246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_23253 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  100 
 
 		 492 aa  959    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31014  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  33.41 
 
 		 560 aa  154  5e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00547148  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  31.45 
 
 		 451 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  30.79 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  29.96 
 
 		 453 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  33.64 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  31.67 
 
 		 434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  32.7 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  28.45 
 
 		 466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  33.25 
 
 		 459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  33.33 
 
 		 441 aa  128  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  32.71 
 
 		 450 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  29.27 
 
 		 449 aa  127  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  32.57 
 
 		 442 aa  127  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  29.95 
 
 		 438 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  30.23 
 
 		 448 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1451  MATE efflux family protein  28.84 
 
 		 465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.815185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  31.83 
 
 		 458 aa  119  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  29.04 
 
 		 436 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35587  hypothetical protein  29.82 
 
 		 561 aa  113  6e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.713211  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  31.33 
 
 		 446 aa  113  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4176  MATE efflux family protein  33.42 
 
 		 460 aa  110  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  29.28 
 
 		 439 aa  110  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0074  MATE efflux family protein  29.06 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286401 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4334  MATE efflux family protein  31.5 
 
 		 437 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210816  normal  0.91675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1334  MATE efflux family protein  30.52 
 
 		 442 aa  106  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  24.66 
 
 		 445 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  26.34 
 
 		 449 aa  104  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1233  Na+-driven multidrug efflux pump  28.71 
 
 		 481 aa  104  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659218  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0069  MATE efflux family protein  28.75 
 
 		 429 aa  104  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1551  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 440 aa  103  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.959023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21540  putative efflux protein, MATE family  33.41 
 
 		 470 aa  103  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  29.11 
 
 		 441 aa  103  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_55128  hypothetical protein  30.66 
 
 		 449 aa  103  8e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  28.08 
 
 		 445 aa  100  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4234  MATE efflux family protein  27.42 
 
 		 447 aa  99.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  26.83 
 
 		 443 aa  99.8  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2155  MATE efflux family protein  28.85 
 
 		 467 aa  96.7  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.430874  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2425  DNA-damage-inducible protein F  27.13 
 
 		 454 aa  96.7  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2863  MATE efflux family protein  27.72 
 
 		 445 aa  96.3  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.277434  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2317  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 442 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.816192  normal  0.0947968 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0753  MATE efflux family protein  26.47 
 
 		 441 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00266  multidrug efflux pump  25.99 
 
 		 423 aa  92.8  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2085  MATE efflux family protein  28.92 
 
 		 444 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0451278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2131  MATE efflux family protein  28.92 
 
 		 444 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0258983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2068  MATE efflux family protein  28.92 
 
 		 444 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0110  MATE efflux family protein  28.75 
 
 		 469 aa  92.4  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.372068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  27.47 
 
 		 445 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0061  MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 448 aa  91.3  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.871817  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1376  MATE efflux family protein  29.15 
 
 		 442 aa  91.3  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3689  MATE efflux family protein  29.95 
 
 		 470 aa  91.3  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0324  putative DNA-damage-inducible protein F  26.22 
 
 		 455 aa  90.9  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.315939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3961  MATE efflux family protein  29.24 
 
 		 427 aa  89.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0160  MATE efflux family protein  26.83 
 
 		 456 aa  89.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1840  MATE efflux family protein  26.21 
 
 		 458 aa  89  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308247  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2965  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 446 aa  88.2  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30385  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  32.99 
 
 		 459 aa  88.2  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0310  DNA-damage-inducible protein F, putative  26 
 
 		 455 aa  87  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  26.19 
 
 		 461 aa  86.7  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2937  MATE efflux family protein  28.18 
 
 		 451 aa  86.3  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44222  enhanced disease susceptibility 5-like protein  26.05 
 
 		 564 aa  85.9  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0403  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 451 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360287  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2521  MATE efflux family protein  28.34 
 
 		 455 aa  85.1  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4844  DNA-damage-inducible protein F  28.63 
 
 		 446 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8205  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4384  multi anti extrusion protein MatE  27.41 
 
 		 446 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4823  MATE efflux family protein  26.86 
 
 		 444 aa  83.6  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.841611 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0845  MATE efflux family protein  26.81 
 
 		 439 aa  83.2  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457545  normal  0.657757 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0569  MATE efflux family protein  27.67 
 
 		 445 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44111  predicted protein  25.71 
 
 		 597 aa  82  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0439  MATE efflux family protein  26.72 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0160  MATE efflux family protein  28.64 
 
 		 444 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87197  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  27.07 
 
 		 490 aa  82  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0608  MATE efflux family protein  28.32 
 
 		 445 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0794  cation efflux pump, DNA-damage-inducible protein  27.6 
 
 		 434 aa  81.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344653 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4009  MATE efflux family protein  30.27 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  26.72 
 
 		 447 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4581  DNA-damage-inducible SOS response protein  28.86 
 
 		 441 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.941537 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0879  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 444 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4632  DNA-damage-inducible SOS response protein  28.86 
 
 		 441 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.251658 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07070  Multidrug efflux protein, MatE family  28.47 
 
 		 453 aa  78.6  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44112  predicted protein  33.87 
 
 		 757 aa  78.2  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0729  MATE efflux family protein  30.3 
 
 		 449 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4495  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.08 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4580  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.08 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4430  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.08 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  27.46 
 
 		 454 aa  77.8  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0868  MATE efflux family protein  26.57 
 
 		 440 aa  76.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0983692  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3527  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 436 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  31.8 
 
 		 451 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44888  hypothetical protein  24.7 
 
 		 555 aa  75.5  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0248  DNA-damage-inducible SOS response protein  27.47 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4191  MATE efflux family protein  27.74 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4619  MATE efflux family protein  27.34 
 
 		 452 aa  74.7  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54598  predicted protein  27.8 
 
 		 530 aa  74.3  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.954409  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1279  DNA-damage-inducible protein F  26.63 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.244391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0791  MATE efflux family protein  26.96 
 
 		 451 aa  73.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1106  MATE efflux family protein  26.63 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4617  DNA-damage-inducible protein F  24.83 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3501  DNA-damage-inducible protein F  28.01 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4322  MATE efflux family protein  30.16 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>