261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1279 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1279  DNA-damage-inducible protein F  100 
 
 		 472 aa  931    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.244391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1106  MATE efflux family protein  93.22 
 
 		 472 aa  825    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0939  MATE efflux family protein  50.94 
 
 		 476 aa  426  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652597 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1551  MATE efflux family protein  32.82 
 
 		 440 aa  210  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.959023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2937  MATE efflux family protein  32.69 
 
 		 451 aa  209  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0439  MATE efflux family protein  33.71 
 
 		 438 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0845  MATE efflux family protein  32.89 
 
 		 439 aa  197  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457545  normal  0.657757 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0896  MATE efflux family protein  30.94 
 
 		 460 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0613531 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4619  MATE efflux family protein  32.72 
 
 		 452 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  30 
 
 		 447 aa  195  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  32.17 
 
 		 445 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  35.29 
 
 		 461 aa  193  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2863  MATE efflux family protein  33.55 
 
 		 445 aa  193  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.277434  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2965  MATE efflux family protein  32.8 
 
 		 446 aa  191  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0868  MATE efflux family protein  34.16 
 
 		 440 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0983692  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0753  MATE efflux family protein  32.43 
 
 		 441 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0069  MATE efflux family protein  30.61 
 
 		 429 aa  187  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3527  MATE efflux family protein  32.52 
 
 		 436 aa  184  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3501  DNA-damage-inducible protein F  31.8 
 
 		 437 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0630  multi anti extrusion protein MatE  31.37 
 
 		 449 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.25 
 
 		 454 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0729  MATE efflux family protein  34.01 
 
 		 449 aa  176  7e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4632  DNA-damage-inducible SOS response protein  32.09 
 
 		 441 aa  176  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.251658 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0223  MATE efflux family protein  32.32 
 
 		 448 aa  176  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4234  MATE efflux family protein  30.65 
 
 		 447 aa  176  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4581  DNA-damage-inducible SOS response protein  32.09 
 
 		 441 aa  176  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.941537 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  27.41 
 
 		 449 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0160  MATE efflux family protein  31.17 
 
 		 456 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4430  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.87 
 
 		 441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4495  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.87 
 
 		 441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4580  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.87 
 
 		 441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0879  MATE efflux family protein  31.59 
 
 		 444 aa  173  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2204  multidrug efflux pump, MATE family  31.24 
 
 		 444 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.023203  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1292  multi anti extrusion protein MatE  32.21 
 
 		 455 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.110492 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0791  MATE efflux family protein  30.96 
 
 		 451 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3772  MATE efflux family protein  32.02 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4849  MATE efflux family protein  32.02 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03916  DNA-damage-inducible SOS response protein  33.7 
 
 		 459 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4597  DNA-damage-inducible SOS response protein  33.7 
 
 		 459 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3984  DNA-damage-inducible SOS response protein  33.7 
 
 		 459 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0110  MATE efflux family protein  29.71 
 
 		 469 aa  172  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.372068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03876  hypothetical protein  33.7 
 
 		 459 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4284  DNA-damage-inducible SOS response protein  33.7 
 
 		 459 aa  171  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5525  DNA-damage-inducible SOS response protein  33.48 
 
 		 441 aa  169  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2844  MATE efflux family protein  31.72 
 
 		 455 aa  169  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.94035  normal  0.605375 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4553  DNA-damage-inducible SOS response protein  33.48 
 
 		 459 aa  169  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4506  DNA-damage-inducible SOS response protein  33.48 
 
 		 441 aa  169  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  31.24 
 
 		 445 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166177 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3949  MATE efflux family protein  32.89 
 
 		 441 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0310  DNA-damage-inducible protein F, putative  27.31 
 
 		 455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4617  DNA-damage-inducible protein F  31.28 
 
 		 455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0324  putative DNA-damage-inducible protein F  27.31 
 
 		 455 aa  168  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.315939  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0035  DNA-damage-inducible protein F  27.55 
 
 		 516 aa  167  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0061  MATE efflux family protein  29.66 
 
 		 448 aa  167  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.871817  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0248  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.65 
 
 		 439 aa  167  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2425  DNA-damage-inducible protein F  29.35 
 
 		 454 aa  167  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4009  MATE efflux family protein  29.11 
 
 		 443 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  29.07 
 
 		 443 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4823  MATE efflux family protein  31.14 
 
 		 444 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.841611 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0194  MATE efflux family protein  31.94 
 
 		 446 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00266  multidrug efflux pump  26.47 
 
 		 423 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3792  MATE efflux family protein  31.71 
 
 		 456 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0107  MATE efflux family protein  30.8 
 
 		 448 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1467  MATE efflux family protein  31.45 
 
 		 441 aa  163  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.375826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2494  MATE efflux family protein  30.25 
 
 		 477 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3613  MATE efflux family protein  30.67 
 
 		 477 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.214192  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0283  DNA-damage-inducible F transmembrane protein  31.45 
 
 		 457 aa  162  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00354836  normal  0.290631 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0160  MATE efflux family protein  29.82 
 
 		 444 aa  161  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0180  MATE efflux family protein  30.09 
 
 		 445 aa  161  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1840  MATE efflux family protein  29.44 
 
 		 458 aa  161  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308247  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63730  putative transporter  31.49 
 
 		 453 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0352676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04000  Na(+) driven multidrug efflux pump  31.52 
 
 		 424 aa  160  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4844  DNA-damage-inducible protein F  31.21 
 
 		 446 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8205  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0025  MATE efflux family protein  28.29 
 
 		 433 aa  160  5e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00700816  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3875  MATE efflux family protein  32.44 
 
 		 456 aa  160  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3802  MATE efflux family protein  31.69 
 
 		 455 aa  159  8e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0519  MATE efflux family protein  31.97 
 
 		 455 aa  159  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.49931 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4384  multi anti extrusion protein MatE  31.71 
 
 		 446 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4191  MATE efflux family protein  30.04 
 
 		 456 aa  158  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0403  MATE efflux family protein  26.78 
 
 		 451 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360287  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0794  cation efflux pump, DNA-damage-inducible protein  30.07 
 
 		 434 aa  156  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344653 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4322  MATE efflux family protein  29.82 
 
 		 455 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4123  MATE efflux family protein  29.82 
 
 		 455 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4001  MATE efflux family protein  31.53 
 
 		 455 aa  155  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0144  MATE efflux family protein  29.6 
 
 		 455 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0912  MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 455 aa  153  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0886  MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 455 aa  153  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5540  putative transporter  31.03 
 
 		 453 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0587  DNA-damage-inducible protein F  31.3 
 
 		 447 aa  151  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0569  MATE efflux family protein  31.65 
 
 		 445 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0608  MATE efflux family protein  31.65 
 
 		 445 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1640  DNA-damage-inducible protein F  27.13 
 
 		 436 aa  143  7e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1507  DNA-damage-inducible protein F  30.43 
 
 		 463 aa  141  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208132  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1536  DNA-damage-inducible protein  30.43 
 
 		 463 aa  141  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.65109  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07070  Multidrug efflux protein, MatE family  32.59 
 
 		 453 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1710  MATE efflux family protein  30.46 
 
 		 455 aa  139  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.841637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0596  DNA-damage-inducible protein  30.21 
 
 		 463 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1994  MATE efflux family protein  31.57 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1199  MATE efflux family protein  30.91 
 
 		 456 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281549  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1707  putative membrane protein (DNA-damage-inducible protein)  29.36 
 
 		 463 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>