More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37760 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  100 
 
 		 446 aa  830    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4176  MATE efflux family protein  78.82 
 
 		 460 aa  592  1e-168  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  75.06 
 
 		 441 aa  511  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3689  MATE efflux family protein  71.13 
 
 		 470 aa  492  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  59.22 
 
 		 442 aa  442  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2521  MATE efflux family protein  60.32 
 
 		 455 aa  416  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4334  MATE efflux family protein  58.68 
 
 		 437 aa  365  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210816  normal  0.91675 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  50.23 
 
 		 449 aa  360  3e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  47.2 
 
 		 451 aa  347  2e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  54.07 
 
 		 458 aa  345  1e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  48.17 
 
 		 466 aa  341  1e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1233  Na+-driven multidrug efflux pump  46.73 
 
 		 481 aa  335  7e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659218  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0074  MATE efflux family protein  43.28 
 
 		 453 aa  332  8e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  49.66 
 
 		 436 aa  330  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  53.01 
 
 		 450 aa  329  7e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  55.08 
 
 		 459 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  48.5 
 
 		 434 aa  322  7e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1451  MATE efflux family protein  50.81 
 
 		 465 aa  320  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.815185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  51.14 
 
 		 448 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21540  putative efflux protein, MATE family  52.1 
 
 		 470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  38.5 
 
 		 438 aa  213  5.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  40.78 
 
 		 434 aa  210  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  40.64 
 
 		 442 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  36.44 
 
 		 439 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1376  MATE efflux family protein  39.4 
 
 		 442 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2317  MATE efflux family protein  35.48 
 
 		 442 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.816192  normal  0.0947968 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  36.61 
 
 		 434 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  36.73 
 
 		 441 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1334  MATE efflux family protein  39.49 
 
 		 442 aa  180  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2085  MATE efflux family protein  34.56 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0451278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2131  MATE efflux family protein  34.56 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0258983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2068  MATE efflux family protein  34.56 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2155  MATE efflux family protein  34.61 
 
 		 467 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.430874  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12851  DNA-damage-inducible protein F dinF  37.99 
 
 		 436 aa  157  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000020718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  34.1 
 
 		 453 aa  144  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  32.29 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  31.69 
 
 		 445 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0608  MATE efflux family protein  31.59 
 
 		 445 aa  127  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0569  MATE efflux family protein  31.59 
 
 		 445 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3961  MATE efflux family protein  37.74 
 
 		 427 aa  123  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  31.08 
 
 		 492 aa  121  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  26.7 
 
 		 445 aa  119  9e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  30.07 
 
 		 461 aa  116  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31014  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  31.38 
 
 		 560 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00547148  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4617  DNA-damage-inducible protein F  29.89 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  27.25 
 
 		 449 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0729  MATE efflux family protein  31.67 
 
 		 449 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4234  MATE efflux family protein  27.92 
 
 		 447 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.95 
 
 		 461 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3792  MATE efflux family protein  30.72 
 
 		 456 aa  106  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4322  MATE efflux family protein  31.12 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3875  MATE efflux family protein  29.02 
 
 		 456 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4123  MATE efflux family protein  31.12 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0144  MATE efflux family protein  31.12 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3802  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 455 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  26.33 
 
 		 447 aa  104  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0160  MATE efflux family protein  32.58 
 
 		 456 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 475 aa  103  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4191  MATE efflux family protein  30.89 
 
 		 456 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3527  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 436 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00266  multidrug efflux pump  27.11 
 
 		 423 aa  101  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0630  multi anti extrusion protein MatE  30.15 
 
 		 449 aa  101  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0753  MATE efflux family protein  31.41 
 
 		 441 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.58 
 
 		 454 aa  101  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4844  DNA-damage-inducible protein F  32.09 
 
 		 446 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8205  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  26.92 
 
 		 443 aa  99.8  8e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0160  MATE efflux family protein  30.16 
 
 		 444 aa  99.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  29.09 
 
 		 459 aa  98.2  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4384  multi anti extrusion protein MatE  31.03 
 
 		 446 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0107  MATE efflux family protein  29 
 
 		 448 aa  97.1  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4009  MATE efflux family protein  29.77 
 
 		 443 aa  96.7  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1551  MATE efflux family protein  29.75 
 
 		 440 aa  96.7  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.959023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1279  DNA-damage-inducible protein F  28.22 
 
 		 472 aa  96.3  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.244391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35587  hypothetical protein  27.75 
 
 		 561 aa  95.1  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.713211  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0439  MATE efflux family protein  28.31 
 
 		 438 aa  95.1  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0035  DNA-damage-inducible protein F  27.5 
 
 		 516 aa  95.1  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4001  MATE efflux family protein  27.44 
 
 		 455 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0110  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 469 aa  95.1  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.372068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  24.22 
 
 		 469 aa  94.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1106  MATE efflux family protein  27.99 
 
 		 472 aa  94  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0180  MATE efflux family protein  29.4 
 
 		 445 aa  92.4  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  25.8 
 
 		 502 aa  91.7  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0069  MATE efflux family protein  27.63 
 
 		 429 aa  90.9  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1640  DNA-damage-inducible protein F  27.38 
 
 		 436 aa  90.5  6e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.2 
 
 		 458 aa  90.5  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0896  MATE efflux family protein  31.09 
 
 		 460 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0613531 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3501  DNA-damage-inducible protein F  27.1 
 
 		 437 aa  89.4  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  24.47 
 
 		 443 aa  88.6  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0868  MATE efflux family protein  32.14 
 
 		 440 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0983692  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4619  MATE efflux family protein  29.81 
 
 		 452 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.36 
 
 		 460 aa  87.4  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2863  MATE efflux family protein  30.6 
 
 		 445 aa  87  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.277434  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  22.06 
 
 		 453 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  26.14 
 
 		 472 aa  86.3  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  30.16 
 
 		 459 aa  86.3  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  27.79 
 
 		 496 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0845  MATE efflux family protein  30.67 
 
 		 439 aa  85.1  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457545  normal  0.657757 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63730  putative transporter  29.78 
 
 		 453 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0352676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07070  Multidrug efflux protein, MatE family  30.05 
 
 		 453 aa  85.5  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  25.46 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>