More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2162 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  100 
 
 		 453 aa  888    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  34.12 
 
 		 448 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  33.1 
 
 		 438 aa  170  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  34.34 
 
 		 434 aa  168  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  32.07 
 
 		 451 aa  167  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1451  MATE efflux family protein  34.04 
 
 		 465 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.815185 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  32.34 
 
 		 466 aa  155  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  31.69 
 
 		 449 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0069  MATE efflux family protein  29.58 
 
 		 429 aa  153  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  32.26 
 
 		 436 aa  153  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  33.42 
 
 		 442 aa  152  8.999999999999999e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  35.64 
 
 		 459 aa  149  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  31.41 
 
 		 442 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31014  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  31.07 
 
 		 560 aa  143  6e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00547148  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  32.54 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  32.84 
 
 		 434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3689  MATE efflux family protein  34.23 
 
 		 470 aa  139  7.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  27.68 
 
 		 445 aa  139  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  35.94 
 
 		 450 aa  139  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  30.81 
 
 		 439 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1376  MATE efflux family protein  32.34 
 
 		 442 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  29.18 
 
 		 492 aa  134  3.9999999999999996e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  32.79 
 
 		 458 aa  134  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4334  MATE efflux family protein  35.34 
 
 		 437 aa  130  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210816  normal  0.91675 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  34.1 
 
 		 446 aa  130  7.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  29.74 
 
 		 441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0753  MATE efflux family protein  27.55 
 
 		 441 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0035  DNA-damage-inducible protein F  27.41 
 
 		 516 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  28.5 
 
 		 449 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2085  MATE efflux family protein  30.4 
 
 		 444 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0451278  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2863  MATE efflux family protein  31.96 
 
 		 445 aa  124  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.277434  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2131  MATE efflux family protein  30.4 
 
 		 444 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0258983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2068  MATE efflux family protein  30.4 
 
 		 444 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1334  MATE efflux family protein  31.5 
 
 		 442 aa  123  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  31.08 
 
 		 468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2317  MATE efflux family protein  30.57 
 
 		 442 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.816192  normal  0.0947968 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  28.99 
 
 		 483 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4176  MATE efflux family protein  34.11 
 
 		 460 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2155  MATE efflux family protein  30.42 
 
 		 467 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.430874  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  27.66 
 
 		 443 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3961  MATE efflux family protein  33.22 
 
 		 427 aa  120  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  26.59 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00266  multidrug efflux pump  28.04 
 
 		 423 aa  117  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0160  MATE efflux family protein  29.73 
 
 		 456 aa  117  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0439  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 438 aa  116  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1551  MATE efflux family protein  31.21 
 
 		 440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.959023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  32.29 
 
 		 441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  28.5 
 
 		 469 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21540  putative efflux protein, MATE family  33.64 
 
 		 470 aa  114  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  31.2 
 
 		 460 aa  114  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2965  MATE efflux family protein  28.07 
 
 		 446 aa  113  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0074  MATE efflux family protein  27.16 
 
 		 453 aa  113  7.000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286401 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2521  MATE efflux family protein  30.57 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1233  Na+-driven multidrug efflux pump  28.4 
 
 		 481 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659218  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  28.96 
 
 		 454 aa  111  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0845  MATE efflux family protein  28.61 
 
 		 439 aa  111  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457545  normal  0.657757 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0110  MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 469 aa  111  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.372068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0160  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 444 aa  110  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  29.07 
 
 		 459 aa  109  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0180  MATE efflux family protein  26.28 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4234  MATE efflux family protein  27.38 
 
 		 447 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  28.51 
 
 		 456 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1640  DNA-damage-inducible protein F  27.81 
 
 		 436 aa  107  4e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3802  MATE efflux family protein  26.34 
 
 		 455 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0061  MATE efflux family protein  28.2 
 
 		 448 aa  107  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.871817  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0324  putative DNA-damage-inducible protein F  27.63 
 
 		 455 aa  106  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.315939  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4617  DNA-damage-inducible protein F  24.75 
 
 		 455 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3875  MATE efflux family protein  25.83 
 
 		 456 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4123  MATE efflux family protein  26.18 
 
 		 455 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1279  DNA-damage-inducible protein F  26.13 
 
 		 472 aa  104  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.244391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4322  MATE efflux family protein  26.18 
 
 		 455 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  25.13 
 
 		 447 aa  104  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0144  MATE efflux family protein  26.18 
 
 		 455 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0025  MATE efflux family protein  28.19 
 
 		 433 aa  104  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00700816  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  31.31 
 
 		 458 aa  103  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4191  MATE efflux family protein  26.18 
 
 		 456 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  28.32 
 
 		 445 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_004310  BR0310  DNA-damage-inducible protein F, putative  27.41 
 
 		 455 aa  103  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  29.28 
 
 		 469 aa  103  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2937  MATE efflux family protein  29.32 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12851  DNA-damage-inducible protein F dinF  30.58 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000020718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3501  DNA-damage-inducible protein F  27.2 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2425  DNA-damage-inducible protein F  26.84 
 
 		 454 aa  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4009  MATE efflux family protein  25.76 
 
 		 443 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4001  MATE efflux family protein  25.79 
 
 		 455 aa  102  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4495  DNA-damage-inducible SOS response protein  28.5 
 
 		 441 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4430  DNA-damage-inducible SOS response protein  28.5 
 
 		 441 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1840  MATE efflux family protein  25.31 
 
 		 458 aa  101  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308247  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  35.61 
 
 		 455 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4580  DNA-damage-inducible SOS response protein  28.5 
 
 		 441 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  35.44 
 
 		 455 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.51 
 
 		 475 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0729  MATE efflux family protein  29.55 
 
 		 449 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  34.95 
 
 		 455 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  35.12 
 
 		 455 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4849  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 450 aa  100  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3772  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 450 aa  100  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4632  DNA-damage-inducible SOS response protein  28.57 
 
 		 441 aa  99.8  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.251658 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4581  DNA-damage-inducible SOS response protein  28.57 
 
 		 441 aa  99.8  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.941537 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  35.12 
 
 		 452 aa  97.8  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>