34.4 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  34.99 
 
 		 439 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  38.2 
 
 		 442 aa  182  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1334  MATE efflux family protein  39.06 
 
 		 442 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3961  MATE efflux family protein  40.77 
 
 		 427 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1376  MATE efflux family protein  37.63 
 
 		 442 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2085  MATE efflux family protein  36.42 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0451278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2131  MATE efflux family protein  36.42 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0258983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2068  MATE efflux family protein  36.42 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  32.07 
 
 		 453 aa  159  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12851  DNA-damage-inducible protein F dinF  35.78 
 
 		 436 aa  159  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000020718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2317  MATE efflux family protein  35.11 
 
 		 442 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.816192  normal  0.0947968 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2155  MATE efflux family protein  32.75 
 
 		 467 aa  155  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.430874  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  26.29 
 
 		 445 aa  135  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  30.94 
 
 		 492 aa  128  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  29.37 
 
 		 475 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3527  MATE efflux family protein  28.14 
 
 		 436 aa  126  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  31.64 
 
 		 461 aa  126  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  28.35 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  31.29 
 
 		 445 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  30.27 
 
 		 445 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0110  MATE efflux family protein  26.79 
 
 		 469 aa  120  7e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.372068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31014  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  32.93 
 
 		 560 aa  119  7.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00547148  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0729  MATE efflux family protein  33.67 
 
 		 449 aa  119  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1551  MATE efflux family protein  28.95 
 
 		 440 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.959023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4322  MATE efflux family protein  33.11 
 
 		 455 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4123  MATE efflux family protein  33.11 
 
 		 455 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0144  MATE efflux family protein  33.11 
 
 		 455 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0569  MATE efflux family protein  30.36 
 
 		 445 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  28.98 
 
 		 449 aa  116  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0608  MATE efflux family protein  30.36 
 
 		 445 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0107  MATE efflux family protein  30.29 
 
 		 448 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4191  MATE efflux family protein  33.11 
 
 		 456 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4384  multi anti extrusion protein MatE  31.29 
 
 		 446 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.18 
 
 		 454 aa  114  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4844  DNA-damage-inducible protein F  31.31 
 
 		 446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8205  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0035  DNA-damage-inducible protein F  29.45 
 
 		 516 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4617  DNA-damage-inducible protein F  30.13 
 
 		 455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  28.09 
 
 		 443 aa  111  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1640  DNA-damage-inducible protein F  28.16 
 
 		 436 aa  110  5e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3792  MATE efflux family protein  28.74 
 
 		 456 aa  110  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0324  putative DNA-damage-inducible protein F  27.93 
 
 		 455 aa  110  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.315939  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  30.67 
 
 		 462 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4009  MATE efflux family protein  29.2 
 
 		 443 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2965  MATE efflux family protein  29.8 
 
 		 446 aa  107  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_004310  BR0310  DNA-damage-inducible protein F, putative  27.7 
 
 		 455 aa  107  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0160  MATE efflux family protein  29.74 
 
 		 444 aa  106  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0630  multi anti extrusion protein MatE  30.07 
 
 		 449 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00266  multidrug efflux pump  30.53 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.45 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0896  MATE efflux family protein  28.87 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0613531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  30.05 
 
 		 468 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  30.51 
 
 		 483 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0025  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00700816  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2863  MATE efflux family protein  29.57 
 
 		 445 aa  103  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.277434  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2630  MATE efflux family protein  28.28 
 
 		 472 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3875  MATE efflux family protein  32.13 
 
 		 456 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  29.54 
 
 		 469 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2425  DNA-damage-inducible protein F  28.83 
 
 		 454 aa  102  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0180  MATE efflux family protein  29.36 
 
 		 445 aa  101  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3802  MATE efflux family protein  31.8 
 
 		 455 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0868  MATE efflux family protein  32.98 
 
 		 440 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0983692  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0845  MATE efflux family protein  29.8 
 
 		 439 aa  100  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457545  normal  0.657757 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1840  MATE efflux family protein  29.72 
 
 		 458 aa  100  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308247  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0194  MATE efflux family protein  27.34 
 
 		 446 aa  99.8  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07070  Multidrug efflux protein, MatE family  29.31 
 
 		 453 aa  99.8  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  28 
 
 		 546 aa  99.8  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  28 
 
 		 547 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  28 
 
 		 547 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  28 
 
 		 495 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  28 
 
 		 546 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  28 
 
 		 484 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0069  MATE efflux family protein  28.61 
 
 		 429 aa  98.6  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0160  MATE efflux family protein  30.72 
 
 		 456 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  27.76 
 
 		 484 aa  99  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0753  MATE efflux family protein  29.86 
 
 		 441 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0403  MATE efflux family protein  27.84 
 
 		 451 aa  97.1  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>