More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1992 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1992  multi antimicrobial extrusion protein MatE  100 
 
 		 483 aa  942    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5118  multi anti extrusion protein MatE  52.73 
 
 		 453 aa  403  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1831  MATE efflux family protein  47.27 
 
 		 451 aa  368  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113537 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  40.37 
 
 		 501 aa  349  6e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  41.49 
 
 		 520 aa  349  6e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  41.33 
 
 		 517 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2765  MATE efflux family protein  41.2 
 
 		 503 aa  347  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.220572 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1558  MATE efflux family protein  40.47 
 
 		 516 aa  346  4e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2111  MATE efflux family protein  42.92 
 
 		 505 aa  345  7e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  42.63 
 
 		 520 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  38.99 
 
 		 515 aa  345  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  38.57 
 
 		 505 aa  344  2e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2253  MATE efflux family protein  48.95 
 
 		 434 aa  344  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  38.99 
 
 		 515 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  38.99 
 
 		 515 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  38.99 
 
 		 515 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  38.95 
 
 		 509 aa  342  1e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1492  MATE efflux family protein  40.21 
 
 		 495 aa  341  2e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2280  MATE efflux family protein  41.24 
 
 		 531 aa  339  7e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234689  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3952  multi anti extrusion protein MatE  46.2 
 
 		 481 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.667584 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1591  MATE efflux family protein  37.72 
 
 		 521 aa  333  4e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2591  multi anti extrusion protein MatE  46.44 
 
 		 493 aa  332  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2619  multi antimicrobial extrusion protein MatE  45.05 
 
 		 479 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2814  multi antimicrobial extrusion protein MatE  46.44 
 
 		 493 aa  318  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486087 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2191  MATE efflux family protein  38.55 
 
 		 442 aa  315  1.9999999999999998e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114435  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01514  hypothetical protein  41.53 
 
 		 486 aa  307  3e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0285  MATE efflux family protein  43.33 
 
 		 465 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.47505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7265  multi antimicrobial extrusion protein MatE  46.94 
 
 		 491 aa  299  8e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6022  multi anti extrusion protein MatE  47.71 
 
 		 481 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  0.0180252 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3527  MATE efflux family protein  38.44 
 
 		 443 aa  280  5e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3634  MATE efflux family protein  40.7 
 
 		 463 aa  278  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  36.62 
 
 		 459 aa  261  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0370  MATE efflux family protein  36.88 
 
 		 458 aa  246  6e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3037  hypothetical protein  34.45 
 
 		 453 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0928609  normal  0.0798256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3172  hypothetical protein  35.11 
 
 		 453 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0893735  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2187  multi anti extrusion protein MatE  32.54 
 
 		 446 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.761127  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  28.28 
 
 		 453 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  28.69 
 
 		 460 aa  127  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 454 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  27.44 
 
 		 456 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  29.26 
 
 		 455 aa  124  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  28.02 
 
 		 462 aa  123  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  28.47 
 
 		 451 aa  123  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  26.72 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  28.26 
 
 		 455 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  28.26 
 
 		 455 aa  117  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  28.5 
 
 		 460 aa  117  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  28.92 
 
 		 455 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  28.33 
 
 		 452 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  28.26 
 
 		 455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  28.89 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  28.68 
 
 		 476 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  29.85 
 
 		 466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  29.62 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  27.97 
 
 		 454 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  27.18 
 
 		 456 aa  106  9e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 452 aa  106  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  27.63 
 
 		 459 aa  104  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  28.08 
 
 		 452 aa  104  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  28.08 
 
 		 452 aa  104  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 478 aa  102  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  23.6 
 
 		 442 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  27.63 
 
 		 470 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 457 aa  97.8  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4099  MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 442 aa  94.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273315 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  27.64 
 
 		 466 aa  94.4  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  26.01 
 
 		 451 aa  93.6  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  22.22 
 
 		 468 aa  93.6  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05345  Na+-driven multidrug efflux pump  24.07 
 
 		 445 aa  90.9  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0249  hypothetical protein  27.39 
 
 		 444 aa  90.9  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  25.36 
 
 		 477 aa  90.5  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 440 aa  90.1  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  27.42 
 
 		 484 aa  87.8  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 452 aa  87.4  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 439 aa  87.4  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000543  Na+-driven multidrug efflux pump  26.44 
 
 		 427 aa  86.7  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2709  MATE efflux family protein  25.22 
 
 		 454 aa  85.9  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.74149  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 500 aa  84.7  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  24.93 
 
 		 446 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  28.16 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  24.21 
 
 		 454 aa  84  0.000000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3884  multi anti extrusion protein MatE  28.06 
 
 		 469 aa  83.6  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.316697 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  23.99 
 
 		 453 aa  83.6  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  26.52 
 
 		 463 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  24.76 
 
 		 461 aa  83.2  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  28.16 
 
 		 458 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  22.25 
 
 		 462 aa  83.2  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  23.15 
 
 		 451 aa  82  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  22.63 
 
 		 447 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  22.93 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  29.08 
 
 		 473 aa  80.5  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  24.43 
 
 		 460 aa  80.5  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1507  mate efflux family protein  27.76 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00640866  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  25.5 
 
 		 455 aa  80.1  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1317  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 443 aa  80.1  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.327813  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  25.59 
 
 		 455 aa  79.7  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  26 
 
 		 454 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  21.41 
 
 		 447 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  26.64 
 
 		 477 aa  79  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  24.57 
 
 		 453 aa  78.2  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>