More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3689 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3689  MATE efflux family protein  100 
 
 		 470 aa  850    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  70.11 
 
 		 446 aa  528  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4176  MATE efflux family protein  68.05 
 
 		 460 aa  494  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  69.79 
 
 		 441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  57.89 
 
 		 442 aa  430  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2521  MATE efflux family protein  54.73 
 
 		 455 aa  384  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4334  MATE efflux family protein  60.42 
 
 		 437 aa  365  1e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210816  normal  0.91675 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  51.15 
 
 		 466 aa  345  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  48.64 
 
 		 449 aa  344  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  53.13 
 
 		 458 aa  336  5e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  55.03 
 
 		 450 aa  332  8e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1451  MATE efflux family protein  53.09 
 
 		 465 aa  328  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.815185 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  46.05 
 
 		 451 aa  327  3e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  54.11 
 
 		 459 aa  325  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  50.34 
 
 		 436 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  48.16 
 
 		 434 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1233  Na+-driven multidrug efflux pump  41.45 
 
 		 481 aa  293  6e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659218  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0074  MATE efflux family protein  40.52 
 
 		 453 aa  290  4e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286401 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21540  putative efflux protein, MATE family  50.97 
 
 		 470 aa  290  4e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  46.95 
 
 		 448 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  41.22 
 
 		 434 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  38.92 
 
 		 438 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  39.32 
 
 		 442 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1376  MATE efflux family protein  41.63 
 
 		 442 aa  184  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  37.16 
 
 		 441 aa  182  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  36.34 
 
 		 439 aa  177  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  37.27 
 
 		 434 aa  176  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1334  MATE efflux family protein  40.26 
 
 		 442 aa  173  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2155  MATE efflux family protein  35.91 
 
 		 467 aa  172  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.430874  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2317  MATE efflux family protein  35.37 
 
 		 442 aa  169  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.816192  normal  0.0947968 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2085  MATE efflux family protein  36.01 
 
 		 444 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0451278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2131  MATE efflux family protein  36.01 
 
 		 444 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0258983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2068  MATE efflux family protein  36.01 
 
 		 444 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  35.11 
 
 		 453 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12851  DNA-damage-inducible protein F dinF  38.08 
 
 		 436 aa  153  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000020718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3961  MATE efflux family protein  39.86 
 
 		 427 aa  133  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  27.89 
 
 		 475 aa  123  8e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  28.04 
 
 		 445 aa  122  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  30.57 
 
 		 492 aa  120  4.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31014  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  33.33 
 
 		 560 aa  118  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00547148  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  29.58 
 
 		 461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  26.85 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  27.82 
 
 		 447 aa  111  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 460 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  28.01 
 
 		 458 aa  110  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  28.41 
 
 		 459 aa  107  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  26.97 
 
 		 449 aa  107  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  26.49 
 
 		 450 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  29.77 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  32.1 
 
 		 483 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  29.67 
 
 		 461 aa  103  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0753  MATE efflux family protein  31.28 
 
 		 441 aa  103  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  31.54 
 
 		 468 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  28.62 
 
 		 457 aa  100  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.65 
 
 		 464 aa  99.8  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4617  DNA-damage-inducible protein F  27.97 
 
 		 455 aa  99.4  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4191  MATE efflux family protein  29.71 
 
 		 456 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  29.22 
 
 		 445 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4322  MATE efflux family protein  29.71 
 
 		 455 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4123  MATE efflux family protein  29.71 
 
 		 455 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0144  MATE efflux family protein  29.71 
 
 		 455 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 464 aa  97.8  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 475 aa  98.2  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  24.82 
 
 		 502 aa  97.8  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00266  multidrug efflux pump  28.22 
 
 		 423 aa  97.8  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 454 aa  97.8  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4234  MATE efflux family protein  26.6 
 
 		 447 aa  97.1  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  25.33 
 
 		 443 aa  96.3  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3792  MATE efflux family protein  29.15 
 
 		 456 aa  96.3  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3527  MATE efflux family protein  27.77 
 
 		 436 aa  95.9  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  23.61 
 
 		 468 aa  94.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0160  MATE efflux family protein  30.73 
 
 		 456 aa  94.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1279  DNA-damage-inducible protein F  26.79 
 
 		 472 aa  94  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.244391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3802  MATE efflux family protein  27.74 
 
 		 455 aa  94  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2205  hypothetical protein  30.29 
 
 		 480 aa  94  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  31.09 
 
 		 470 aa  94  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1640  DNA-damage-inducible protein F  27.81 
 
 		 436 aa  92.4  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  28.78 
 
 		 496 aa  92.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3875  MATE efflux family protein  28.28 
 
 		 456 aa  92  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  25.38 
 
 		 546 aa  92  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0569  MATE efflux family protein  28.77 
 
 		 445 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  23.68 
 
 		 443 aa  91.7  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  27.43 
 
 		 451 aa  90.5  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0791  MATE efflux family protein  32.31 
 
 		 451 aa  90.1  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1106  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 472 aa  90.1  8e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0608  MATE efflux family protein  29.16 
 
 		 445 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  25.59 
 
 		 484 aa  89.7  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000192336  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35587  hypothetical protein  27.44 
 
 		 561 aa  89.7  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.713211  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0035  DNA-damage-inducible protein F  25.57 
 
 		 516 aa  89.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  25.06 
 
 		 495 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  25.8 
 
 		 438 aa  89.4  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  25.13 
 
 		 547 aa  89  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  25.13 
 
 		 495 aa  89  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  25.13 
 
 		 547 aa  89  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  25.13 
 
 		 484 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_55128  hypothetical protein  28.77 
 
 		 449 aa  88.6  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0160  MATE efflux family protein  28.25 
 
 		 444 aa  88.6  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  24.41 
 
 		 475 aa  89  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  25.13 
 
 		 546 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0107  MATE efflux family protein  27.44 
 
 		 448 aa  88.6  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>