More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1415 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1415  MATE efflux family protein  100 
 
 		 466 aa  865    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.167041 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0981  MATE efflux family protein  42.86 
 
 		 456 aa  288  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.730082  normal  0.0880752 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2630  MATE efflux family protein  40.49 
 
 		 472 aa  249  7e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 460 aa  140  7e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  26.04 
 
 		 445 aa  137  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  31.33 
 
 		 460 aa  136  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3712  MATE efflux family protein  28.92 
 
 		 454 aa  134  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139203  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 450 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  28.21 
 
 		 461 aa  127  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  24.66 
 
 		 463 aa  127  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  24.44 
 
 		 463 aa  126  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0522  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.7 
 
 		 458 aa  121  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  25.61 
 
 		 461 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  26.91 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2022  multidrug efflux pump  26.79 
 
 		 459 aa  116  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.54695  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  29.53 
 
 		 468 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  23.66 
 
 		 479 aa  114  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  27.47 
 
 		 461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  24.06 
 
 		 453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  33.22 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 450 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  24.87 
 
 		 484 aa  110  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000192336  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003772  Na+ driven multidrug efflux pump  25.46 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  26.55 
 
 		 467 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  23.57 
 
 		 469 aa  107  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02650  hypothetical protein  26.49 
 
 		 458 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  29.69 
 
 		 445 aa  104  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  22.4 
 
 		 458 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1237  hypothetical protein  25.41 
 
 		 458 aa  102  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0290804  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  22.17 
 
 		 458 aa  101  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1981  MATE efflux family protein  22.25 
 
 		 455 aa  101  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2425  MATE efflux family protein  23.09 
 
 		 461 aa  99.4  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.264518  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.87 
 
 		 475 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  23.28 
 
 		 446 aa  99.8  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  30.18 
 
 		 483 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  28.12 
 
 		 459 aa  98.2  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0994  MATE efflux family protein  24.42 
 
 		 449 aa  97.4  4e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  28.03 
 
 		 498 aa  96.7  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 464 aa  96.7  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  27.42 
 
 		 452 aa  96.3  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 464 aa  96.3  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  24.6 
 
 		 460 aa  95.5  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2475  MATE efflux family protein  23.41 
 
 		 463 aa  92.4  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.211957  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  30.83 
 
 		 449 aa  92.8  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  25.6 
 
 		 464 aa  91.3  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  28.21 
 
 		 456 aa  90.1  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  21.83 
 
 		 438 aa  87.4  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  24.52 
 
 		 467 aa  86.7  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  26.18 
 
 		 446 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  30.06 
 
 		 451 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  30.32 
 
 		 451 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  26.75 
 
 		 461 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0597  hypothetical protein  22.77 
 
 		 444 aa  85.5  0.000000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  28.78 
 
 		 459 aa  84.7  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  31.74 
 
 		 462 aa  84.7  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  30.32 
 
 		 451 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  25.58 
 
 		 450 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1841  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 469 aa  84  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 486 aa  83.6  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  26.09 
 
 		 484 aa  83.6  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 454 aa  83.2  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  24.5 
 
 		 470 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2333  MATE efflux family protein  26.41 
 
 		 456 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  26.14 
 
 		 546 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  26.14 
 
 		 484 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  26.14 
 
 		 484 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0596  hypothetical protein  25.59 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.207285  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  30.7 
 
 		 453 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1116  MATE efflux family protein  21.73 
 
 		 456 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  31.94 
 
 		 470 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 447 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  25.93 
 
 		 547 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  25.71 
 
 		 495 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  25.93 
 
 		 547 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  32.39 
 
 		 459 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  30.41 
 
 		 474 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2205  hypothetical protein  30.54 
 
 		 480 aa  79.7  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 495 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  27.05 
 
 		 447 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  25.42 
 
 		 480 aa  78.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2173  MATE efflux family protein  28.43 
 
 		 481 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.843006 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  25.93 
 
 		 546 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  27.84 
 
 		 461 aa  77  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  29.74 
 
 		 464 aa  77  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  29.79 
 
 		 465 aa  77  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  24.41 
 
 		 469 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1494  MATE efflux family protein  28.37 
 
 		 451 aa  76.6  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  23.71 
 
 		 469 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  23.71 
 
 		 469 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0316  MATE efflux family protein  25.95 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000262265  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6233  MATE efflux family protein  28.79 
 
 		 443 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  28.1 
 
 		 454 aa  74.7  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  25.16 
 
 		 463 aa  74.7  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  22.62 
 
 		 464 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06935  Na+-driven multidrug efflux pump  25.38 
 
 		 446 aa  73.9  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0643  MATE efflux family protein  30.82 
 
 		 477 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  23.8 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>