More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3527 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3527  MATE efflux family protein  100 
 
 		 443 aa  874    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  49.54 
 
 		 520 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  49.89 
 
 		 520 aa  402  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  50 
 
 		 515 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  50.23 
 
 		 515 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  50.23 
 
 		 515 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  49.77 
 
 		 517 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  49.66 
 
 		 515 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  48.75 
 
 		 501 aa  398  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  49.43 
 
 		 509 aa  397  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1591  MATE efflux family protein  48.17 
 
 		 521 aa  395  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2765  MATE efflux family protein  48.74 
 
 		 503 aa  385  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.220572 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1558  MATE efflux family protein  49.31 
 
 		 516 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2280  MATE efflux family protein  48.85 
 
 		 531 aa  373  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234689  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  46.92 
 
 		 505 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1492  MATE efflux family protein  46.79 
 
 		 495 aa  371  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2111  MATE efflux family protein  48.49 
 
 		 505 aa  362  9e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01514  hypothetical protein  43.35 
 
 		 486 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2191  MATE efflux family protein  43.28 
 
 		 442 aa  330  2e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114435  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1831  MATE efflux family protein  42.79 
 
 		 451 aa  325  7e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113537 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0285  MATE efflux family protein  42.56 
 
 		 465 aa  318  2e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.47505 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3634  MATE efflux family protein  46.19 
 
 		 463 aa  309  8e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1992  multi antimicrobial extrusion protein MatE  38.44 
 
 		 483 aa  297  3e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  40.05 
 
 		 459 aa  293  4e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2253  MATE efflux family protein  41.45 
 
 		 434 aa  290  5.0000000000000004e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2591  multi anti extrusion protein MatE  41.28 
 
 		 493 aa  287  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2619  multi antimicrobial extrusion protein MatE  40.82 
 
 		 479 aa  286  4e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2814  multi antimicrobial extrusion protein MatE  41.51 
 
 		 493 aa  276  7e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486087 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3952  multi anti extrusion protein MatE  40 
 
 		 481 aa  272  9e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.667584 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5118  multi anti extrusion protein MatE  38.85 
 
 		 453 aa  271  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7265  multi antimicrobial extrusion protein MatE  38.44 
 
 		 491 aa  246  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6022  multi anti extrusion protein MatE  40.76 
 
 		 481 aa  246  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  0.0180252 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3037  hypothetical protein  30.57 
 
 		 453 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0928609  normal  0.0798256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0370  MATE efflux family protein  32.21 
 
 		 458 aa  209  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3172  hypothetical protein  31.12 
 
 		 453 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0893735  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  30.18 
 
 		 454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2187  multi anti extrusion protein MatE  31.04 
 
 		 446 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.761127  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  29.75 
 
 		 451 aa  168  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  29.49 
 
 		 462 aa  164  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  30.92 
 
 		 453 aa  156  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  30.8 
 
 		 478 aa  152  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  28.28 
 
 		 428 aa  146  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  27.6 
 
 		 460 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  27.56 
 
 		 455 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  27.56 
 
 		 455 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 455 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  27.05 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  27.56 
 
 		 455 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 451 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  28.31 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  28.57 
 
 		 460 aa  133  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 455 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  29.21 
 
 		 455 aa  130  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  26.88 
 
 		 456 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  30.23 
 
 		 466 aa  124  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  25.51 
 
 		 452 aa  123  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  27.74 
 
 		 459 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0249  hypothetical protein  28.44 
 
 		 444 aa  121  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  26.2 
 
 		 454 aa  119  7.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4099  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 442 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273315 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05345  Na+-driven multidrug efflux pump  27.21 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000543  Na+-driven multidrug efflux pump  28.77 
 
 		 427 aa  113  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 452 aa  112  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  25.51 
 
 		 452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  26.52 
 
 		 477 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.89 
 
 		 468 aa  109  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  26.52 
 
 		 457 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 440 aa  106  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  24.11 
 
 		 455 aa  103  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 448 aa  103  6e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 461 aa  103  8e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  24.22 
 
 		 467 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  23.13 
 
 		 462 aa  101  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  21.62 
 
 		 452 aa  100  5e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  23.84 
 
 		 454 aa  98.6  2e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  25.31 
 
 		 449 aa  97.8  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  22.25 
 
 		 439 aa  97.8  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  24.45 
 
 		 462 aa  97.1  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  23.91 
 
 		 454 aa  96.3  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  23.99 
 
 		 460 aa  96.3  9e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  23.67 
 
 		 477 aa  95.5  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 447 aa  95.5  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  24 
 
 		 455 aa  94.7  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  23.4 
 
 		 452 aa  94.7  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  23.1 
 
 		 460 aa  94.4  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  22.75 
 
 		 457 aa  94.4  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  25.94 
 
 		 451 aa  94  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3884  multi anti extrusion protein MatE  29.33 
 
 		 469 aa  94  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.316697 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  26.18 
 
 		 500 aa  93.6  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  24.53 
 
 		 453 aa  93.2  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25.84 
 
 		 461 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  24.88 
 
 		 460 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  25.25 
 
 		 437 aa  92.4  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 460 aa  92  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2709  MATE efflux family protein  26.74 
 
 		 454 aa  92.4  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.74149  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  23.35 
 
 		 458 aa  91.3  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  25.25 
 
 		 447 aa  91.7  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>