More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0110 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0110  MATE efflux family protein  100 
 
 		 469 aa  930    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.372068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  48.78 
 
 		 449 aa  426  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  50.35 
 
 		 443 aa  419  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00266  multidrug efflux pump  49.53 
 
 		 423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  47.95 
 
 		 447 aa  404  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4009  MATE efflux family protein  52.86 
 
 		 443 aa  404  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0107  MATE efflux family protein  51.36 
 
 		 448 aa  398  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4617  DNA-damage-inducible protein F  50.45 
 
 		 455 aa  393  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0180  MATE efflux family protein  52.18 
 
 		 445 aa  391  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2425  DNA-damage-inducible protein F  47.11 
 
 		 454 aa  391  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0160  MATE efflux family protein  51.82 
 
 		 444 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3792  MATE efflux family protein  48.44 
 
 		 456 aa  386  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4322  MATE efflux family protein  48.75 
 
 		 455 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4191  MATE efflux family protein  48.52 
 
 		 456 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4123  MATE efflux family protein  48.75 
 
 		 455 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3501  DNA-damage-inducible protein F  47.32 
 
 		 437 aa  381  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0144  MATE efflux family protein  48.52 
 
 		 455 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3527  MATE efflux family protein  47.82 
 
 		 436 aa  375  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3802  MATE efflux family protein  49.32 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3875  MATE efflux family protein  49.09 
 
 		 456 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4001  MATE efflux family protein  48.63 
 
 		 455 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0061  MATE efflux family protein  42.33 
 
 		 448 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.871817  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0069  MATE efflux family protein  40.38 
 
 		 429 aa  337  3.9999999999999995e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  41.8 
 
 		 445 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4384  multi anti extrusion protein MatE  42.76 
 
 		 446 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04000  Na(+) driven multidrug efflux pump  42.56 
 
 		 424 aa  325  1e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0896  MATE efflux family protein  40.14 
 
 		 460 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0613531 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0729  MATE efflux family protein  43.42 
 
 		 449 aa  323  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4844  DNA-damage-inducible protein F  43.02 
 
 		 446 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8205  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2937  MATE efflux family protein  41.51 
 
 		 451 aa  319  5e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  43.94 
 
 		 454 aa  319  7e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  41.06 
 
 		 445 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2844  MATE efflux family protein  40.97 
 
 		 455 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.94035  normal  0.605375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1292  multi anti extrusion protein MatE  40.8 
 
 		 455 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.110492 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4234  MATE efflux family protein  40.24 
 
 		 447 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0630  multi anti extrusion protein MatE  41.84 
 
 		 449 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0569  MATE efflux family protein  41.57 
 
 		 445 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0845  MATE efflux family protein  37.88 
 
 		 439 aa  298  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457545  normal  0.657757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0608  MATE efflux family protein  41.11 
 
 		 445 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4553  DNA-damage-inducible SOS response protein  43.53 
 
 		 459 aa  295  9e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4581  DNA-damage-inducible SOS response protein  42.5 
 
 		 441 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.941537 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4632  DNA-damage-inducible SOS response protein  42.5 
 
 		 441 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.251658 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4284  DNA-damage-inducible SOS response protein  43.53 
 
 		 459 aa  295  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03916  DNA-damage-inducible SOS response protein  43.3 
 
 		 459 aa  294  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3984  DNA-damage-inducible SOS response protein  43.3 
 
 		 459 aa  294  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4597  DNA-damage-inducible SOS response protein  43.3 
 
 		 459 aa  294  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03876  hypothetical protein  43.3 
 
 		 459 aa  294  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3949  MATE efflux family protein  44.21 
 
 		 441 aa  293  5e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1296  MATE efflux family protein  41.53 
 
 		 459 aa  292  9e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4580  DNA-damage-inducible SOS response protein  42.27 
 
 		 441 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4495  DNA-damage-inducible SOS response protein  42.27 
 
 		 441 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4430  DNA-damage-inducible SOS response protein  42.27 
 
