More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2155 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2155  MATE efflux family protein  100 
 
 		 467 aa  873    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.430874  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  59.28 
 
 		 439 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2317  MATE efflux family protein  58.43 
 
 		 442 aa  434  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.816192  normal  0.0947968 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  56.95 
 
 		 441 aa  428  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2085  MATE efflux family protein  58.82 
 
 		 444 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0451278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2131  MATE efflux family protein  58.82 
 
 		 444 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0258983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2068  MATE efflux family protein  58.82 
 
 		 444 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  55.88 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  52.18 
 
 		 438 aa  404  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12851  DNA-damage-inducible protein F dinF  57.91 
 
 		 436 aa  384  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000020718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  52.23 
 
 		 442 aa  355  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1334  MATE efflux family protein  50.67 
 
 		 442 aa  331  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1376  MATE efflux family protein  50.67 
 
 		 442 aa  318  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3961  MATE efflux family protein  49.41 
 
 		 427 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  40.18 
 
 		 434 aa  247  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  35.2 
 
 		 436 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  35.19 
 
 		 466 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  35.68 
 
 		 448 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  36.06 
 
 		 449 aa  196  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  36.11 
 
 		 442 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1451  MATE efflux family protein  35.27 
 
 		 465 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.815185 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  38.5 
 
 		 459 aa  178  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  36.32 
 
 		 441 aa  177  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  35.89 
 
 		 434 aa  176  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  36.19 
 
 		 446 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  33.41 
 
 		 451 aa  170  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3689  MATE efflux family protein  36.66 
 
 		 470 aa  167  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4176  MATE efflux family protein  36.38 
 
 		 460 aa  164  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0074  MATE efflux family protein  30.99 
 
 		 453 aa  157  3e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286401 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1233  Na+-driven multidrug efflux pump  31.91 
 
 		 481 aa  153  5e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659218  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  32.85 
 
 		 458 aa  153  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4334  MATE efflux family protein  36.97 
 
 		 437 aa  150  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210816  normal  0.91675 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21540  putative efflux protein, MATE family  34.36 
 
 		 470 aa  144  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  30.68 
 
 		 453 aa  141  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  31.87 
 
 		 450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2521  MATE efflux family protein  33.93 
 
 		 455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  27.57 
 
 		 445 aa  130  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.92 
 
 		 461 aa  113  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  29.8 
 
 		 445 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.58 
 
 		 454 aa  107  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  26.65 
 
 		 443 aa  103  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  29.93 
 
 		 445 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0061  MATE efflux family protein  28.23 
 
 		 448 aa  100  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.871817  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0110  MATE efflux family protein  25.52 
 
 		 469 aa  99  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.372068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0248  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.42 
 
 		 439 aa  99  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 447 aa  96.7  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31014  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  28.35 
 
 		 560 aa  95.1  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00547148  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  24.66 
 
 		 475 aa  94.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  28.36 
 
 		 461 aa  94.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  26.32 
 
 		 449 aa  94  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4632  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.16 
 
 		 441 aa  93.2  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.251658 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4581  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.16 
 
 		 441 aa  93.2  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.941537 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  29.1 
 
 		 492 aa  92.8  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0069  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 429 aa  92  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0608  MATE efflux family protein  28.83 
 
 		 445 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0753  MATE efflux family protein  26.02 
 
 		 441 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  27.82 
 
 		 461 aa  91.7  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4495  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.93 
 
 		 441 aa  91.3  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4430  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.93 
 
 		 441 aa  91.3  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4580  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.93 
 
 		 441 aa  91.3  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04000  Na(+) driven multidrug efflux pump  26.53 
 
 		 424 aa  90.5  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0569  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4384  multi anti extrusion protein MatE  30.04 
 
 		 446 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1840  MATE efflux family protein  29.95 
 
 		 458 aa  89.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308247  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1640  DNA-damage-inducible protein F  29.14 
 
 		 436 aa  88.2  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4234  MATE efflux family protein  27.07 
 
 		 447 aa  87.8  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  27.33 
 
 		 469 aa  87  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0896  MATE efflux family protein  29.12 
 
 		 460 aa  86.7  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0613531 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4844  DNA-damage-inducible protein F  29.24 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8205  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0439  MATE efflux family protein  26.38 
 
 		 438 aa  85.1  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  25.79 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0630  multi anti extrusion protein MatE  28.76 
 
 		 449 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4506  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.39 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6233  MATE efflux family protein  24.74 
 
 		 443 aa  84.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3501  DNA-damage-inducible protein F  26.85 
 
 		 437 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4597  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.39 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4284  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.61 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03916  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.39 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3984  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.39 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03876  hypothetical protein  30.39 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5525  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.31 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00266  multidrug efflux pump  25.51 
 
 		 423 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2494  MATE efflux family protein  23.76 
 
 		 477 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  23.38 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4553  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.16 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0035  DNA-damage-inducible protein F  25.4 
 
 		 516 aa  80.9  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4009  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 443 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3949  MATE efflux family protein  29.93 
 
 		 441 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0729  MATE efflux family protein  30.22 
 
 		 449 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63730  putative transporter  30.59 
 
 		 453 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0352676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4849  MATE efflux family protein  29.41 
 
 		 450 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3772  MATE efflux family protein  29.41 
 
 		 450 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0160  MATE efflux family protein  27.7 
 
 		 444 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1710  MATE efflux family protein  23.75 
 
 		 455 aa  79.7  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.841637  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  27.05 
 
 		 467 aa  79.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0324  putative DNA-damage-inducible protein F  26.54 
 
 		 455 aa  79.3  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.315939  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0180  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 445 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3613  MATE efflux family protein  23.29 
 
 		 477 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.214192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5540  putative transporter  29.42 
 
 		 453 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1292  multi anti extrusion protein MatE  28.19 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.110492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>