More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2173 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2173  MATE efflux family protein  100 
 
 		 481 aa  955    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.843006 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2651  MATE efflux family protein  53.14 
 
 		 495 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.6642  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0693  MATE efflux family protein  52.2 
 
 		 489 aa  438  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.266905 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2521  MATE efflux family protein  48.35 
 
 		 461 aa  418  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0999  MATE efflux family protein  49.89 
 
 		 473 aa  395  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1596  MATE efflux family protein  43.81 
 
 		 438 aa  348  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000302768  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2333  MATE efflux family protein  38.94 
 
 		 456 aa  263  6.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.1 
 
 		 458 aa  128  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 464 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  27.93 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  25.73 
 
 		 438 aa  114  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  23.94 
 
 		 477 aa  113  9e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  24.95 
 
 		 464 aa  111  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  23.54 
 
 		 469 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  27.33 
 
 		 498 aa  106  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  23.66 
 
 		 464 aa  104  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  26.19 
 
 		 452 aa  104  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.32 
 
 		 467 aa  104  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  23.6 
 
 		 464 aa  103  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  25.28 
 
 		 475 aa  102  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 466 aa  100  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  24.9 
 
 		 490 aa  99  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  25.39 
 
 		 525 aa  99.8  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  22.5 
 
 		 475 aa  98.6  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  23.82 
 
 		 450 aa  98.6  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  21.88 
 
 		 453 aa  97.8  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  23.04 
 
 		 462 aa  97.4  5e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  27.48 
 
 		 451 aa  97.1  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  24.89 
 
 		 446 aa  95.9  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  26.57 
 
 		 453 aa  96.3  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  23.23 
 
 		 454 aa  95.5  2e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  26.05 
 
 		 468 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  25.28 
 
 		 467 aa  93.6  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  23.15 
 
 		 459 aa  93.2  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  26.44 
 
 		 486 aa  93.2  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  25.88 
 
 		 481 aa  92.8  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  22.56 
 
 		 468 aa  92.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  24.59 
 
 		 538 aa  90.9  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  21.24 
 
 		 450 aa  89.7  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  23.58 
 
 		 461 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  25.79 
 
 		 469 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  22.17 
 
 		 445 aa  88.6  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  21.51 
 
 		 462 aa  86.7  8e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  25.16 
 
 		 464 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  24.32 
 
 		 464 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06935  Na+-driven multidrug efflux pump  24.46 
 
 		 446 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  24.48 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  24.2 
 
 		 472 aa  85.9  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  23 
 
 		 500 aa  85.9  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  24.58 
 
 		 464 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  24.58 
 
 		 464 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  24.58 
 
 		 464 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 453 aa  85.5  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  25 
 
 		 454 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  24.06 
 
 		 463 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 461 aa  84.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  23.33 
 
 		 554 aa  84.7  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  24.59 
 
 		 464 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  22.52 
 
 		 464 aa  84  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  21.13 
 
 		 456 aa  84  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  24.66 
 
 		 448 aa  84  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 464 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  22.15 
 
 		 445 aa  82.8  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  24.18 
 
 		 451 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  22.73 
 
 		 460 aa  81.6  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  22.86 
 
 		 464 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 455 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  23.44 
 
 		 467 aa  81.3  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  25.69 
 
 		 500 aa  80.5  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  22.65 
 
 		 470 aa  80.1  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  23.97 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  20.67 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  25.55 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  22.42 
 
 		 453 aa  79  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  26.29 
 
 		 457 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0981  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 456 aa  78.2  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.730082  normal  0.0880752 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  25.08 
 
 		 453 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  23.65 
 
 		 461 aa  77.4  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 462 aa  77  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  28.08 
 
 		 460 aa  76.6  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  22.89 
 
 		 447 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  20.87 
 
 		 440 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  24.43 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  23.6 
 
 		 463 aa  75.9  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  20.87 
 
 		 446 aa  75.1  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  21.39 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  24.92 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  25.3 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  24.76 
 
 		 452 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  25.07 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  24.6 
 
 		 476 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  22.12 
 
 		 468 aa  73.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  22.89 
 
 		 447 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  25.08 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  23.61 
 
 		 485 aa  73.6  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  23.74 
 
 		 485 aa  73.2  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  26.91 
 
 		 452 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 457 aa  72.8  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>