232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1710 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1710  MATE efflux family protein  100 
 
 		 455 aa  901    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.841637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0912  MATE efflux family protein  51.5 
 
 		 455 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0886  MATE efflux family protein  51.5 
 
 		 455 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2494  MATE efflux family protein  51.95 
 
 		 477 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3613  MATE efflux family protein  51.72 
 
 		 477 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.214192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0233  MATE efflux family protein  45.73 
 
 		 452 aa  377  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  31.52 
 
 		 449 aa  231  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  31.74 
 
 		 443 aa  227  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2425  DNA-damage-inducible protein F  33.18 
 
 		 454 aa  227  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00266  multidrug efflux pump  31.82 
 
 		 423 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  31.18 
 
 		 447 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.51 
 
 		 454 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3792  MATE efflux family protein  31.84 
 
 		 456 aa  207  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0439  MATE efflux family protein  31.98 
 
 		 438 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0069  MATE efflux family protein  31.31 
 
 		 429 aa  206  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4191  MATE efflux family protein  30.37 
 
 		 456 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3527  MATE efflux family protein  33.65 
 
 		 436 aa  205  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4123  MATE efflux family protein  30.21 
 
 		 455 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0144  MATE efflux family protein  30.41 
 
 		 455 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4322  MATE efflux family protein  30.14 
 
 		 455 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0061  MATE efflux family protein  33.49 
 
 		 448 aa  202  7e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.871817  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0110  MATE efflux family protein  32.53 
 
 		 469 aa  201  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.372068  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4617  DNA-damage-inducible protein F  31.22 
 
 		 455 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2937  MATE efflux family protein  30.98 
 
 		 451 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3501  DNA-damage-inducible protein F  32.13 
 
 		 437 aa  196  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1551  MATE efflux family protein  29.7 
 
 		 440 aa  195  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.959023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2863  MATE efflux family protein  30.91 
 
 		 445 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.277434  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2965  MATE efflux family protein  29.82 
 
 		 446 aa  193  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2844  MATE efflux family protein  30.54 
 
 		 455 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.94035  normal  0.605375 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4009  MATE efflux family protein  31.6 
 
 		 443 aa  192  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0025  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 433 aa  192  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00700816  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0896  MATE efflux family protein  30.02 
 
 		 460 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0613531 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4495  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.84 
 
 		 441 aa  190  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4581  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.6 
 
 		 441 aa  190  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.941537 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4430  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.84 
 
 		 441 aa  190  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4580  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.84 
 
 		 441 aa  190  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4632  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.6 
 
 		 441 aa  190  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.251658 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0035  DNA-damage-inducible protein F  32.16 
 
 		 516 aa  188  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1292  multi anti extrusion protein MatE  30.55 
 
 		 455 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.110492 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4001  MATE efflux family protein  30.63 
 
 		 455 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0107  MATE efflux family protein  30.79 
 
 		 448 aa  188  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0879  MATE efflux family protein  30 
 
 		 444 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0248  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.66 
 
 		 439 aa  187  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0519  MATE efflux family protein  30.89 
 
 		 455 aa  185  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.49931 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2204  multidrug efflux pump, MATE family  29.95 
 
 		 444 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.023203  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3802  MATE efflux family protein  30.93 
 
 		 455 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0845  MATE efflux family protein  31.1 
 
 		 439 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457545  normal  0.657757 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0324  putative DNA-damage-inducible protein F  29.62 
 
 		 455 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.315939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3949  MATE efflux family protein  31.62 
 
 		 441 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3875  MATE efflux family protein  31 
 
 		 456 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1640  DNA-damage-inducible protein F  28.1 
 
 		 436 aa  180  4e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4553  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.62 
 
 		 459 aa  180  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04000  Na(+) driven multidrug efflux pump  30.1 
 
 		 424 aa  180  4.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4597  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.62 
 
 		 459 aa  179  9e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4284  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.62 
 
 		 459 aa  179  9e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03916  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.62 
 
 		 459 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  29.23 
 
 		 445 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03876  hypothetical protein  31.62 
 
 		 459 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3984  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.62 
 
 		 459 aa  179  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_004310  BR0310  DNA-damage-inducible protein F, putative  29.38 
 
 		 455 aa  178  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4506  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.69 
 
 		 441 aa  177  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5525  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.46 
 
 		 441 aa  176  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0160  MATE efflux family protein  28.8 
 
 		 456 aa  176  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4234  MATE efflux family protein  28.89 
 
 		 447 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0868  MATE efflux family protein  31.81 
 
 		 440 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0983692  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0160  MATE efflux family protein  31.86 
 
 		 444 aa  172  9e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0630  multi anti extrusion protein MatE  30.6 
 
 		 449 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0753  MATE efflux family protein  30.59 
 
 		 441 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  29.78 
 
 		 445 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4823  MATE efflux family protein  29.01 
 
 		 444 aa  170  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.841611 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4384  multi anti extrusion protein MatE  28.81 
 
 		 446 aa  170  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4849  MATE efflux family protein  29.41 
 
 		 450 aa  170  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3772  MATE efflux family protein  29.41 
 
 		 450 aa  170  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4844  DNA-damage-inducible protein F  29.43 
 
 		 446 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8205  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0403  MATE efflux family protein  29.48 
 
 		 451 aa  168  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360287  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0283  DNA-damage-inducible F transmembrane protein  29.79 
 
 		 457 aa  167  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00354836  normal  0.290631 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1467  MATE efflux family protein  29.95 
 
 		 441 aa  167  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.375826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0791  MATE efflux family protein  30.11 
 
 		 451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4457  multi anti extrusion protein MatE  28.41 
 
 		 454 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1314  MATE efflux family protein  28.64 
 
 		 459 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1279  DNA-damage-inducible protein F  30.7 
 
 		 472 aa  164  3e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.244391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0180  MATE efflux family protein  30.99 
 
 		 445 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1840  MATE efflux family protein  28.13 
 
 		 458 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308247  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4619  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 452 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1296  MATE efflux family protein  28.87 
 
 		 459 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1507  DNA-damage-inducible protein F  30.37 
 
 		 463 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208132  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1536  DNA-damage-inducible protein  30.37 
 
 		 463 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.65109  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0569  MATE efflux family protein  29.54 
 
 		 445 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1199  MATE efflux family protein  29.98 
 
 		 456 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281549  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0729  MATE efflux family protein  29.43 
 
 		 449 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0608  MATE efflux family protein  30.6 
 
 		 445 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1106  MATE efflux family protein  29.95 
 
 		 472 aa  160  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0833  MATE efflux family protein  28.41 
 
 		 459 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1224  MATE efflux family protein  29.76 
 
 		 456 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0596  DNA-damage-inducible protein  30.14 
 
 		 463 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0194  MATE efflux family protein  30.73 
 
 		 446 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0587  DNA-damage-inducible protein F  28.5 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1707  putative membrane protein (DNA-damage-inducible protein)  30.66 
 
 		 463 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0223  MATE efflux family protein  28.91 
 
 		 448 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0939  MATE efflux family protein  29.61 
 
 		 476 aa  152  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>