199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0794 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0794  cation efflux pump, DNA-damage-inducible protein  100 
 
 
434 aa  828    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344653 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4619  MATE efflux family protein  67.52 
 
 
452 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0868  MATE efflux family protein  65.88 
 
 
440 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0983692  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0791  MATE efflux family protein  67.05 
 
 
451 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0753  MATE efflux family protein  60.37 
 
 
441 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1467  MATE efflux family protein  56.26 
 
 
441 aa  393  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.375826  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  44.5 
 
 
461 aa  306  6e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0439  MATE efflux family protein  45.13 
 
 
438 aa  298  9e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0896  MATE efflux family protein  44.06 
 
 
460 aa  297  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0613531 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0542  MATE efflux family protein  48.22 
 
 
454 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.547089 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0324  putative DNA-damage-inducible protein F  43.1 
 
 
455 aa  283  6.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.315939  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4534  MATE efflux family protein  52.73 
 
 
451 aa  279  7e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637749  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0310  DNA-damage-inducible protein F, putative  42.86 
 
 
455 aa  279  8e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0845  MATE efflux family protein  41.51 
 
 
439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457545  normal  0.657757 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1292  multi anti extrusion protein MatE  43.6 
 
 
455 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.110492 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0110  MATE efflux family protein  38.05 
 
 
469 aa  266  5.999999999999999e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.372068  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1536  DNA-damage-inducible protein  44.87 
 
 
463 aa  266  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.65109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1507  DNA-damage-inducible protein F  44.63 
 
 
463 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208132  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1551  MATE efflux family protein  38.48 
 
 
440 aa  264  3e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.959023  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0403  MATE efflux family protein  39.53 
 
 
451 aa  264  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360287  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2965  MATE efflux family protein  39.06 
 
 
446 aa  263  6.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0160  MATE efflux family protein  41.05 
 
 
456 aa  262  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2844  MATE efflux family protein  43.26 
 
 
455 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.94035  normal  0.605375 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0596  DNA-damage-inducible protein  44.63 
 
 
463 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2425  DNA-damage-inducible protein F  38.26 
 
 
454 aa  260  4e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4849  MATE efflux family protein  42.2 
 
 
450 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2863  MATE efflux family protein  39.71 
 
 
445 aa  258  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.277434  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3772  MATE efflux family protein  42.2 
 
 
450 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0069  MATE efflux family protein  37.5 
 
 
429 aa  258  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0061  MATE efflux family protein  40.92 
 
 
448 aa  256  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.871817  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00266  multidrug efflux pump  37.47 
 
 
423 aa  255  9e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2204  multidrug efflux pump, MATE family  40.57 
 
 
444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.023203  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0879  MATE efflux family protein  40.1 
 
 
444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1840  MATE efflux family protein  40.61 
 
 
458 aa  253  6e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308247  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  38.89 
 
 
445 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3501  DNA-damage-inducible protein F  39.9 
 
 
437 aa  252  7e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0587  DNA-damage-inducible protein F  41.45 
 
 
447 aa  252  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0223  MATE efflux family protein  41.93 
 
 
448 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  36.01 
 
 
449 aa  249  8e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1707  putative membrane protein (DNA-damage-inducible protein)  44.87 
 
 
463 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2755  DNA-damage-inducible protein F  45.45 
 
 
463 aa  248  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0789961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3259  MATE efflux family protein  51.92 
 
 
460 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.113041 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0025  MATE efflux family protein  32.94 
 
 
433 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00700816  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  33.58 
 
 
443 aa  243  6e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0283  DNA-damage-inducible F transmembrane protein  42.86 
 
 
457 aa  241  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00354836  normal  0.290631 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1314  MATE efflux family protein  44.47 
 
 
459 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1296  MATE efflux family protein  44.24 
 
 
459 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0194  MATE efflux family protein  42.72 
 
 
446 aa  240  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  35.28 
 
 
447 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0833  MATE efflux family protein  44.47 
 
