More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_02790 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  100 
 
 		 434 aa  814    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  46.68 
 
 		 442 aa  349  6e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4176  MATE efflux family protein  51.27 
 
 		 460 aa  339  7e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  48.6 
 
 		 446 aa  330  3e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  51.27 
 
 		 441 aa  312  5.999999999999999e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3689  MATE efflux family protein  48.16 
 
 		 470 aa  312  7.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  45.5 
 
 		 451 aa  311  2e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  50.58 
 
 		 450 aa  309  5e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  44.21 
 
 		 466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  45.6 
 
 		 436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  44.24 
 
 		 449 aa  300  4e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  48.38 
 
 		 448 aa  299  7e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  47.8 
 
 		 458 aa  298  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2521  MATE efflux family protein  48.03 
 
 		 455 aa  295  8e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4334  MATE efflux family protein  48.73 
 
 		 437 aa  288  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210816  normal  0.91675 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  47.03 
 
 		 459 aa  286  7e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21540  putative efflux protein, MATE family  46.67 
 
 		 470 aa  275  1.0000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1451  MATE efflux family protein  43.75 
 
 		 465 aa  266  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.815185 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1233  Na+-driven multidrug efflux pump  39.63 
 
 		 481 aa  261  2e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659218  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0074  MATE efflux family protein  37.27 
 
 		 453 aa  259  8e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286401 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  37.18 
 
 		 438 aa  229  7e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  40.97 
 
 		 434 aa  219  7.999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  36.71 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  37.73 
 
 		 441 aa  205  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  35.84 
 
 		 439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2085  MATE efflux family protein  35.78 
 
 		 444 aa  189  8e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0451278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2131  MATE efflux family protein  35.78 
 
 		 444 aa  189  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0258983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2068  MATE efflux family protein  35.78 
 
 		 444 aa  189  8e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1334  MATE efflux family protein  38.24 
 
 		 442 aa  186  7e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2317  MATE efflux family protein  35.76 
 
 		 442 aa  186  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.816192  normal  0.0947968 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12851  DNA-damage-inducible protein F dinF  38.8 
 
 		 436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000020718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1376  MATE efflux family protein  37.29 
 
 		 442 aa  179  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2155  MATE efflux family protein  34.27 
 
 		 467 aa  175  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.430874  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  35.19 
 
 		 442 aa  173  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3961  MATE efflux family protein  39.76 
 
 		 427 aa  170  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  32.84 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  31.91 
 
 		 492 aa  140  3.9999999999999997e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  26.42 
 
 		 445 aa  130  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1640  DNA-damage-inducible protein F  31.65 
 
 		 436 aa  130  6e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  32.65 
 
 		 445 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0569  MATE efflux family protein  31.87 
 
 		 445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31014  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  31.09 
 
 		 560 aa  117  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00547148  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  30.84 
 
 		 445 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0608  MATE efflux family protein  31.75 
 
 		 445 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0729  MATE efflux family protein  30.57 
 
 		 449 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4844  DNA-damage-inducible protein F  32.82 
 
 		 446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8205  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0630  multi anti extrusion protein MatE  31.56 
 
 		 449 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4384  multi anti extrusion protein MatE  31.13 
 
 		 446 aa  110  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0791  MATE efflux family protein  30.37 
 
 		 451 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_55128  hypothetical protein  29.56 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4619  MATE efflux family protein  27.45 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0868  MATE efflux family protein  28.53 
 
 		 440 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0983692  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  31.54 
 
 		 459 aa  102  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0110  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 469 aa  101  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.372068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63730  putative transporter  31.56 
 
 		 453 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0352676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  27.32 
 
 		 483 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4234  MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 447 aa  97.8  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 475 aa  97.4  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  28.11 
 
 		 461 aa  97.1  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  25.92 
 
 		 447 aa  97.1  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 469 aa  96.3  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2369  MATE family protein  29.68 
 
 		 459 aa  95.5  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151607  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0069  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 429 aa  94.4  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0753  MATE efflux family protein  27.42 
 
 		 441 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4495  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.49 
 
 		 441 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2425  DNA-damage-inducible protein F  28.54 
 
 		 454 aa  93.6  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4580  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.49 
 
 		 441 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4430  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.49 
 
 		 441 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5540  putative transporter  31.04 
 
 		 453 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 458 aa  92  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4581  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.27 
 
 		 441 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.941537 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4632  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.27 
 
 		 441 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.251658 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  25.23 
 
 		 443 aa  91.3  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0945  MATE efflux family protein  29.23 
 
 		 453 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  26.61 
 
 		 449 aa  91.7  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  27.74 
 
 		 472 aa  90.5  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  27.51 
 
 		 468 aa  90.1  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0180  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 445 aa  89.7  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4506  DNA-damage-inducible SOS response protein  27.85 
 
 		 441 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3501  DNA-damage-inducible protein F  27.21 
 
 		 437 aa  89.7  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  23.42 
 
 		 450 aa  89  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3949  MATE efflux family protein  27.85 
 
 		 441 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0160  MATE efflux family protein  29.98 
 
 		 456 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5525  DNA-damage-inducible SOS response protein  28.08 
 
 		 441 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4553  DNA-damage-inducible SOS response protein  27.85 
 
 		 459 aa  89.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07070  Multidrug efflux protein, MatE family  29.4 
 
 		 453 aa  89.4  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4597  DNA-damage-inducible SOS response protein  28.25 
 
 		 459 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03916  DNA-damage-inducible SOS response protein  27.85 
 
 		 459 aa  89  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1180  inner membrane transmembrane protein  30.1 
 
 		 448 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000781542  normal  0.19952 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03876  hypothetical protein  27.85 
 
 		 459 aa  89  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4284  DNA-damage-inducible SOS response protein  27.85 
 
 		 459 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1551  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 440 aa  88.6  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.959023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3984  DNA-damage-inducible SOS response protein  27.85 
 
 		 459 aa  89  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0439  MATE efflux family protein  28.46 
 
 		 438 aa  88.6  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1818  MATE efflux family protein  30.2 
 
 		 459 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.138431 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2863  MATE efflux family protein  27.78 
 
 		 445 aa  88.2  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.277434  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.67 
 
 		 464 aa  87.8  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.67 
 
 		 464 aa  88.2  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1746  MATE efflux family protein  28.32 
 
 		 451 aa  87.8  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325105  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0248  DNA-damage-inducible SOS response protein  28.06 
 
 		 439 aa  87.4  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314498  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>