More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2521 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2521  MATE efflux family protein  100 
 
 		 455 aa  856    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  60.32 
 
 		 446 aa  439  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4176  MATE efflux family protein  56.51 
 
 		 460 aa  420  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3689  MATE efflux family protein  56.88 
 
 		 470 aa  388  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  56.56 
 
 		 441 aa  383  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  50 
 
 		 442 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4334  MATE efflux family protein  52.78 
 
 		 437 aa  336  5.999999999999999e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210816  normal  0.91675 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0074  MATE efflux family protein  43.41 
 
 		 453 aa  324  2e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286401 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1233  Na+-driven multidrug efflux pump  43.61 
 
 		 481 aa  320  3e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659218  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  49.07 
 
 		 458 aa  310  5e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  47.7 
 
 		 434 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  45.43 
 
 		 451 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21540  putative efflux protein, MATE family  47.78 
 
 		 470 aa  297  3e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1451  MATE efflux family protein  44.91 
 
 		 465 aa  292  7e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.815185 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  43.49 
 
 		 449 aa  291  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  46.44 
 
 		 450 aa  287  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  43.08 
 
 		 466 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  46.03 
 
 		 459 aa  279  7e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  44.44 
 
 		 448 aa  258  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  41.81 
 
 		 436 aa  257  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  37.85 
 
 		 434 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  36.68 
 
 		 438 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1376  MATE efflux family protein  34.93 
 
 		 442 aa  178  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  34.83 
 
 		 441 aa  176  8e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  37.2 
 
 		 442 aa  173  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  34.12 
 
 		 434 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  32.87 
 
 		 439 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1334  MATE efflux family protein  36.14 
 
 		 442 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2085  MATE efflux family protein  33.26 
 
 		 444 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0451278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2131  MATE efflux family protein  33.26 
 
 		 444 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0258983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2068  MATE efflux family protein  33.26 
 
 		 444 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2317  MATE efflux family protein  33.56 
 
 		 442 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.816192  normal  0.0947968 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2155  MATE efflux family protein  32.59 
 
 		 467 aa  144  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.430874  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12851  DNA-damage-inducible protein F dinF  33.79 
 
 		 436 aa  134  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000020718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  30.57 
 
 		 453 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  26.34 
 
 		 445 aa  127  6e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3961  MATE efflux family protein  37.46 
 
 		 427 aa  126  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0753  MATE efflux family protein  29.81 
 
 		 441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  28.94 
 
 		 461 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0608  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 445 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  25.16 
 
 		 475 aa  113  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0569  MATE efflux family protein  28 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 445 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  27.75 
 
 		 447 aa  111  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  23.95 
 
 		 469 aa  104  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2425  DNA-damage-inducible protein F  28.34 
 
 		 454 aa  103  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  27.02 
 
 		 449 aa  102  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1840  MATE efflux family protein  29.48 
 
 		 458 aa  101  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308247  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  28.12 
 
 		 492 aa  101  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  28.13 
 
 		 458 aa  100  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  27.07 
 
 		 461 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0160  MATE efflux family protein  28.92 
 
 		 456 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31014  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  28.91 
 
 		 560 aa  97.4  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00547148  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0110  MATE efflux family protein  25.77 
 
 		 469 aa  95.5  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.372068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  26.64 
 
 		 443 aa  95.5  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.55 
 
 		 454 aa  94  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35587  hypothetical protein  26.3 
 
 		 561 aa  94.4  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.713211  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0729  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 449 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4234  MATE efflux family protein  25.07 
 
 		 447 aa  92.8  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3527  MATE efflux family protein  26.41 
 
 		 436 aa  91.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  23.32 
 
 		 453 aa  89.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  22.53 
 
 		 464 aa  88.2  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  27.42 
 
 		 484 aa  87  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  26.13 
 
 		 495 aa  86.7  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  22.89 
 
 		 464 aa  86.3  9e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  27.39 
 
 		 547 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  27.19 
 
 		 546 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  27.39 
 
 		 547 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 495 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0324  putative DNA-damage-inducible protein F  27.05 
 
 		 455 aa  85.5  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.315939  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00266  multidrug efflux pump  28.53 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  27.19 
 
 		 546 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  22.48 
 
 		 443 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0794  cation efflux pump, DNA-damage-inducible protein  29.55 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344653 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  27.19 
 
 		 484 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 450 aa  83.6  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4322  MATE efflux family protein  28.31 
 
 		 455 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0144  MATE efflux family protein  28.31 
 
 		 455 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0310  DNA-damage-inducible protein F, putative  26.16 
 
 		 455 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 475 aa  81.6  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1106  MATE efflux family protein  28.04 
 
 		 472 aa  82  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0403  MATE efflux family protein  25.28 
 
 		 451 aa  82.4  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360287  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3501  DNA-damage-inducible protein F  28.34 
 
 		 437 aa  82  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4123  MATE efflux family protein  28.31 
 
 		 455 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4191  MATE efflux family protein  28.31 
 
 		 456 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4384  multi anti extrusion protein MatE  28.07 
 
 		 446 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  26.47 
 
 		 483 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  25.43 
 
 		 472 aa  79.3  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0035  DNA-damage-inducible protein F  26.92 
 
 		 516 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  26.61 
 
 		 453 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 468 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  24.15 
 
 		 475 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  23.39 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0069  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  26.06 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3585  MATE efflux family protein  28.3 
 
 		 472 aa  77.8  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4619  MATE efflux family protein  29.17 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  26.01 
 
 		 474 aa  78.2  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>