More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1376 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1376  MATE efflux family protein  100 
 
 		 442 aa  811    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1334  MATE efflux family protein  93.21 
 
 		 442 aa  695    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  65.97 
 
 		 442 aa  471  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  57.51 
 
 		 438 aa  427  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  60.47 
 
 		 434 aa  424  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  54.52 
 
 		 439 aa  386  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2085  MATE efflux family protein  55.3 
 
 		 444 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0451278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2131  MATE efflux family protein  55.3 
 
 		 444 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0258983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2317  MATE efflux family protein  56.35 
 
 		 442 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.816192  normal  0.0947968 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2068  MATE efflux family protein  55.3 
 
 		 444 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  54.31 
 
 		 441 aa  372  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2155  MATE efflux family protein  50.67 
 
 		 467 aa  346  4e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.430874  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12851  DNA-damage-inducible protein F dinF  54.48 
 
 		 436 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000020718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3961  MATE efflux family protein  56.3 
 
 		 427 aa  302  8.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  44.27 
 
 		 434 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  41.31 
 
 		 448 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1451  MATE efflux family protein  40.53 
 
 		 465 aa  219  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.815185 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  39.43 
 
 		 466 aa  216  9e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  44.42 
 
 		 459 aa  211  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  38.85 
 
 		 436 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  39.01 
 
 		 449 aa  206  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  37 
 
 		 451 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4176  MATE efflux family protein  41.98 
 
 		 460 aa  196  8.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  39.02 
 
 		 442 aa  192  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  38.95 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  37.64 
 
 		 441 aa  187  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1233  Na+-driven multidrug efflux pump  37.89 
 
 		 481 aa  186  5e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659218  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4334  MATE efflux family protein  42.4 
 
 		 437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210816  normal  0.91675 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3689  MATE efflux family protein  41.24 
 
 		 470 aa  182  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  37.93 
 
 		 434 aa  181  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0074  MATE efflux family protein  32.39 
 
 		 453 aa  162  1e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286401 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2521  MATE efflux family protein  34.14 
 
 		 455 aa  160  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  38.08 
 
 		 458 aa  159  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  32.5 
 
 		 453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  37.97 
 
 		 450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21540  putative efflux protein, MATE family  38.63 
 
 		 470 aa  140  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  29.1 
 
 		 443 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4009  MATE efflux family protein  32.32 
 
 		 443 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0069  MATE efflux family protein  29.3 
 
 		 429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  29.26 
 
 		 447 aa  130  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  27 
 
 		 445 aa  129  9.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3527  MATE efflux family protein  29.7 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  33.64 
 
 		 445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4617  DNA-damage-inducible protein F  29.28 
 
 		 455 aa  127  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  28.51 
 
 		 449 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  32.27 
 
 		 454 aa  127  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3501  DNA-damage-inducible protein F  30.54 
 
 		 437 aa  127  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0180  MATE efflux family protein  31.84 
 
 		 445 aa  126  9e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0845  MATE efflux family protein  32.81 
 
 		 439 aa  124  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457545  normal  0.657757 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3792  MATE efflux family protein  29.56 
 
 		 456 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2863  MATE efflux family protein  33.1 
 
 		 445 aa  122  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.277434  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00266  multidrug efflux pump  29.22 
 
 		 423 aa  120  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0144  MATE efflux family protein  29.72 
 
 		 455 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4322  MATE efflux family protein  29.86 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0160  MATE efflux family protein  31.29 
 
 		 444 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3802  MATE efflux family protein  29.32 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4123  MATE efflux family protein  29.86 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0630  multi anti extrusion protein MatE  32.71 
 
 		 449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0753  MATE efflux family protein  30.57 
 
 		 441 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4191  MATE efflux family protein  29.86 
 
 		 456 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4844  DNA-damage-inducible protein F  31.87 
 
 		 446 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8205  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3875  MATE efflux family protein  29.1 
 
 		 456 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0248  DNA-damage-inducible SOS response protein  33.18 
 
 		 439 aa  116  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1551  MATE efflux family protein  30 
 
 		 440 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.959023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2204  multidrug efflux pump, MATE family  32.92 
 
 		 444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.023203  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2425  DNA-damage-inducible protein F  28.4 
 
 		 454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4001  MATE efflux family protein  28.88 
 
 		 455 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0107  MATE efflux family protein  29.31 
 
 		 448 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  33.33 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0110  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.372068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0879  MATE efflux family protein  32.28 
 
 		 444 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0896  MATE efflux family protein  30.4 
 
 		 460 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0613531 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4384  multi anti extrusion protein MatE  31.95 
 
 		 446 aa  112  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0035  DNA-damage-inducible protein F  27.78 
 
 		 516 aa  113  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2965  MATE efflux family protein  30.09 
 
 		 446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0729  MATE efflux family protein  32.4 
 
 		 449 aa  111  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  29.78 
 
 		 492 aa  111  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  30.63 
 
 		 461 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04000  Na(+) driven multidrug efflux pump  29.17 
 
 		 424 aa  110  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  31.14 
 
 		 461 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4581  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.46 
 
 		 441 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.941537 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0160  MATE efflux family protein  29.37 
 
 		 456 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4632  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.46 
 
 		 441 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.251658 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07070  Multidrug efflux protein, MatE family  32.73 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0061  MATE efflux family protein  30.64 
 
 		 448 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.871817  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0025  MATE efflux family protein  24.15 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00700816  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4430  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.31 
 
 		 441 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4580  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.31 
 
 		 441 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4495  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.31 
 
 		 441 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63730  putative transporter  32.86 
 
 		 453 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0352676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0439  MATE efflux family protein  29.52 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4234  MATE efflux family protein  28 
 
 		 447 aa  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0569  MATE efflux family protein  32.33 
 
 		 445 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0608  MATE efflux family protein  32.33 
 
 		 445 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0403  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360287  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1840  MATE efflux family protein  30.49 
 
 		 458 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308247  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0324  putative DNA-damage-inducible protein F  27.98 
 
 		 455 aa  100  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.315939  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5540  putative transporter  32.71 
 
 		 453 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4506  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.47 
 
 		 441 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2937  MATE efflux family protein  31.86 
 
 		 451 aa  98.6  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>