More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4943 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  100 
 
 		 448 aa  835    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  60.23 
 
 		 449 aa  463  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  57.4 
 
 		 451 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  60.73 
 
 		 436 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  59.21 
 
 		 466 aa  429  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1451  MATE efflux family protein  53.7 
 
 		 465 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.815185 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  53.86 
 
 		 459 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  50.57 
 
 		 442 aa  334  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4176  MATE efflux family protein  51.35 
 
 		 460 aa  323  4e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  51.14 
 
 		 446 aa  320  3e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4334  MATE efflux family protein  53.33 
 
 		 437 aa  317  3e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210816  normal  0.91675 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  51.58 
 
 		 458 aa  305  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  48.38 
 
 		 434 aa  297  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  50.11 
 
 		 441 aa  291  1e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  48.17 
 
 		 450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  42.69 
 
 		 438 aa  284  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3689  MATE efflux family protein  47.45 
 
 		 470 aa  270  4e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  46.59 
 
 		 434 aa  265  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2521  MATE efflux family protein  43.79 
 
 		 455 aa  247  3e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21540  putative efflux protein, MATE family  44.44 
 
 		 470 aa  236  9e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  39.47 
 
 		 434 aa  233  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  40.05 
 
 		 441 aa  228  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  39.09 
 
 		 439 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1233  Na+-driven multidrug efflux pump  37.44 
 
 		 481 aa  223  4e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659218  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  39.91 
 
 		 442 aa  213  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1334  MATE efflux family protein  42.33 
 
 		 442 aa  212  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0074  MATE efflux family protein  33.86 
 
 		 453 aa  212  1e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286401 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1376  MATE efflux family protein  39.69 
 
 		 442 aa  211  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2155  MATE efflux family protein  36.2 
 
 		 467 aa  206  5e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.430874  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2085  MATE efflux family protein  37.5 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0451278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2131  MATE efflux family protein  37.5 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0258983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2068  MATE efflux family protein  37.5 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2317  MATE efflux family protein  36.71 
 
 		 442 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.816192  normal  0.0947968 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3961  MATE efflux family protein  44.31 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12851  DNA-damage-inducible protein F dinF  39.81 
 
 		 436 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000020718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  35.13 
 
 		 453 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  27.66 
 
 		 445 aa  152  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31014  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  31.14 
 
 		 560 aa  141  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00547148  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  33.64 
 
 		 445 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  31.92 
 
 		 461 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  26.51 
 
 		 447 aa  130  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3527  MATE efflux family protein  28.01 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0107  MATE efflux family protein  30.3 
 
 		 448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  31.06 
 
 		 445 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1551  MATE efflux family protein  32.01 
 
 		 440 aa  124  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.959023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0144  MATE efflux family protein  27.91 
 
 		 455 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4123  MATE efflux family protein  27.91 
 
 		 455 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4322  MATE efflux family protein  27.91 
 
 		 455 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0569  MATE efflux family protein  31.61 
 
 		 445 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4191  MATE efflux family protein  27.67 
 
 		 456 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0630  multi anti extrusion protein MatE  31.92 
 
 		 449 aa  121  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0608  MATE efflux family protein  31.39 
 
 		 445 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0729  MATE efflux family protein  32.15 
 
 		 449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  29.95 
 
 		 492 aa  118  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0061  MATE efflux family protein  31.03 
 
 		 448 aa  118  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.871817  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1640  DNA-damage-inducible protein F  29.95 
 
 		 436 aa  117  3.9999999999999997e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  32.14 
 
 		 483 aa  117  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0403  MATE efflux family protein  30.56 
 
 		 451 aa  117  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360287  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3792  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  27.72 
 
 		 475 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.4 
 
 		 454 aa  114  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4619  MATE efflux family protein  33.02 
 
 		 452 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4009  MATE efflux family protein  27.61 
 
 		 443 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  26.38 
 
 		 449 aa  113  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0180  MATE efflux family protein  28.01 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4617  DNA-damage-inducible protein F  26.56 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0025  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00700816  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  25.71 
 
 		 443 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0110  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.372068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0896  MATE efflux family protein  30.88 
 
 		 460 aa  111  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0613531 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0324  putative DNA-damage-inducible protein F  29.93 
 
 		 455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.315939  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0845  MATE efflux family protein  30.39 
 
 		 439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457545  normal  0.657757 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0069  MATE efflux family protein  27.47 
 
 		 429 aa  109  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0160  MATE efflux family protein  27.08 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_55128  hypothetical protein  28.27 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4580  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.8 
 
 		 441 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4430  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.8 
 
 		 441 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4495  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.8 
 
 		 441 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0310  DNA-damage-inducible protein F, putative  29.71 
 
 		 455 aa  107  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00266  multidrug efflux pump  26.89 
 
 		 423 aa  107  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0439  MATE efflux family protein  30.07 
 
 		 438 aa  107  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4001  MATE efflux family protein  25.98 
 
 		 455 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4849  MATE efflux family protein  31.88 
 
 		 450 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4384  multi anti extrusion protein MatE  28.95 
 
 		 446 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07070  Multidrug efflux protein, MatE family  31.63 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2965  MATE efflux family protein  29.57 
 
 		 446 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0753  MATE efflux family protein  30.44 
 
 		 441 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1292  multi anti extrusion protein MatE  31.04 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.110492 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3772  MATE efflux family protein  31.88 
 
 		 450 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4581  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.57 
 
 		 441 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.941537 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4632  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.57 
 
 		 441 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.251658 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25.94 
 
 		 453 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  30.41 
 
 		 468 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  30.91 
 
 		 462 aa  104  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3875  MATE efflux family protein  26.44 
 
 		 456 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1507  DNA-damage-inducible protein F  32.63 
 
 		 463 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208132  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 458 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0791  MATE efflux family protein  32.93 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3802  MATE efflux family protein  26.21 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1536  DNA-damage-inducible protein  32.63 
 
 		 463 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.65109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>