More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1233 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1233  Na+-driven multidrug efflux pump  100 
 
 		 481 aa  937    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659218  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0074  MATE efflux family protein  53.24 
 
 		 453 aa  471  1.0000000000000001e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286401 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  46.73 
 
 		 446 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4176  MATE efflux family protein  44.28 
 
 		 460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  43.78 
 
 		 442 aa  285  9e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2521  MATE efflux family protein  43.61 
 
 		 455 aa  280  3e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  46.01 
 
 		 441 aa  280  6e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  39.42 
 
 		 449 aa  264  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  39.63 
 
 		 451 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3689  MATE efflux family protein  43.19 
 
 		 470 aa  259  9e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  35.79 
 
 		 466 aa  248  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  39.63 
 
 		 434 aa  243  5e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  39.86 
 
 		 450 aa  238  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21540  putative efflux protein, MATE family  40.65 
 
 		 470 aa  232  1e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  41.48 
 
 		 459 aa  229  8e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  37.1 
 
 		 436 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  37.14 
 
 		 458 aa  224  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4334  MATE efflux family protein  39.55 
 
 		 437 aa  222  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210816  normal  0.91675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1451  MATE efflux family protein  36.78 
 
 		 465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.815185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  37.44 
 
 		 448 aa  207  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  35.19 
 
 		 438 aa  183  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  37.44 
 
 		 434 aa  173  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  36.32 
 
 		 434 aa  173  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1334  MATE efflux family protein  37.34 
 
 		 442 aa  166  9e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2085  MATE efflux family protein  35.97 
 
 		 444 aa  163  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0451278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2131  MATE efflux family protein  35.97 
 
 		 444 aa  163  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0258983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2068  MATE efflux family protein  35.97 
 
 		 444 aa  163  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  35.68 
 
 		 439 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  37.76 
 
 		 442 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2317  MATE efflux family protein  34.76 
 
 		 442 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.816192  normal  0.0947968 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1376  MATE efflux family protein  36.63 
 
 		 442 aa  152  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  34.26 
 
 		 441 aa  149  8e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2155  MATE efflux family protein  31.69 
 
 		 467 aa  132  9e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.430874  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12851  DNA-damage-inducible protein F dinF  34.45 
 
 		 436 aa  123  8e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000020718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  28.19 
 
 		 453 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3961  MATE efflux family protein  35.47 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0025  MATE efflux family protein  27.67 
 
 		 433 aa  99.4  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00700816  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 445 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  27.49 
 
 		 445 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0845  MATE efflux family protein  30.08 
 
 		 439 aa  95.1  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457545  normal  0.657757 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  28.5 
 
 		 454 aa  94.4  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0569  MATE efflux family protein  27.05 
 
 		 445 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2863  MATE efflux family protein  28.64 
 
 		 445 aa  92.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.277434  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0608  MATE efflux family protein  27.05 
 
 		 445 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  26.94 
 
 		 449 aa  92.4  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4384  multi anti extrusion protein MatE  27.41 
 
 		 446 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  26.3 
 
 		 443 aa  87.4  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0110  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 469 aa  86.3  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.372068  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4844  DNA-damage-inducible protein F  29.34 
 
 		 446 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8205  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1551  MATE efflux family protein  25.68 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.959023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4234  MATE efflux family protein  24.37 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  28.67 
 
 		 492 aa  84.3  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3875  MATE efflux family protein  31.3 
 
 		 456 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  28.75 
 
 		 458 aa  82.8  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0630  multi anti extrusion protein MatE  28.92 
 
 		 449 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  23.87 
 
 		 443 aa  82  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0729  MATE efflux family protein  27.98 
 
 		 449 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  26.61 
 
 		 445 aa  81.6  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3792  MATE efflux family protein  32.14 
 
 		 456 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3802  MATE efflux family protein  30.43 
 
 		 455 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0035  DNA-damage-inducible protein F  26.53 
 
 		 516 aa  80.9  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1438  MATE efflux family protein  30.75 
 
 		 453 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.805906  hitchhiker  0.00501053 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6244  MATE efflux family protein  30.38 
 
 		 450 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.813306  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1835  MATE efflux family protein  30.38 
 
 		 450 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4430  DNA-damage-inducible SOS response protein  27.51 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  31.82 
 
 		 447 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4580  DNA-damage-inducible SOS response protein  27.51 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0144  MATE efflux family protein  27.01 
 
 		 455 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4495  DNA-damage-inducible SOS response protein  27.51 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1746  MATE efflux family protein  30.7 
 
 		 451 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325105  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  27.44 
 
 		 457 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4581  DNA-damage-inducible SOS response protein  27.18 
 
 		 441 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.941537 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4123  MATE efflux family protein  27.01 
 
 		 455 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  26.15 
 
 		 442 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4632  DNA-damage-inducible SOS response protein  27.18 
 
 		 441 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.251658 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0248  DNA-damage-inducible SOS response protein  27.44 
 
 		 439 aa  79  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4322  MATE efflux family protein  27.01 
 
 		 455 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4191  MATE efflux family protein  27.72 
 
 		 456 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4001  MATE efflux family protein  31.1 
 
 		 455 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4009  MATE efflux family protein  33.16 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4617  DNA-damage-inducible protein F  27.51 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0180  MATE efflux family protein  34.85 
 
 		 445 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1894  MATE efflux family protein  30.74 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000130161  unclonable  2.59167e-16 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  24.53 
 
 		 454 aa  77.4  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  27.18 
 
 		 457 aa  77  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  27.18 
 
 		 457 aa  77  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0886  MATE efflux family protein  26.73 
 
 		 455 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0912  MATE efflux family protein  26.73 
 
 		 455 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2965  MATE efflux family protein  26.21 
 
 		 446 aa  75.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.55 
 
 		 460 aa  76.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2937  MATE efflux family protein  29.19 
 
 		 451 aa  75.1  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  26.21 
 
 		 457 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1773  MATE efflux family protein  30.31 
 
 		 451 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  22.52 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5136  multi anti extrusion protein MatE  30.84 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114978  normal  0.944792 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0107  MATE efflux family protein  27.55 
 
 		 448 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  26.89 
 
 		 466 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  23.29 
 
 		 446 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  29.08 
 
 		 461 aa  73.9  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0896  MATE efflux family protein  27.56 
 
 		 460 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0613531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>