 		 441 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0439  MATE efflux family protein  38.98 
 
 		 438 aa  291  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5525  DNA-damage-inducible SOS response protein  43.98 
 
 		 441 aa  290  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4506  DNA-damage-inducible SOS response protein  43.98 
 
 		 441 aa  290  4e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63730  putative transporter  40.77 
 
 		 453 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0352676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0248  DNA-damage-inducible SOS response protein  41.5 
 
 		 439 aa  286  4e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4457  multi anti extrusion protein MatE  42.55 
 
 		 454 aa  286  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1199  MATE efflux family protein  41.61 
 
 		 456 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281549  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1314  MATE efflux family protein  42.55 
 
 		 459 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1507  DNA-damage-inducible protein F  38.72 
 
 		 463 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208132  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1536  DNA-damage-inducible protein  38.72 
 
 		 463 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.65109  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0833  MATE efflux family protein  42.32 
 
 		 459 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0753  MATE efflux family protein  36.57 
 
 		 441 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1994  MATE efflux family protein  40.77 
 
 		 453 aa  279  9e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2863  MATE efflux family protein  35.35 
 
 		 445 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.277434  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1224  MATE efflux family protein  41.84 
 
 		 456 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0596  DNA-damage-inducible protein  38.5 
 
 		 463 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5540  putative transporter  40.77 
 
 		 453 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0035  DNA-damage-inducible protein F  36.4 
 
 		 516 aa  276  5e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1707  putative membrane protein (DNA-damage-inducible protein)  38.5 
 
 		 463 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1551  MATE efflux family protein  35.12 
 
 		 440 aa  272  8.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.959023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07070  Multidrug efflux protein, MatE family  40.51 
 
 		 453 aa  271  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0324  putative DNA-damage-inducible protein F  36.21 
 
 		 455 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.315939  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2204  multidrug efflux pump, MATE family  35.88 
 
 		 444 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.023203  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0879  MATE efflux family protein  35.65 
 
 		 444 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_004310  BR0310  DNA-damage-inducible protein F, putative  35.98 
 
 		 455 aa  267  4e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0283  DNA-damage-inducible F transmembrane protein  37.53 
 
 		 457 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00354836  normal  0.290631 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4619  MATE efflux family protein  38.42 
 
 		 452 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3772  MATE efflux family protein  37.53 
 
 		 450 aa  264  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4849  MATE efflux family protein  37.53 
 
 		 450 aa  264  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0794  cation efflux pump, DNA-damage-inducible protein  38.05 
 
 		 434 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0223  MATE efflux family protein  37.3 
 
 		 448 aa  259  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0868  MATE efflux family protein  39.05 
 
 		 440 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0983692  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2755  DNA-damage-inducible protein F  40 
 
 		 463 aa  257  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0789961  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2965  MATE efflux family protein  34.54 
 
 		 446 aa  256  7e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0403  MATE efflux family protein  35.98 
 
 		 451 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360287  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0025  MATE efflux family protein  33.41 
 
 		 433 aa  248  2e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00700816  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0160  MATE efflux family protein  36.19 
 
 		 456 aa  243  6e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0791  MATE efflux family protein  37.38 
 
 		 451 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0587  DNA-damage-inducible protein F  35.32 
 
 		 447 aa  240  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1467  MATE efflux family protein  35.24 
 
 		 441 aa  239  6.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.375826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0194  MATE efflux family protein  37.5 
 
 		 446 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  34.23 
 
 		 461 aa  233  6e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_002950  PG1640  DNA-damage-inducible protein F  32.05 
 
 		 436 aa  232  1e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1840  MATE efflux family protein  32.12 
 
 		 458 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308247  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1710  MATE efflux family protein  32.53 
 
 		 455 aa  197  4.0000000000000005e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.841637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4823  MATE efflux family protein  33.89 
 
 		 444 aa  194  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.841611 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0519  MATE efflux family protein  30.31 
 
 		 455 aa  190  4e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.49931 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2494  MATE efflux family protein  31.24 
 
 		 477 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>