More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4036 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2085  MATE efflux family protein  85.29 
 
 		 444 aa  679    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0451278  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  100 
 
 		 439 aa  828    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2131  MATE efflux family protein  85.29 
 
 		 444 aa  679    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0258983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2317  MATE efflux family protein  89.59 
 
 		 442 aa  719    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.816192  normal  0.0947968 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2068  MATE efflux family protein  85.29 
 
 		 444 aa  679    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12851  DNA-damage-inducible protein F dinF  72.56 
 
 		 436 aa  509  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000020718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  62.65 
 
 		 441 aa  463  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  62 
 
 		 434 aa  454  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  58.74 
 
 		 438 aa  449  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2155  MATE efflux family protein  59.05 
 
 		 467 aa  427  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.430874  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1334  MATE efflux family protein  53.39 
 
 		 442 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1376  MATE efflux family protein  54.52 
 
 		 442 aa  349  7e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  52.09 
 
 		 442 aa  348  8e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3961  MATE efflux family protein  52.66 
 
 		 427 aa  299  7e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  43.58 
 
 		 434 aa  263  6.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  38.78 
 
 		 436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  36.67 
 
 		 466 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  38.18 
 
 		 448 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  38.44 
 
 		 449 aa  205  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  37.21 
 
 		 442 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  34.99 
 
 		 451 aa  190  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  35.84 
 
 		 434 aa  190  5e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1451  MATE efflux family protein  37.1 
 
 		 465 aa  189  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.815185 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  39.77 
 
 		 459 aa  187  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  36.44 
 
 		 446 aa  183  6e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  35.28 
 
 		 441 aa  177  5e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1233  Na+-driven multidrug efflux pump  35.68 
 
 		 481 aa  172  1e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659218  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  36.87 
 
 		 450 aa  166  8e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21540  putative efflux protein, MATE family  37.8 
 
 		 470 aa  164  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3689  MATE efflux family protein  36.47 
 
 		 470 aa  162  9e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4176  MATE efflux family protein  36.12 
 
 		 460 aa  161  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4334  MATE efflux family protein  38.39 
 
 		 437 aa  161  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210816  normal  0.91675 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0074  MATE efflux family protein  33.07 
 
 		 453 aa  160  6e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  35.23 
 
 		 458 aa  152  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  30.81 
 
 		 453 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2521  MATE efflux family protein  32.18 
 
 		 455 aa  132  9e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  27.27 
 
 		 445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 461 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  28 
 
 		 443 aa  117  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31014  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  29.91 
 
 		 560 aa  111  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00547148  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0110  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 469 aa  109  9.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.372068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  29.66 
 
 		 445 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0061  MATE efflux family protein  31.04 
 
 		 448 aa  104  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.871817  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  27.61 
 
 		 449 aa  103  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00266  multidrug efflux pump  27.21 
 
 		 423 aa  103  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0845  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457545  normal  0.657757 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0069  MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 429 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2494  MATE efflux family protein  26.04 
 
 		 477 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3613  MATE efflux family protein  26.03 
 
 		 477 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.214192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0248  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.59 
 
 		 439 aa  100  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  29.38 
 
 		 445 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0035  DNA-damage-inducible protein F  26.38 
 
 		 516 aa  100  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  26.03 
 
 		 447 aa  98.6  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.25 
 
 		 454 aa  98.2  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3527  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 436 aa  97.8  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  27.09 
 
 		 475 aa  97.8  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0569  MATE efflux family protein  29.45 
 
 		 445 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  29.05 
 
 		 492 aa  96.7  8e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 469 aa  96.3  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1710  MATE efflux family protein  25.3 
 
 		 455 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.841637  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3949  MATE efflux family protein  31 
 
 		 441 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04000  Na(+) driven multidrug efflux pump  27.32 
 
 		 424 aa  95.1  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0608  MATE efflux family protein  29.68 
 
 		 445 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4506  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.77 
 
 		 441 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4284  DNA-damage-inducible SOS response protein  31 
 
 		 459 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4597  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.77 
 
 		 459 aa  94  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03916  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.77 
 
 		 459 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3984  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.77 
 
 		 459 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03876  hypothetical protein  30.77 
 
 		 459 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5525  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.77 
 
 		 441 aa  93.2  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4617  DNA-damage-inducible protein F  27.74 
 
 		 455 aa  92.4  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4009  MATE efflux family protein  29.17 
 
 		 443 aa  92.8  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  26.86 
 
 		 470 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4849  MATE efflux family protein  31.79 
 
 		 450 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3772  MATE efflux family protein  31.79 
 
 		 450 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4553  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.54 
 
 		 459 aa  91.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0160  MATE efflux family protein  29.72 
 
 		 456 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3501  DNA-damage-inducible protein F  28.31 
 
 		 437 aa  90.9  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.27 
 
 		 464 aa  89.7  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.27 
 
 		 464 aa  89  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28350  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  26.83 
 
 		 428 aa  89.7  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00440405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 468 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4234  MATE efflux family protein  26.98 
 
 		 447 aa  89.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 469 aa  89.4  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4495  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.12 
 
 		 441 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4581  DNA-damage-inducible SOS response protein  28.41 
 
 		 441 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.941537 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4632  DNA-damage-inducible SOS response protein  28.41 
 
 		 441 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.251658 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4580  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.12 
 
 		 441 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0630  multi anti extrusion protein MatE  28.57 
 
 		 449 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0896  MATE efflux family protein  28.84 
 
 		 460 aa  89  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0613531 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4430  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.12 
 
 		 441 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  21.04 
 
 		 453 aa  87.8  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  25.98 
 
 		 469 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1292  multi anti extrusion protein MatE  30.17 
 
 		 455 aa  88.2  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.110492 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2425  DNA-damage-inducible protein F  26.08 
 
 		 454 aa  87.8  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  26.22 
 
 		 469 aa  87.8  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  26.22 
 
 		 469 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  26.22 
 
 		 469 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  25.68 
 
 		 469 aa  87  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0729  MATE efflux family protein  28.74 
 
 		 449 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>