More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3880 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  100 
 
 		 450 aa  848    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  79.33 
 
 		 458 aa  599  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21540  putative efflux protein, MATE family  61.9 
 
 		 470 aa  417  9.999999999999999e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  55.45 
 
 		 442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  52.5 
 
 		 466 aa  372  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  53.01 
 
 		 446 aa  365  1e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4176  MATE efflux family protein  55.26 
 
 		 460 aa  360  3e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3689  MATE efflux family protein  55.53 
 
 		 470 aa  344  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  54.2 
 
 		 459 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  45.78 
 
 		 451 aa  332  1e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  50.58 
 
 		 434 aa  332  1e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  49.44 
 
 		 436 aa  323  4e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  54.52 
 
 		 441 aa  322  9.999999999999999e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  44.1 
 
 		 449 aa  310  5e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  49.77 
 
 		 448 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1451  MATE efflux family protein  47.88 
 
 		 465 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.815185 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4334  MATE efflux family protein  52.9 
 
 		 437 aa  300  5e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210816  normal  0.91675 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2521  MATE efflux family protein  46.44 
 
 		 455 aa  291  2e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0074  MATE efflux family protein  39.73 
 
 		 453 aa  273  7e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286401 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1233  Na+-driven multidrug efflux pump  40.99 
 
 		 481 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659218  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  38.95 
 
 		 438 aa  240  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  44.71 
 
 		 434 aa  232  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  38.24 
 
 		 434 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  37.81 
 
 		 439 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2085  MATE efflux family protein  37.69 
 
 		 444 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0451278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2131  MATE efflux family protein  37.69 
 
 		 444 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0258983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2068  MATE efflux family protein  37.69 
 
 		 444 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  37.5 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  39.68 
 
 		 442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2317  MATE efflux family protein  36.46 
 
 		 442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.816192  normal  0.0947968 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12851  DNA-damage-inducible protein F dinF  37.78 
 
 		 436 aa  172  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000020718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  35.32 
 
 		 453 aa  167  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3961  MATE efflux family protein  39.28 
 
 		 427 aa  166  8e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1376  MATE efflux family protein  39.69 
 
 		 442 aa  159  8e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2155  MATE efflux family protein  32.55 
 
 		 467 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.430874  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1334  MATE efflux family protein  39.74 
 
 		 442 aa  152  8.999999999999999e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  32.79 
 
 		 492 aa  144  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1551  MATE efflux family protein  29.98 
 
 		 440 aa  129  7.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.959023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  33.41 
 
 		 445 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  30.85 
 
 		 468 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2863  MATE efflux family protein  29.93 
 
 		 445 aa  123  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.277434  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  29.18 
 
 		 447 aa  122  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 469 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  27.78 
 
 		 475 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  28.12 
 
 		 445 aa  120  4.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  33.11 
 
 		 445 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  31.22 
 
 		 483 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0569  MATE efflux family protein  33.56 
 
 		 445 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0608  MATE efflux family protein  32.88 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25.72 
 
 		 458 aa  113  8.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  27.99 
 
 		 449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0845  MATE efflux family protein  31.4 
 
 		 439 aa  111  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457545  normal  0.657757 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  27.39 
 
 		 461 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  30.37 
 
 		 469 aa  110  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4384  multi anti extrusion protein MatE  31.92 
 
 		 446 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3527  MATE efflux family protein  26.59 
 
 		 436 aa  108  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1640  DNA-damage-inducible protein F  30.59 
 
 		 436 aa  107  4e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  26.98 
 
 		 443 aa  107  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  32.37 
 
 		 459 aa  107  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31014  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  31.47 
 
 		 560 aa  105  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00547148  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  30.47 
 
 		 462 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.9 
 
 		 464 aa  104  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00266  multidrug efflux pump  28.54 
 
 		 423 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.98 
 
 		 464 aa  103  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_55128  hypothetical protein  29.27 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0879  MATE efflux family protein  31.77 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0630  multi anti extrusion protein MatE  31.79 
 
 		 449 aa  101  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3792  MATE efflux family protein  28.39 
 
 		 456 aa  99.8  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4844  DNA-damage-inducible protein F  30.36 
 
 		 446 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8205  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2204  multidrug efflux pump, MATE family  32.09 
 
 		 444 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.023203  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2965  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 446 aa  98.6  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  27.85 
 
 		 484 aa  97.8  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4322  MATE efflux family protein  29.12 
 
 		 455 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4123  MATE efflux family protein  29.12 
 
 		 455 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0144  MATE efflux family protein  29.12 
 
 		 455 aa  97.8  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4191  MATE efflux family protein  29.12 
 
 		 456 aa  97.1  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  24.26 
 
 		 455 aa  95.9  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  28.84 
 
 		 454 aa  96.3  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  23.12 
 
 		 453 aa  95.9  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 460 aa  95.5  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  27.82 
 
 		 472 aa  94.4  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 475 aa  93.6  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  26.18 
 
 		 475 aa  93.6  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  29.4 
 
 		 461 aa  92.8  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  26.55 
 
 		 464 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  24.05 
 
 		 453 aa  90.1  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  23.56 
 
 		 468 aa  89.7  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0729  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 449 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  28.05 
 
 		 456 aa  89.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  24.11 
 
 		 462 aa  89.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2425  DNA-damage-inducible protein F  29.43 
 
 		 454 aa  89.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4619  MATE efflux family protein  29.08 
 
 		 452 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  25.41 
 
 		 470 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  27.34 
 
 		 546 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0061  MATE efflux family protein  29.11 
 
 		 448 aa  88.2  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.871817  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0248  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.93 
 
 		 439 aa  89  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  27.78 
 
 		 480 aa  88.2  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0160  MATE efflux family protein  29.98 
 
 		 456 aa  88.2  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  28.41 
 
 		 459 aa  87.8  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0868  MATE efflux family protein  29.01 
 
 		 440 aa  87.4  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0983692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>