38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_30385 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009357  OSTLU_30385  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  100 
 
 		 459 aa  915    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  33.54 
 
 		 492 aa  82.8  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  30.05 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  24.34 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  30.39 
 
 		 438 aa  71.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3961  MATE efflux family protein  31.35 
 
 		 427 aa  67.8  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  31.61 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  30.2 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  29.17 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1334  MATE efflux family protein  28.25 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  27.72 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  30.05 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  30 
 
 		 459 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  29.69 
 
 		 441 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2155  MATE efflux family protein  29.08 
 
 		 467 aa  53.9  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.430874  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21540  putative efflux protein, MATE family  32.62 
 
 		 470 aa  53.9  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  29.14 
 
 		 442 aa  53.9  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 449 aa  53.9  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31014  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  28.29 
 
 		 560 aa  53.9  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00547148  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0845  MATE efflux family protein  27.8 
 
 		 439 aa  50.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457545  normal  0.657757 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  26.83 
 
 		 442 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2317  MATE efflux family protein  26.96 
 
 		 442 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.816192  normal  0.0947968 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2863  MATE efflux family protein  33.33 
 
 		 445 aa  47  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.277434  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  29.51 
 
 		 434 aa  47  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87197  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  25.23 
 
 		 490 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0879  MATE efflux family protein  31.28 
 
 		 444 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0035  DNA-damage-inducible protein F  27.47 
 
 		 516 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  28.22 
 
 		 436 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1376  MATE efflux family protein  27.12 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  27.92 
 
 		 441 aa  45.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4534  MATE efflux family protein  35.51 
 
 		 451 aa  44.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637749  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4619  MATE efflux family protein  27.75 
 
 		 452 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  29.51 
 
 		 453 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2068  MATE efflux family protein  26.47 
 
 		 444 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2131  MATE efflux family protein  26.47 
 
 		 444 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0258983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2085  MATE efflux family protein  26.47 
 
 		 444 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0451278  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2521  MATE efflux family protein  27.03 
 
 		 455 aa  43.5  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1451  MATE efflux family protein  27.12 
 
 		 465 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.815185 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>