More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0999 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0999  MATE efflux family protein  100 
 
 		 473 aa  933    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0693  MATE efflux family protein  67.81 
 
 		 489 aa  596  1e-169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.266905 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2651  MATE efflux family protein  60.09 
 
 		 495 aa  556  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.6642  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2173  MATE efflux family protein  49.89 
 
 		 481 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.843006 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2521  MATE efflux family protein  49.34 
 
 		 461 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1596  MATE efflux family protein  49.07 
 
 		 438 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000302768  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2333  MATE efflux family protein  38.16 
 
 		 456 aa  228  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  23.98 
 
 		 477 aa  110  7.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  26.14 
 
 		 467 aa  106  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  23.68 
 
 		 464 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  25.96 
 
 		 459 aa  101  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  25.25 
 
 		 500 aa  99.8  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  21.43 
 
 		 462 aa  99.4  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  22.85 
 
 		 448 aa  97.8  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  25.33 
 
 		 453 aa  96.7  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  23.48 
 
 		 464 aa  96.3  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  23.43 
 
 		 464 aa  95.9  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  23.7 
 
 		 461 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  22.22 
 
 		 462 aa  95.1  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 468 aa  94.4  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  28.07 
 
 		 486 aa  94  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  20.14 
 
 		 438 aa  92.8  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 468 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 525 aa  91.3  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  27.74 
 
 		 485 aa  88.2  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 483 aa  87  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  22.43 
 
 		 460 aa  87  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  24.69 
 
 		 498 aa  87  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25.95 
 
 		 461 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  28.04 
 
 		 469 aa  86.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  23.38 
 
 		 450 aa  84.7  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  22.59 
 
 		 464 aa  83.2  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  21.74 
 
 		 458 aa  82.8  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  24.95 
 
 		 490 aa  82  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  22.03 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  22.05 
 
 		 445 aa  79.7  0.00000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  23.76 
 
 		 499 aa  79.7  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  21.51 
 
 		 456 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  25.83 
 
 		 538 aa  77.8  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  20.09 
 
 		 475 aa  77.8  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  25.18 
 
 		 518 aa  77.4  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  25.85 
 
 		 460 aa  77.4  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  27.87 
 
 		 460 aa  77.4  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 469 aa  77  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  27.01 
 
 		 455 aa  76.6  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  23.49 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  23.71 
 
 		 471 aa  76.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  21.52 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  25.71 
 
 		 440 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  25.75 
 
 		 455 aa  74.7  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  25.75 
 
 		 455 aa  74.7  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  21.29 
 
 		 455 aa  73.9  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  24.14 
 
 		 481 aa  73.9  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  21.32 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0802  MATE efflux family protein  24.4 
 
 		 453 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 454 aa  73.6  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  22.88 
 
 		 467 aa  73.2  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3315  MATE efflux family protein  24.67 
 
 		 456 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 462 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0638  MATE efflux family protein  24.67 
 
 		 456 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  24.06 
 
 		 554 aa  72  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  22.05 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  20.48 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  23.15 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  26.51 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  21.63 
 
 		 460 aa  68.6  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  22.74 
 
 		 452 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  22.86 
 
 		 446 aa  68.2  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  23.48 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  26.2 
 
 		 486 aa  67.8  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16054  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  26.74 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0679405  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  22.59 
 
 		 467 aa  67.4  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0078  mate efflux family protein  20.5 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.129262  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  21.15 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  22.78 
 
 		 446 aa  67  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  25.41 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  24.92 
 
 		 457 aa  66.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  24.59 
 
 		 452 aa  65.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0446  multi anti extrusion protein MatE  25.52 
 
 		 455 aa  65.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  22.44 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3485  MATE efflux family protein  25 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  26.59 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  23.44 
 
 		 468 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  25 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  22.48 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  23.25 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  22.74 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  26.4 
 
 		 484 aa  63.9  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  22.99 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  28.12 
 
 		 465 aa  63.9  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  21.13 
 
 		 453 aa  63.9  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  25.17 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  23.86 
 
 		 496 aa  63.2  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  25.34 
 
 		 463 aa  63.2  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3187  MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 486 aa  63.5  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  18.85 
 
 		 453 aa  63.2  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  17.03 
 
 		 464 aa  63.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  28.57 
 
 		 477 aa  63.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  23.2 
 
 		 448 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4099  MATE efflux family protein  25.39 
 
 		 442 aa  62  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>