More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4658 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  100 
 
 		 459 aa  848    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  56.76 
 
 		 442 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  53.14 
 
 		 466 aa  386  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  55.66 
 
 		 436 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  50.34 
 
 		 451 aa  373  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  55.08 
 
 		 446 aa  363  3e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  50.9 
 
 		 449 aa  362  1e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4334  MATE efflux family protein  59.09 
 
 		 437 aa  359  5e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210816  normal  0.91675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1451  MATE efflux family protein  54.02 
 
 		 465 aa  359  6e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.815185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  54.28 
 
 		 448 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4176  MATE efflux family protein  53.23 
 
 		 460 aa  353  4e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  56.88 
 
 		 458 aa  352  1e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  54.65 
 
 		 450 aa  341  1e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3689  MATE efflux family protein  54.34 
 
 		 470 aa  332  9e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  52.91 
 
 		 441 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  47.49 
 
 		 434 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21540  putative efflux protein, MATE family  50.98 
 
 		 470 aa  283  4.0000000000000003e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2521  MATE efflux family protein  46.94 
 
 		 455 aa  272  1e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  41.31 
 
 		 438 aa  266  4e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1233  Na+-driven multidrug efflux pump  41.81 
 
 		 481 aa  262  8.999999999999999e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659218  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  45.56 
 
 		 434 aa  260  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0074  MATE efflux family protein  37.69 
 
 		 453 aa  259  1e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  40.91 
 
 		 434 aa  238  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  40.73 
 
 		 442 aa  219  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2317  MATE efflux family protein  39.73 
 
 		 442 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.816192  normal  0.0947968 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  39.77 
 
 		 439 aa  212  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  39.41 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1376  MATE efflux family protein  44.33 
 
 		 442 aa  203  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2085  MATE efflux family protein  40.32 
 
 		 444 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0451278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2131  MATE efflux family protein  40.32 
 
 		 444 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0258983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2068  MATE efflux family protein  40.32 
 
 		 444 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1334  MATE efflux family protein  44.73 
 
 		 442 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2155  MATE efflux family protein  36.36 
 
 		 467 aa  189  8e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.430874  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12851  DNA-damage-inducible protein F dinF  39.73 
 
 		 436 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000020718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  34.2 
 
 		 453 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3961  MATE efflux family protein  42.79 
 
 		 427 aa  170  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  33.41 
 
 		 492 aa  140  7e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  29.58 
 
 		 445 aa  139  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  30.67 
 
 		 475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  31.57 
 
 		 461 aa  130  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 447 aa  123  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  30.68 
 
 		 445 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0248  DNA-damage-inducible SOS response protein  34.04 
 
 		 439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1640  DNA-damage-inducible protein F  31.4 
 
 		 436 aa  121  3e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  26.07 
 
 		 469 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  29.77 
 
 		 445 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.25 
 
 		 454 aa  117  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0753  MATE efflux family protein  31.55 
 
 		 441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0608  MATE efflux family protein  30.68 
 
 		 445 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  32.17 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  31.1 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0569  MATE efflux family protein  30.23 
 
 		 445 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  31.83 
 
 		 483 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4123  MATE efflux family protein  28.83 
 
 		 455 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0144  MATE efflux family protein  29.13 
 
 		 455 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4191  MATE efflux family protein  28.83 
 
 		 456 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4322  MATE efflux family protein  29.13 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4617  DNA-damage-inducible protein F  26.67 
 
 		 455 aa  111  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3792  MATE efflux family protein  27.33 
 
 		 456 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  28.11 
 
 		 472 aa  107  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4580  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.32 
 
 		 441 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4495  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.32 
 
 		 441 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4430  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.32 
 
 		 441 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0896  MATE efflux family protein  31.38 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0613531 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0729  MATE efflux family protein  30.82 
 
 		 449 aa  105  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3802  MATE efflux family protein  28.08 
 
 		 455 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4001  MATE efflux family protein  27.64 
 
 		 455 aa  104  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  26.22 
 
 		 443 aa  104  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4581  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.89 
 
 		 441 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.941537 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4632  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.89 
 
 		 441 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.251658 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3875  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 456 aa  103  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2863  MATE efflux family protein  29.83 
 
 		 445 aa  103  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.277434  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  23.82 
 
 		 464 aa  102  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4009  MATE efflux family protein  26.91 
 
 		 443 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  23.75 
 
 		 464 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1551  MATE efflux family protein  28.85 
 
 		 440 aa  101  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.959023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  31.83 
 
 		 462 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3527  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 436 aa  99.4  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04000  Na(+) driven multidrug efflux pump  27.96 
 
 		 424 aa  99.4  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0180  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 445 aa  98.6  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  25.67 
 
 		 449 aa  98.6  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4234  MATE efflux family protein  26.13 
 
 		 447 aa  98.6  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0160  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 444 aa  98.6  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  31.5 
 
 		 459 aa  98.2  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3772  MATE efflux family protein  32.71 
 
 		 450 aa  97.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4849  MATE efflux family protein  32.71 
 
 		 450 aa  97.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  23.95 
 
 		 453 aa  97.1  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0069  MATE efflux family protein  28.14 
 
 		 429 aa  95.9  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0310  DNA-damage-inducible protein F, putative  30.28 
 
 		 455 aa  95.5  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0110  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 469 aa  95.1  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.372068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  24.35 
 
 		 475 aa  94.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0630  multi anti extrusion protein MatE  29.61 
 
 		 449 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  35.75 
 
 		 454 aa  94.7  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.05 
 
 		 458 aa  95.1  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0324  putative DNA-damage-inducible protein F  30.28 
 
 		 455 aa  94.7  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.315939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3949  MATE efflux family protein  31.37 
 
 		 441 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  23.83 
 
 		 475 aa  94.4  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0035  DNA-damage-inducible protein F  26.23 
 
 		 516 aa  94.4  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4597  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.1 
 
 		 459 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  28.03 
 
 		 546 aa  94  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>