85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_44112 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_44112  predicted protein  100 
 
 		 757 aa  1533    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44111  predicted protein  45.76 
 
 		 597 aa  479  1e-133  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44222  enhanced disease susceptibility 5-like protein  43.19 
 
 		 564 aa  131  5.0000000000000004e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49843  predicted protein  25 
 
 		 675 aa  107  7e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28091  MOP(MATE) family transporter  26.52 
 
 		 504 aa  97.1  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0057098  normal  0.084674 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  32.58 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31926  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  32.78 
 
 		 461 aa  69.3  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1233  Na+-driven multidrug efflux pump  33.17 
 
 		 481 aa  63.9  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659218  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54598  predicted protein  31.28 
 
 		 530 aa  63.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.954409  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3961  MATE efflux family protein  31.43 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  32.27 
 
 		 448 aa  62.4  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  31.75 
 
 		 453 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1451  MATE efflux family protein  32.18 
 
 		 465 aa  60.1  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.815185 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  32 
 
 		 451 aa  59.3  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  31.3 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0069  MATE efflux family protein  31.22 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  31.68 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  31.46 
 
 		 434 aa  57  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  27.75 
 
 		 443 aa  57  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4334  MATE efflux family protein  32.18 
 
 		 437 aa  56.2  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210816  normal  0.91675 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  29.7 
 
 		 446 aa  55.1  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3802  MATE efflux family protein  26.81 
 
 		 455 aa  54.3  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  28.24 
 
 		 483 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  30.77 
 
 		 436 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  26.09 
 
 		 446 aa  53.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3875  MATE efflux family protein  26.38 
 
 		 456 aa  53.5  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  32.43 
 
 		 448 aa  52.8  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0729  MATE efflux family protein  29.95 
 
 		 449 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  31.61 
 
 		 453 aa  52  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4617  DNA-damage-inducible protein F  28.57 
 
 		 455 aa  50.8  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  30.16 
 
 		 457 aa  50.8  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07070  Multidrug efflux protein, MatE family  28.99 
 
 		 453 aa  50.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  27.36 
 
 		 455 aa  50.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2937  MATE efflux family protein  28.44 
 
 		 451 aa  50.4  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0110  MATE efflux family protein  24.32 
 
 		 469 aa  49.7  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.372068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  27.51 
 
 		 445 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3792  MATE efflux family protein  27.81 
 
 		 456 aa  50.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  31.84 
 
 		 434 aa  49.3  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  23.93 
 
 		 449 aa  49.3  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2521  MATE efflux family protein  30.11 
 
 		 455 aa  48.9  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18080  putative efflux protein, MATE family  25.57 
 
 		 468 aa  48.9  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.98273 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  26.98 
 
 		 445 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4123  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 455 aa  48.1  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4322  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 455 aa  48.1  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0144  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 455 aa  48.1  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  30.52 
 
 		 468 aa  48.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31014  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  26.83 
 
 		 560 aa  48.1  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00547148  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  29.91 
 
 		 441 aa  47.8  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0608  MATE efflux family protein  26.48 
 
 		 445 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4191  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 456 aa  47.8  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0569  MATE efflux family protein  26.48 
 
 		 445 aa  47.4  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1507  DNA-damage-inducible protein F  24.79 
 
 		 463 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208132  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  31.52 
 
 		 460 aa  47  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  27.54 
 
 		 466 aa  47  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1707  putative membrane protein (DNA-damage-inducible protein)  25.96 
 
 		 463 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  31.52 
 
 		 460 aa  47  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1640  DNA-damage-inducible protein F  27.31 
 
 		 436 aa  47  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  30 
 
 		 449 aa  46.6  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  30.3 
 
 		 434 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1536  DNA-damage-inducible protein  24.79 
 
 		 463 aa  46.6  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.65109  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  31.96 
 
 		 449 aa  46.2  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2317  MATE efflux family protein  29.07 
 
 		 442 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.816192  normal  0.0947968 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44888  hypothetical protein  27.59 
 
 		 555 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1376  MATE efflux family protein  34.02 
 
 		 442 aa  46.2  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4001  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 455 aa  45.8  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  30.52 
 
 		 461 aa  45.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0534  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 451 aa  45.4  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0596  DNA-damage-inducible protein  24.79 
 
 		 463 aa  45.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  28.89 
 
 		 481 aa  45.4  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  32.32 
 
 		 453 aa  45.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  28.81 
 
 		 462 aa  45.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  31.29 
 
 		 458 aa  45.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  27.62 
 
 		 438 aa  45.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  38.83 
 
 		 443 aa  44.7  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  26.03 
 
 		 525 aa  44.7  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  29.02 
 
 		 439 aa  44.7  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0324  putative DNA-damage-inducible protein F  29.57 
 
 		 455 aa  44.7  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.315939  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 446 aa  44.3  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  24.84 
 
 		 458 aa  44.3  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  31.93 
 
 		 459 aa  44.3  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  30.95 
 
 		 441 aa  44.3  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 452 aa  44.3  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  28.12 
 
 		 467 aa  44.3  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0845  MATE efflux family protein  27.07 
 
 		 439 aa  44.3  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457545  normal  0.657757 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 455 aa  43.9  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>