263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0693 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0693  MATE efflux family protein  100 
 
 		 489 aa  966    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.266905 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2651  MATE efflux family protein  61.46 
 
 		 495 aa  579  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.6642  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0999  MATE efflux family protein  67.81 
 
 		 473 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2173  MATE efflux family protein  53.26 
 
 		 481 aa  431  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.843006 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2521  MATE efflux family protein  47.87 
 
 		 461 aa  412  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1596  MATE efflux family protein  50.12 
 
 		 438 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000302768  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2333  MATE efflux family protein  37.56 
 
 		 456 aa  218  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  24.68 
 
 		 467 aa  113  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.01 
 
 		 458 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  22.32 
 
 		 477 aa  107  4e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  22.96 
 
 		 460 aa  104  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  26.08 
 
 		 498 aa  103  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.34 
 
 		 464 aa  102  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.34 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  24.28 
 
 		 453 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  20.73 
 
 		 438 aa  100  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 468 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  23.46 
 
 		 468 aa  95.1  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  24.14 
 
 		 461 aa  93.6  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  22.05 
 
 		 464 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  20.72 
 
 		 475 aa  92  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  26.35 
 
 		 462 aa  90.1  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  23.24 
 
 		 440 aa  90.1  7e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  28.07 
 
 		 469 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  25.6 
 
 		 525 aa  87  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  28.83 
 
 		 455 aa  86.7  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  28.21 
 
 		 481 aa  85.5  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  24.08 
 
 		 500 aa  85.1  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  21.92 
 
 		 448 aa  84  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  23.76 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  26.37 
 
 		 483 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  22.83 
 
 		 464 aa  82  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  24.41 
 
 		 499 aa  80.9  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  26.11 
 
 		 486 aa  80.9  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  23.4 
 
 		 463 aa  80.1  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  21.33 
 
 		 456 aa  79  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  20.14 
 
 		 462 aa  77.8  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  27.16 
 
 		 451 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1890  MATE efflux family protein  27.87 
 
 		 442 aa  77.4  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  22.08 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  26.63 
 
 		 469 aa  76.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  21.4 
 
 		 453 aa  76.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  22.43 
 
 		 518 aa  76.3  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  27.11 
 
 		 449 aa  75.5  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  23.22 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  22.13 
 
 		 468 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  20.96 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  24.28 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  22.69 
 
 		 445 aa  75.1  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 452 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  27.39 
 
 		 466 aa  73.9  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  25.28 
 
 		 490 aa  73.9  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  29.68 
 
 		 448 aa  72.8  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  22.45 
 
 		 460 aa  72.8  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  26.63 
 
 		 460 aa  72  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  22.42 
 
 		 554 aa  72.4  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  22.12 
 
 		 461 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  24.88 
 
 		 454 aa  71.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  26.05 
 
 		 486 aa  71.2  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  19.14 
 
 		 467 aa  70.5  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  25 
 
 		 485 aa  69.3  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  24.03 
 
 		 475 aa  69.7  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  24.31 
 
 		 458 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  21.04 
 
 		 461 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0048  MATE efflux family protein  24.43 
 
 		 501 aa  68.9  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.331446 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  24.42 
 
 		 538 aa  69.3  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  22.62 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  25.12 
 
 		 477 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  26.99 
 
 		 470 aa  67.8  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  25.12 
 
 		 477 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  21.44 
 
 		 450 aa  67.8  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  25 
 
 		 466 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  20.61 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  21.13 
 
 		 462 aa  67.4  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  23.46 
 
 		 458 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  25.29 
 
 		 449 aa  66.6  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  19.11 
 
 		 458 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  25.52 
 
 		 466 aa  65.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  25.56 
 
 		 457 aa  65.1  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  19.11 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  23.13 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  25.07 
 
 		 498 aa  65.1  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  22.34 
 
 		 484 aa  64.7  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000192336  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  25.84 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  25.74 
 
 		 463 aa  64.3  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  24.8 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  27.87 
 
 		 477 aa  64.7  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  22.78 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  23.52 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  19.69 
 
 		 464 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  26.8 
 
 		 484 aa  63.9  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  19.34 
 
 		 469 aa  63.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  19.34 
 
 		 469 aa  63.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  22.98 
 
 		 486 aa  63.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  23.11 
 
 		 472 aa  63.2  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16054  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  25.72 
 
 		 443 aa  63.2  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0679405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  23.41 
 
 		 460 aa  63.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>