More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3351 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  100 
 
 		 441 aa  812    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4176  MATE efflux family protein  77.24 
 
 		 460 aa  568  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  75.06 
 
 		 446 aa  559  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3689  MATE efflux family protein  69.75 
 
 		 470 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  57.27 
 
 		 442 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2521  MATE efflux family protein  56.56 
 
 		 455 aa  388  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  48.86 
 
 		 466 aa  347  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  50 
 
 		 449 aa  345  8e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  48.28 
 
 		 451 aa  342  7e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4334  MATE efflux family protein  56.94 
 
 		 437 aa  342  1e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210816  normal  0.91675 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  53.69 
 
 		 458 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  51.27 
 
 		 434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  54.11 
 
 		 459 aa  323  4e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1233  Na+-driven multidrug efflux pump  46.01 
 
 		 481 aa  322  9.999999999999999e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659218  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1451  MATE efflux family protein  51.27 
 
 		 465 aa  318  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.815185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  54.52 
 
 		 450 aa  317  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  48.4 
 
 		 436 aa  315  8e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21540  putative efflux protein, MATE family  54.55 
 
 		 470 aa  314  1.9999999999999998e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0074  MATE efflux family protein  40.91 
 
 		 453 aa  311  1e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286401 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  51.96 
 
 		 448 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  45.32 
 
 		 434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  41.51 
 
 		 438 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  39.39 
 
 		 434 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  38.57 
 
 		 442 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  38.07 
 
 		 441 aa  184  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  37.36 
 
 		 439 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1334  MATE efflux family protein  40.97 
 
 		 442 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2317  MATE efflux family protein  36.49 
 
 		 442 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.816192  normal  0.0947968 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2155  MATE efflux family protein  35.06 
 
 		 467 aa  171  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.430874  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2085  MATE efflux family protein  35.91 
 
 		 444 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0451278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2131  MATE efflux family protein  35.91 
 
 		 444 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0258983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2068  MATE efflux family protein  35.91 
 
 		 444 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1376  MATE efflux family protein  40.16 
 
 		 442 aa  171  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12851  DNA-damage-inducible protein F dinF  39.28 
 
 		 436 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000020718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3961  MATE efflux family protein  39 
 
 		 427 aa  145  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  33.33 
 
 		 492 aa  134  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  33.07 
 
 		 453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  30.8 
 
 		 445 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  29.89 
 
 		 445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  27 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0569  MATE efflux family protein  30.34 
 
 		 445 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0608  MATE efflux family protein  30.11 
 
 		 445 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  29.77 
 
 		 461 aa  110  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.03 
 
 		 475 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3527  MATE efflux family protein  28.35 
 
 		 436 aa  107  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 447 aa  104  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3792  MATE efflux family protein  29.15 
 
 		 456 aa  103  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.92 
 
 		 454 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.8 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  26.61 
 
 		 449 aa  100  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0180  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 445 aa  99  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4384  multi anti extrusion protein MatE  29.8 
 
 		 446 aa  99  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4234  MATE efflux family protein  26.4 
 
 		 447 aa  98.6  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0110  MATE efflux family protein  26.1 
 
 		 469 aa  98.6  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.372068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0061  MATE efflux family protein  28.85 
 
 		 448 aa  98.2  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.871817  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  22.3 
 
 		 453 aa  97.8  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4191  MATE efflux family protein  28.25 
 
 		 456 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0753  MATE efflux family protein  30.39 
 
 		 441 aa  97.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0729  MATE efflux family protein  29.89 
 
 		 449 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4123  MATE efflux family protein  28.25 
 
 		 455 aa  96.7  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4322  MATE efflux family protein  28.25 
 
 		 455 aa  96.7  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.89 
 
 		 460 aa  95.9  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0144  MATE efflux family protein  28.28 
 
 		 455 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  24.87 
 
 		 443 aa  95.1  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4844  DNA-damage-inducible protein F  29.77 
 
 		 446 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8205  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1279  DNA-damage-inducible protein F  25.85 
 
 		 472 aa  95.1  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.244391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  29.38 
 
 		 496 aa  94.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35587  hypothetical protein  26.61 
 
 		 561 aa  94.4  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.713211  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4009  MATE efflux family protein  27.7 
 
 		 443 aa  94.4  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  23.21 
 
 		 469 aa  94.4  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31014  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  28.61 
 
 		 560 aa  94.4  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00547148  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  25.13 
 
 		 438 aa  93.6  6e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4617  DNA-damage-inducible protein F  28.44 
 
 		 455 aa  93.6  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0439  MATE efflux family protein  27.8 
 
 		 438 aa  92.8  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  21.45 
 
 		 462 aa  92.8  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0896  MATE efflux family protein  30.23 
 
 		 460 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0613531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0160  MATE efflux family protein  27.75 
 
 		 444 aa  92.8  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1551  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 440 aa  92.4  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.959023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  29.66 
 
 		 468 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  27.11 
 
 		 470 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  24.68 
 
 		 458 aa  91.3  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0069  MATE efflux family protein  27.93 
 
 		 429 aa  91.3  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4619  MATE efflux family protein  29.37 
 
 		 452 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04000  Na(+) driven multidrug efflux pump  25.81 
 
 		 424 aa  90.5  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  26.75 
 
 		 475 aa  90.5  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0630  multi anti extrusion protein MatE  27.88 
 
 		 449 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4849  MATE efflux family protein  33.33 
 
 		 450 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1640  DNA-damage-inducible protein F  28.43 
 
 		 436 aa  89  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1106  MATE efflux family protein  26.64 
 
 		 472 aa  89.4  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3772  MATE efflux family protein  33.33 
 
 		 450 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  23.58 
 
 		 468 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  22.82 
 
 		 464 aa  88.2  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3875  MATE efflux family protein  28.73 
 
 		 456 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0107  MATE efflux family protein  27.95 
 
 		 448 aa  88.2  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  29.76 
 
 		 461 aa  87.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  29.66 
 
 		 459 aa  87.8  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  28.09 
 
 		 469 aa  87.4  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3802  MATE efflux family protein  28.63 
 
 		 455 aa  87  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  28.39 
 
 		 472 aa  86.7  7e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0283  DNA-damage-inducible F transmembrane protein  32.41 
 
 		 457 aa  86.7  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00354836  normal  0.290631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>