More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2521 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2521  MATE efflux family protein  100 
 
 		 461 aa  925    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2651  MATE efflux family protein  51.46 
 
 		 495 aa  480  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.6642  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2173  MATE efflux family protein  48.35 
 
 		 481 aa  438  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.843006 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0693  MATE efflux family protein  47.87 
 
 		 489 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.266905 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0999  MATE efflux family protein  49.34 
 
 		 473 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1596  MATE efflux family protein  41.84 
 
 		 438 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000302768  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2333  MATE efflux family protein  32.74 
 
 		 456 aa  203  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.92 
 
 		 458 aa  141  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 461 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  23.97 
 
 		 464 aa  113  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 438 aa  111  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.44 
 
 		 464 aa  110  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  29.25 
 
 		 469 aa  110  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.44 
 
 		 464 aa  110  6e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  23.78 
 
 		 477 aa  107  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 461 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  24.08 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  22.8 
 
 		 467 aa  103  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  24.58 
 
 		 450 aa  102  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  23.85 
 
 		 467 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  26.62 
 
 		 452 aa  97.4  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 475 aa  97.1  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 468 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  24.02 
 
 		 460 aa  94.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 498 aa  94.4  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  23.48 
 
 		 462 aa  94.4  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  24.27 
 
 		 459 aa  93.6  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  23.54 
 
 		 469 aa  91.7  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  26.79 
 
 		 469 aa  90.9  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  20.65 
 
 		 454 aa  91.3  4e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  23.61 
 
 		 471 aa  87.8  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  25 
 
 		 486 aa  88.2  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  29.34 
 
 		 455 aa  87.4  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  21.35 
 
 		 456 aa  86.7  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  25 
 
 		 455 aa  86.7  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  25 
 
 		 455 aa  86.7  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  24.34 
 
 		 485 aa  85.5  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  21.9 
 
 		 475 aa  85.5  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  23.32 
 
 		 483 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  21.16 
 
 		 469 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  19.96 
 
 		 462 aa  83.2  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  22.68 
 
 		 439 aa  82.8  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  22.43 
 
 		 468 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  26.52 
 
 		 458 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  26.45 
 
 		 458 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  23.33 
 
 		 455 aa  81.3  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 525 aa  80.9  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  22.7 
 
 		 448 aa  79.7  0.00000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  23.45 
 
 		 466 aa  79.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  22.8 
 
 		 453 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  23.71 
 
 		 538 aa  79  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  22.95 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  21.71 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 445 aa  77.8  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  21.71 
 
 		 469 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  24.32 
 
 		 462 aa  77  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 453 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  23.96 
 
 		 475 aa  76.6  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28350  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  24.65 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00440405  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  21.71 
 
 		 469 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  21.46 
 
 		 469 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  21.46 
 
 		 469 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  21.46 
 
 		 469 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  22.57 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  23.4 
 
 		 458 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29306  predicted protein  23.75 
 
 		 483 aa  76.3  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  22.09 
 
 		 492 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  21.46 
 
 		 469 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  23.4 
 
 		 458 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  22.95 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  20.34 
 
 		 469 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  20.34 
 
 		 469 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  21.69 
 
 		 472 aa  75.1  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  22.9 
 
 		 521 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 446 aa  74.3  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  22.41 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  22.41 
 
 		 463 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  22.08 
 
 		 496 aa  73.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  22.85 
 
 		 470 aa  73.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  21.76 
 
 		 472 aa  73.6  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  22.93 
 
 		 478 aa  73.2  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  23.06 
 
 		 447 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  22.46 
 
 		 468 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  24.28 
 
 		 408 aa  73.2  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  20.83 
 
 		 469 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  23.61 
 
 		 461 aa  73.2  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  24 
 
 		 460 aa  72  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  21.69 
 
 		 450 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  26.14 
 
 		 457 aa  72  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  22.67 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  21.21 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  23.51 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  24.39 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  22.78 
 
 		 446 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1890  MATE efflux family protein  24.15 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  21.85 
 
 		 453 aa  70.5  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0069  MATE efflux family protein  23.67 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  23.06 
 
 		 475 aa  70.1  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  22.08 
 
 		 499 aa  70.1  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  23.61 
 
 		 457 aa  69.7  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>