More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4176 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_4176  MATE efflux family protein  100 
 
 		 460 aa  846    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  78.82 
 
 		 446 aa  606  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  77.24 
 
 		 441 aa  528  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3689  MATE efflux family protein  70.67 
 
 		 470 aa  476  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  59.58 
 
 		 442 aa  441  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2521  MATE efflux family protein  56.51 
 
 		 455 aa  399  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4334  MATE efflux family protein  59.95 
 
 		 437 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210816  normal  0.91675 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  48.91 
 
 		 466 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  49.54 
 
 		 449 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  55.53 
 
 		 458 aa  349  6e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  47.39 
 
 		 451 aa  348  1e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  51.25 
 
 		 436 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  55.26 
 
 		 450 aa  336  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  51.27 
 
 		 434 aa  333  3e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  54.65 
 
 		 459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1233  Na+-driven multidrug efflux pump  44.28 
 
 		 481 aa  327  3e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659218  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  51.35 
 
 		 448 aa  323  3e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1451  MATE efflux family protein  51.85 
 
 		 465 aa  319  7e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.815185 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0074  MATE efflux family protein  41.83 
 
 		 453 aa  313  3.9999999999999997e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286401 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21540  putative efflux protein, MATE family  52.35 
 
 		 470 aa  311  2e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  42.99 
 
 		 434 aa  232  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  41.36 
 
 		 438 aa  218  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  39.13 
 
 		 441 aa  202  8e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  40.16 
 
 		 442 aa  199  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1376  MATE efflux family protein  43.59 
 
 		 442 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1334  MATE efflux family protein  40.35 
 
 		 442 aa  190  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  37.76 
 
 		 434 aa  182  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2317  MATE efflux family protein  35.95 
 
 		 442 aa  183  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.816192  normal  0.0947968 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  36.12 
 
 		 439 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2085  MATE efflux family protein  34.35 
 
 		 444 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0451278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2131  MATE efflux family protein  34.35 
 
 		 444 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0258983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2068  MATE efflux family protein  34.35 
 
 		 444 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2155  MATE efflux family protein  34.89 
 
 		 467 aa  165  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.430874  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12851  DNA-damage-inducible protein F dinF  38.8 
 
 		 436 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000020718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  33.77 
 
 		 453 aa  143  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  32.64 
 
 		 445 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3961  MATE efflux family protein  38.41 
 
 		 427 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  32.41 
 
 		 445 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  31.72 
 
 		 492 aa  130  4.0000000000000003e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0608  MATE efflux family protein  32.64 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0569  MATE efflux family protein  32.41 
 
 		 445 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4617  DNA-damage-inducible protein F  29.57 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3527  MATE efflux family protein  28.73 
 
 		 436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  27.39 
 
 		 475 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  27.53 
 
 		 445 aa  120  6e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3792  MATE efflux family protein  30.93 
 
 		 456 aa  120  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  29.93 
 
 		 461 aa  119  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4123  MATE efflux family protein  31.42 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0144  MATE efflux family protein  31.42 
 
 		 455 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4322  MATE efflux family protein  31.42 
 
 		 455 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3802  MATE efflux family protein  30.14 
 
 		 455 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4191  MATE efflux family protein  31.42 
 
 		 456 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  26.5 
 
 		 447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0729  MATE efflux family protein  31.34 
 
 		 449 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3875  MATE efflux family protein  29.91 
 
 		 456 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4384  multi anti extrusion protein MatE  30.15 
 
 		 446 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4001  MATE efflux family protein  29 
 
 		 455 aa  109  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  26.14 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0160  MATE efflux family protein  29.28 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  30.79 
 
 		 468 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.11 
 
 		 461 aa  107  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4844  DNA-damage-inducible protein F  29.89 
 
 		 446 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8205  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  30.46 
 
 		 483 aa  106  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31014  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  30.94 
 
 		 560 aa  105  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00547148  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0160  MATE efflux family protein  29.53 
 
 		 456 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1551  MATE efflux family protein  30.96 
 
 		 440 aa  103  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.959023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0107  MATE efflux family protein  27.73 
 
 		 448 aa  103  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4009  MATE efflux family protein  28.64 
 
 		 443 aa  103  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2425  DNA-damage-inducible protein F  28.01 
 
 		 454 aa  101  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0180  MATE efflux family protein  28.86 
 
 		 445 aa  100  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  24.82 
 
 		 469 aa  100  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0630  multi anti extrusion protein MatE  29.33 
 
 		 449 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3501  DNA-damage-inducible protein F  28.57 
 
 		 437 aa  99.8  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4234  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 447 aa  98.2  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  28.99 
 
 		 496 aa  97.8  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0753  MATE efflux family protein  30.42 
 
 		 441 aa  97.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1106  MATE efflux family protein  27.71 
 
 		 472 aa  96.7  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_002950  PG1640  DNA-damage-inducible protein F  25.83 
 
 		 436 aa  95.9  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1279  DNA-damage-inducible protein F  27.03 
 
 		 472 aa  96.3  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.244391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0110  MATE efflux family protein  24.32 
 
 		 469 aa  95.9  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.372068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  25.13 
 
 		 443 aa  96.3  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  25.32 
 
 		 438 aa  95.5  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  22.1 
 
 		 453 aa  95.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  29.33 
 
 		 492 aa  95.5  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35587  hypothetical protein  27.53 
 
 		 561 aa  94.7  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.713211  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0069  MATE efflux family protein  28.3 
 
 		 429 aa  94  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07070  Multidrug efflux protein, MatE family  31.07 
 
 		 453 aa  93.6  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0896  MATE efflux family protein  31.16 
 
 		 460 aa  93.6  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0613531 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  30.72 
 
 		 459 aa  92.8  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00266  multidrug efflux pump  24.82 
 
 		 423 aa  92  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  30.61 
 
 		 459 aa  92.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2863  MATE efflux family protein  31.73 
 
 		 445 aa  92  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.277434  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4619  MATE efflux family protein  30.29 
 
 		 452 aa  90.1  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  26.58 
 
 		 472 aa  89.4  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  25.24 
 
 		 480 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  26.77 
 
 		 474 aa  88.6  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  26.15 
 
 		 546 aa  89  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  24.15 
 
 		 460 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  23.61 
 
 		 443 aa  87.8  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  26.15 
 
 		 484 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>