More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4106 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  100 
 
 		 458 aa  871    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  79.33 
 
 		 450 aa  590  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21540  putative efflux protein, MATE family  59.74 
 
 		 470 aa  414  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  55.09 
 
 		 442 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4176  MATE efflux family protein  55.53 
 
 		 460 aa  366  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  54.07 
 
 		 446 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  56.21 
 
 		 459 aa  363  3e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  50.33 
 
 		 466 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3689  MATE efflux family protein  53.13 
 
 		 470 aa  332  1e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  53.69 
 
 		 441 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  49.2 
 
 		 436 aa  325  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  51.58 
 
 		 448 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  43.65 
 
 		 451 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  46.45 
 
 		 449 aa  319  6e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  47.8 
 
 		 434 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4334  MATE efflux family protein  54.29 
 
 		 437 aa  313  4.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210816  normal  0.91675 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2521  MATE efflux family protein  49.07 
 
 		 455 aa  302  1e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1451  MATE efflux family protein  47.15 
 
 		 465 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.815185 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0074  MATE efflux family protein  39.09 
 
 		 453 aa  266  4e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286401 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1233  Na+-driven multidrug efflux pump  37.14 
 
 		 481 aa  249  6e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659218  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  39.09 
 
 		 438 aa  233  4.0000000000000004e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  42.7 
 
 		 434 aa  213  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  37.23 
 
 		 434 aa  200  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  38.76 
 
 		 442 aa  190  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  36.49 
 
 		 441 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2085  MATE efflux family protein  34.57 
 
 		 444 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0451278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2131  MATE efflux family protein  34.57 
 
 		 444 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0258983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2068  MATE efflux family protein  34.57 
 
 		 444 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  35.23 
 
 		 439 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2155  MATE efflux family protein  32.29 
 
 		 467 aa  164  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.430874  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1376  MATE efflux family protein  39.22 
 
 		 442 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2317  MATE efflux family protein  34.08 
 
 		 442 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.816192  normal  0.0947968 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  32.79 
 
 		 453 aa  161  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3961  MATE efflux family protein  39.52 
 
 		 427 aa  160  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12851  DNA-damage-inducible protein F dinF  36.38 
 
 		 436 aa  159  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000020718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1334  MATE efflux family protein  39.01 
 
 		 442 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  31.83 
 
 		 492 aa  144  4e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  27.91 
 
 		 475 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  31.17 
 
 		 445 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  31.47 
 
 		 445 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0608  MATE efflux family protein  31.01 
 
 		 445 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0569  MATE efflux family protein  30.79 
 
 		 445 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  32.94 
 
 		 468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  27.34 
 
 		 445 aa  120  4.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 447 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 461 aa  117  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  30.3 
 
 		 483 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  23.62 
 
 		 453 aa  110  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  30.96 
 
 		 469 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  29.44 
 
 		 461 aa  110  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.66 
 
 		 454 aa  109  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3527  MATE efflux family protein  26.74 
 
 		 436 aa  107  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  29.53 
 
 		 472 aa  104  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  30.51 
 
 		 459 aa  104  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1551  MATE efflux family protein  29.37 
 
 		 440 aa  103  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.959023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  28.46 
 
 		 449 aa  103  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 469 aa  103  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  23.65 
 
 		 464 aa  103  8e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  23.7 
 
 		 464 aa  103  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25.95 
 
 		 458 aa  101  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  26.53 
 
 		 443 aa  101  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2863  MATE efflux family protein  27.7 
 
 		 445 aa  101  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.277434  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0729  MATE efflux family protein  29.93 
 
 		 449 aa  100  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 450 aa  99  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 462 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1640  DNA-damage-inducible protein F  28.5 
 
 		 436 aa  99  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4384  multi anti extrusion protein MatE  29.62 
 
 		 446 aa  99  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  24.8 
 
 		 438 aa  97.8  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0630  multi anti extrusion protein MatE  29.08 
 
 		 449 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4580  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.77 
 
 		 441 aa  97.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4430  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.77 
 
 		 441 aa  97.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4495  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.77 
 
 		 441 aa  97.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  25.2 
 
 		 475 aa  97.1  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04000  Na(+) driven multidrug efflux pump  27.27 
 
 		 424 aa  95.9  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2425  DNA-damage-inducible protein F  28.12 
 
 		 454 aa  95.1  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0845  MATE efflux family protein  31.39 
 
 		 439 aa  95.1  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457545  normal  0.657757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2965  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 446 aa  95.1  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4581  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.51 
 
 		 441 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.941537 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4632  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.51 
 
 		 441 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.251658 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31014  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  28.36 
 
 		 560 aa  94.4  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00547148  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4844  DNA-damage-inducible protein F  30.07 
 
 		 446 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8205  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0180  MATE efflux family protein  27.15 
 
 		 445 aa  92  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  27.64 
 
 		 459 aa  92.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00266  multidrug efflux pump  30.4 
 
 		 423 aa  91.3  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0069  MATE efflux family protein  26.61 
 
 		 429 aa  90.1  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0310  DNA-damage-inducible protein F, putative  29.12 
 
 		 455 aa  90.1  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0324  putative DNA-damage-inducible protein F  29.12 
 
 		 455 aa  90.1  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.315939  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0110  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 469 aa  89.7  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.372068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0248  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.14 
 
 		 439 aa  89.7  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1890  MATE efflux family protein  25.61 
 
 		 442 aa  89.7  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  26.55 
 
 		 456 aa  89.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3949  MATE efflux family protein  29.37 
 
 		 441 aa  89  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0753  MATE efflux family protein  30.05 
 
 		 441 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  26.24 
 
 		 474 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03916  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.34 
 
 		 459 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4506  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.1 
 
 		 441 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4284  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.1 
 
 		 459 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03876  hypothetical protein  29.34 
 
 		 459 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4597  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.34 
 
 		 459 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3984  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.34 
 
 		 459 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.270802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>