More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2651 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2651  MATE efflux family protein  100 
 
 		 495 aa  1002    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.6642  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0693  MATE efflux family protein  61.46 
 
 		 489 aa  565  1e-160  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.266905 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0999  MATE efflux family protein  60.04 
 
 		 473 aa  521  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2173  MATE efflux family protein  53.12 
 
 		 481 aa  457  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.843006 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2521  MATE efflux family protein  51.46 
 
 		 461 aa  449  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1596  MATE efflux family protein  46.67 
 
 		 438 aa  385  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000302768  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2333  MATE efflux family protein  34.16 
 
 		 456 aa  212  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  25.74 
 
 		 461 aa  127  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  23.99 
 
 		 438 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.78 
 
 		 464 aa  110  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  23.98 
 
 		 448 aa  108  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  23.31 
 
 		 468 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  25.38 
 
 		 468 aa  103  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  24.76 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  23.46 
 
 		 458 aa  101  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  22.15 
 
 		 477 aa  100  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  23.95 
 
 		 467 aa  100  9e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  23.89 
 
 		 483 aa  100  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  22.53 
 
 		 464 aa  99.8  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  20.26 
 
 		 475 aa  98.2  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  24.44 
 
 		 459 aa  97.4  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  24.66 
 
 		 453 aa  97.1  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  23.58 
 
 		 461 aa  96.7  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  24.24 
 
 		 469 aa  94.4  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  22.05 
 
 		 462 aa  94.4  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  23.66 
 
 		 450 aa  94  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  27.95 
 
 		 477 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  27.95 
 
 		 477 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  24.19 
 
 		 461 aa  93.6  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  28.14 
 
 		 455 aa  92  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  25.86 
 
 		 466 aa  91.7  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 486 aa  90.9  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  22.95 
 
 		 469 aa  90.1  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  22.05 
 
 		 454 aa  89.7  1e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  23.45 
 
 		 500 aa  88.6  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  19.22 
 
 		 464 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  18.86 
 
 		 464 aa  87.4  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  20.5 
 
 		 460 aa  86.7  8e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  19.1 
 
 		 464 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  25.26 
 
 		 460 aa  86.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  19.11 
 
 		 464 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  19.11 
 
 		 464 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  19.11 
 
 		 464 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  19.11 
 
 		 464 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  18.89 
 
 		 464 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  23.6 
 
 		 460 aa  84  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  18.54 
 
 		 463 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  21.27 
 
 		 462 aa  83.6  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  24.07 
 
 		 471 aa  83.2  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  26.38 
 
 		 447 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  18.89 
 
 		 464 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  23.52 
 
 		 447 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  24.07 
 
 		 452 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  22.77 
 
 		 445 aa  81.6  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  25 
 
 		 446 aa  80.9  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  22.72 
 
 		 485 aa  80.9  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  25.58 
 
 		 484 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  21.81 
 
 		 468 aa  80.1  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  23.57 
 
 		 469 aa  80.1  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  26.58 
 
 		 455 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  23.3 
 
 		 498 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  22.2 
 
 		 554 aa  79.3  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  26.58 
 
 		 455 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  19.64 
 
 		 463 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  25.58 
 
 		 525 aa  79.7  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  20.6 
 
 		 456 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  21.9 
 
 		 453 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  19.51 
 
 		 462 aa  78.2  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  24.88 
 
 		 459 aa  77.4  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  22.51 
 
 		 450 aa  77  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6244  MATE efflux family protein  24.65 
 
 		 450 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.813306  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1835  MATE efflux family protein  24.65 
 
 		 450 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  20.68 
 
 		 446 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  22.67 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2343  MATE efflux family protein  26.41 
 
 		 483 aa  74.7  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1746  MATE efflux family protein  24.05 
 
 		 451 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325105  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  23.32 
 
 		 455 aa  74.7  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  25.08 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  24 
 
 		 446 aa  73.9  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  23.53 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  22.22 
 
 		 469 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  21.41 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  21.41 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  20.97 
 
 		 454 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1859  MATE efflux family protein  24.18 
 
 		 450 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763838  normal  0.0423968 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  22.34 
 
 		 469 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  21.61 
 
 		 490 aa  72.8  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  20.83 
 
 		 499 aa  73.2  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  22.81 
 
 		 492 aa  72.8  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  22.13 
 
 		 538 aa  72  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  22.42 
 
 		 486 aa  72  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  21.13 
 
 		 475 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  21.22 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  21.56 
 
 		 518 aa  71.6  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  23.25 
 
 		 500 aa  72  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  21.13 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  22.08 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  21.57 
 
 		 453 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  21.88 
 
 		 453 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>