More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4334 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4334  MATE efflux family protein  100 
 
 		 437 aa  798    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210816  normal  0.91675 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  56.58 
 
 		 442 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  58.68 
 
 		 446 aa  396  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4176  MATE efflux family protein  59.95 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3689  MATE efflux family protein  60.42 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  58.86 
 
 		 459 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  50.23 
 
 		 449 aa  345  1e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  48.17 
 
 		 451 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  49.42 
 
 		 466 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  56.94 
 
 		 441 aa  337  3.9999999999999995e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2521  MATE efflux family protein  51.97 
 
 		 455 aa  333  5e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  53.33 
 
 		 448 aa  331  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1451  MATE efflux family protein  52.06 
 
 		 465 aa  325  7e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.815185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  54.29 
 
 		 458 aa  325  1e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  50.23 
 
 		 436 aa  318  9e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  48.73 
 
 		 434 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  52.9 
 
 		 450 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21540  putative efflux protein, MATE family  49.57 
 
 		 470 aa  285  1.0000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1233  Na+-driven multidrug efflux pump  39.55 
 
 		 481 aa  253  3e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659218  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0074  MATE efflux family protein  37.27 
 
 		 453 aa  253  6e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286401 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  44.29 
 
 		 434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  38.28 
 
 		 438 aa  229  9e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  40.1 
 
 		 434 aa  217  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  38.62 
 
 		 441 aa  206  7e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  39.03 
 
 		 439 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1376  MATE efflux family protein  42.63 
 
 		 442 aa  195  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1334  MATE efflux family protein  42.56 
 
 		 442 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  36.99 
 
 		 442 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2085  MATE efflux family protein  37.76 
 
 		 444 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0451278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2131  MATE efflux family protein  37.76 
 
 		 444 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0258983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2068  MATE efflux family protein  37.76 
 
 		 444 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2317  MATE efflux family protein  38.37 
 
 		 442 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.816192  normal  0.0947968 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  35.34 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12851  DNA-damage-inducible protein F dinF  39.31 
 
 		 436 aa  161  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000020718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2155  MATE efflux family protein  35.24 
 
 		 467 aa  160  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.430874  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3961  MATE efflux family protein  42 
 
 		 427 aa  150  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  31.28 
 
 		 492 aa  136  9e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  26.98 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  28.17 
 
 		 475 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  30.63 
 
 		 461 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  27.43 
 
 		 461 aa  116  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1551  MATE efflux family protein  29.34 
 
 		 440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.959023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  25.43 
 
 		 443 aa  111  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  30.56 
 
 		 445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2863  MATE efflux family protein  30.18 
 
 		 445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.277434  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  30.36 
 
 		 445 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2965  MATE efflux family protein  28.95 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0608  MATE efflux family protein  29.66 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  30.72 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0879  MATE efflux family protein  32.29 
 
 		 444 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0753  MATE efflux family protein  28.64 
 
 		 441 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3527  MATE efflux family protein  26.9 
 
 		 436 aa  103  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0569  MATE efflux family protein  29.89 
 
 		 445 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0896  MATE efflux family protein  30.32 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0613531 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2204  multidrug efflux pump, MATE family  31.57 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.023203  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 447 aa  102  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.08 
 
 		 454 aa  100  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1640  DNA-damage-inducible protein F  28.83 
 
 		 436 aa  99.8  8e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31014  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  30.46 
 
 		 560 aa  99.8  9e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00547148  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00266  multidrug efflux pump  24.05 
 
 		 423 aa  99  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0069  MATE efflux family protein  26.47 
 
 		 429 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0845  MATE efflux family protein  31.08 
 
 		 439 aa  98.6  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457545  normal  0.657757 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_55128  hypothetical protein  29.68 
 
 		 449 aa  98.2  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4384  multi anti extrusion protein MatE  31.78 
 
 		 446 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63730  putative transporter  31 
 
 		 453 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0352676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0729  MATE efflux family protein  31.07 
 
 		 449 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1840  MATE efflux family protein  29.21 
 
 		 458 aa  97.4  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308247  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  24.67 
 
 		 469 aa  96.7  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  26.09 
 
 		 464 aa  96.3  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  26.09 
 
 		 464 aa  96.3  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  27.08 
 
 		 547 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  27.08 
 
 		 547 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  27.08 
 
 		 546 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4844  DNA-damage-inducible protein F  30.12 
 
 		 446 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8205  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0439  MATE efflux family protein  29.67 
 
 		 438 aa  95.9  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  26.82 
 
 		 546 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  27.08 
 
 		 495 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0283  DNA-damage-inducible F transmembrane protein  34.99 
 
 		 457 aa  95.5  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00354836  normal  0.290631 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  26.82 
 
 		 484 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  27.08 
 
 		 484 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  24.22 
 
 		 453 aa  94.4  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  23.27 
 
 		 449 aa  94.4  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4001  MATE efflux family protein  25.92 
 
 		 455 aa  94  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  26.82 
 
 		 495 aa  94  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0248  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.87 
 
 		 439 aa  94  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314498  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4617  DNA-damage-inducible protein F  25.74 
 
 		 455 aa  93.6  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0144  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 455 aa  93.6  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4123  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 455 aa  93.2  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4322  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 455 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3802  MATE efflux family protein  26.59 
 
 		 455 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1507  DNA-damage-inducible protein F  33.03 
 
 		 463 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208132  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4191  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 456 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  28.84 
 
 		 468 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1536  DNA-damage-inducible protein  33.1 
 
 		 463 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.65109  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1279  DNA-damage-inducible protein F  27.92 
 
 		 472 aa  91.7  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.244391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0160  MATE efflux family protein  30.45 
 
 		 456 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5540  putative transporter  31.99 
 
 		 453 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4619  MATE efflux family protein  28.1 
 
 		 452 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07070  Multidrug efflux protein, MatE family  30.39 
 
 		 453 aa  90.9  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  29.1 
 
 		 483 aa  91.3  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>