More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12851 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12851  DNA-damage-inducible protein F dinF  100 
 
 		 436 aa  804    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000020718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  72.56 
 
 		 439 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2085  MATE efflux family protein  74.65 
 
 		 444 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0451278  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2068  MATE efflux family protein  74.65 
 
 		 444 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2131  MATE efflux family protein  74.65 
 
 		 444 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0258983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2317  MATE efflux family protein  72.06 
 
 		 442 aa  553  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.816192  normal  0.0947968 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  58.16 
 
 		 438 aa  449  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  59.45 
 
 		 441 aa  442  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  60.18 
 
 		 434 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2155  MATE efflux family protein  57.46 
 
 		 467 aa  431  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.430874  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1334  MATE efflux family protein  54.97 
 
 		 442 aa  353  4e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  52.68 
 
 		 442 aa  349  5e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1376  MATE efflux family protein  55.02 
 
 		 442 aa  341  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3961  MATE efflux family protein  54.61 
 
 		 427 aa  293  3e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  44.16 
 
 		 434 aa  260  4e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  39.03 
 
 		 436 aa  235  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  36.7 
 
 		 466 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  40.6 
 
 		 448 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  37.02 
 
 		 449 aa  208  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  39.03 
 
 		 434 aa  207  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  36.22 
 
 		 451 aa  200  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  40.58 
 
 		 459 aa  193  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  38.75 
 
 		 442 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1451  MATE efflux family protein  36.89 
 
 		 465 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.815185 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  38.62 
 
 		 446 aa  177  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3689  MATE efflux family protein  38.22 
 
 		 470 aa  176  9e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  37.76 
 
 		 441 aa  173  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4334  MATE efflux family protein  39.64 
 
 		 437 aa  172  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210816  normal  0.91675 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1233  Na+-driven multidrug efflux pump  34.54 
 
 		 481 aa  169  6e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659218  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4176  MATE efflux family protein  39.03 
 
 		 460 aa  168  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0074  MATE efflux family protein  33.5 
 
 		 453 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286401 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  36.87 
 
 		 450 aa  164  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21540  putative efflux protein, MATE family  38.85 
 
 		 470 aa  160  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  36.45 
 
 		 458 aa  156  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2521  MATE efflux family protein  34.68 
 
 		 455 aa  136  8e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  30.94 
 
 		 453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  29.24 
 
 		 445 aa  123  7e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31014  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  29.85 
 
 		 560 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00547148  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  27.99 
 
 		 470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  30.41 
 
 		 445 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  32.96 
 
 		 492 aa  107  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.88 
 
 		 461 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  25.06 
 
 		 443 aa  103  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00266  multidrug efflux pump  27.32 
 
 		 423 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  26.89 
 
 		 449 aa  100  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0061  MATE efflux family protein  29.82 
 
 		 448 aa  99  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.871817  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  29.66 
 
 		 445 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.21 
 
 		 454 aa  98.2  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0569  MATE efflux family protein  30.02 
 
 		 445 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4234  MATE efflux family protein  28.78 
 
 		 447 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0608  MATE efflux family protein  30.25 
 
 		 445 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  26.07 
 
 		 447 aa  94.4  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0110  MATE efflux family protein  25.86 
 
 		 469 aa  93.6  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.372068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 469 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0069  MATE efflux family protein  28.71 
 
 		 429 aa  91.3  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  26.84 
 
 		 461 aa  90.1  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0248  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.41 
 
 		 439 aa  89  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  27.13 
 
 		 475 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0035  DNA-damage-inducible protein F  26.9 
 
 		 516 aa  86.7  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  22.59 
 
 		 453 aa  86.7  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3501  DNA-damage-inducible protein F  28.74 
 
 		 437 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2494  MATE efflux family protein  26.01 
 
 		 477 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3613  MATE efflux family protein  26.25 
 
 		 477 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.214192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28350  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  25.44 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00440405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  22.52 
 
 		 438 aa  84  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04000  Na(+) driven multidrug efflux pump  26.71 
 
 		 424 aa  83.2  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1710  MATE efflux family protein  23.56 
 
 		 455 aa  83.2  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.841637  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4617  DNA-damage-inducible protein F  27.38 
 
 		 455 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  26.01 
 
 		 461 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0324  putative DNA-damage-inducible protein F  27.7 
 
 		 455 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.315939  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1890  MATE efflux family protein  28.18 
 
 		 442 aa  82.4  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2863  MATE efflux family protein  29.89 
 
 		 445 aa  81.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.277434  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0729  MATE efflux family protein  29.7 
 
 		 449 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  28.21 
 
 		 472 aa  80.9  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  29.1 
 
 		 461 aa  79.7  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1551  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 440 aa  80.1  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.959023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4384  multi anti extrusion protein MatE  28.83 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  27.66 
 
 		 483 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0160  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 456 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4844  DNA-damage-inducible protein F  28.83 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8205  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1279  DNA-damage-inducible protein F  25.35 
 
 		 472 aa  78.6  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.244391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  28.03 
 
 		 468 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0310  DNA-damage-inducible protein F, putative  27.46 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  23.73 
 
 		 464 aa  77.8  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1106  MATE efflux family protein  25.58 
 
 		 472 aa  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  26.38 
 
 		 468 aa  78.2  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  23.73 
 
 		 464 aa  77.8  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3527  MATE efflux family protein  27.5 
 
 		 436 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  29.15 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  24.11 
 
 		 460 aa  77.4  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4191  MATE efflux family protein  26.8 
 
 		 456 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0845  MATE efflux family protein  27.5 
 
 		 439 aa  75.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457545  normal  0.657757 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4580  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.01 
 
 		 441 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4430  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.01 
 
 		 441 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4495  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.01 
 
 		 441 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4581  DNA-damage-inducible SOS response protein  28.73 
 
 		 441 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.941537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0630  multi anti extrusion protein MatE  29.16 
 
 		 449 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4632  DNA-damage-inducible SOS response protein  28.73 
 
 		 441 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.251658 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  24.93 
 
 		 475 aa  75.5  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0144  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 455 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>