 
459 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1199  MATE efflux family protein  43.26 
 
 
456 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281549  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4457  multi anti extrusion protein MatE  44.11 
 
 
454 aa  235  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13482  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  38.63 
 
 
445 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4009  MATE efflux family protein  36.58 
 
 
443 aa  233  6e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3527  MATE efflux family protein  37.23 
 
 
436 aa  229  5e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2937  MATE efflux family protein  38.39 
 
 
451 aa  229  5e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3792  MATE efflux family protein  35.68 
 
 
456 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0180  MATE efflux family protein  37.77 
 
 
445 aa  224  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0630  multi anti extrusion protein MatE  38.82 
 
 
449 aa  224  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  38.37 
 
 
454 aa  224  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4617  DNA-damage-inducible protein F  36.62 
 
 
455 aa  223  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1224  MATE efflux family protein  43.49 
 
 
456 aa  223  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0729  MATE efflux family protein  40.63 
 
 
449 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4322  MATE efflux family protein  37.35 
 
 
455 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4123  MATE efflux family protein  37.35 
 
 
455 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63730  putative transporter  39.85 
 
 
453 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0352676  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0144  MATE efflux family protein  37.59 
 
 
455 aa  220  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0107  MATE efflux family protein  36.66 
 
 
448 aa  218  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4191  MATE efflux family protein  37.35 
 
 
456 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1994  MATE efflux family protein  44.55 
 
 
453 aa  216  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4384  multi anti extrusion protein MatE  37.35 
 
 
446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4844  DNA-damage-inducible protein F  38.22 
 
 
446 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8205  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0035  DNA-damage-inducible protein F  36.13 
 
 
516 aa  213  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04000  Na(+) driven multidrug efflux pump  35.89 
 
 
424 aa  213  7e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0160  MATE efflux family protein  36.59 
 
 
444 aa  210  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0569  MATE efflux family protein  38.39 
 
 
445 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163672  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5540  putative transporter  39.32 
 
 
453 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0608  MATE efflux family protein  38.14 
 
 
445 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07070  Multidrug efflux protein, MatE family  40.54 
 
 
453 aa  205  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3802  MATE efflux family protein  36.41 
 
 
455 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3875  MATE efflux family protein  36.41 
 
 
456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0248  DNA-damage-inducible SOS response protein  37.96 
 
 
439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314498  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4581  DNA-damage-inducible SOS response protein  37.71 
 
 
441 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.941537 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4632  DNA-damage-inducible SOS response protein  37.71 
 
 
441 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.251658 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4823  MATE efflux family protein  37.86 
 
 
444 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.841611 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4580  DNA-damage-inducible SOS response protein  37.47 
 
 
441 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4495  DNA-damage-inducible SOS response protein  37.47 
 
 
441 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4430  DNA-damage-inducible SOS response protein  37.47 
 
 
441 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4234  MATE efflux family protein  31.59 
 
 
447 aa  197  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4001  MATE efflux family protein  35.13 
 
 
455 aa  197  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4506  DNA-damage-inducible SOS response protein  37.86 
 
 
441 aa  193  6e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03916  DNA-damage-inducible SOS response protein  37.62 
 
 
459 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03876  hypothetical protein  37.62 
 
 
459 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0519  MATE efflux family protein  35.61 
 
 
455 aa  190  5.999999999999999e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.49931 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3984  DNA-damage-inducible SOS response protein  37.62 
 
 
459 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4597  DNA-damage-inducible SOS response protein  37.62 
 
 
459 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4284  DNA-damage-inducible SOS response protein  37.62 
 
 
459 aa  189  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4553  DNA-damage-inducible SOS response protein  37.38 
 
 
459 aa  187  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5525  DNA-damage-inducible SOS response protein  37.38 
 
 
441 aa  186  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3949  MATE efflux family protein  37.14 
 
 
441 aa  186  6e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>