More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2709 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2709  MATE efflux family protein  100 
 
 		 454 aa  898    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.74149  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05345  Na+-driven multidrug efflux pump  56.28 
 
 		 445 aa  485  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0249  hypothetical protein  54.82 
 
 		 444 aa  474  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000543  Na+-driven multidrug efflux pump  56.4 
 
 		 427 aa  473  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4099  MATE efflux family protein  52.45 
 
 		 442 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273315 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 440 aa  437  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  48.98 
 
 		 466 aa  409  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1317  MATE efflux family protein  43.16 
 
 		 443 aa  302  9e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.327813  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  34.86 
 
 		 462 aa  236  8e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  33.8 
 
 		 453 aa  225  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  30.02 
 
 		 460 aa  196  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  30.36 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  32.56 
 
 		 460 aa  180  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  30.39 
 
 		 454 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  32.12 
 
 		 456 aa  180  4.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  29.71 
 
 		 454 aa  177  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  32.79 
 
 		 428 aa  177  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  29.86 
 
 		 451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  29.06 
 
 		 452 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  29.77 
 
 		 455 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  29.53 
 
 		 455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  28.74 
 
 		 455 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  30.07 
 
 		 452 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  29.53 
 
 		 455 aa  166  9e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  30.12 
 
 		 453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  29.91 
 
 		 452 aa  163  6e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  29.91 
 
 		 452 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  29.89 
 
 		 455 aa  159  7e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  29.04 
 
 		 459 aa  159  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 456 aa  158  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  28.76 
 
 		 476 aa  150  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  27.93 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0285  MATE efflux family protein  30.12 
 
 		 465 aa  139  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.47505 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  28.17 
 
 		 478 aa  131  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  26.48 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3884  multi anti extrusion protein MatE  27.5 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.316697 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  27.5 
 
 		 520 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  27.56 
 
 		 520 aa  123  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 455 aa  122  9e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  26.98 
 
 		 501 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 517 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2191  MATE efflux family protein  25.69 
 
 		 442 aa  121  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114435  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  24.77 
 
 		 456 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  26.98 
 
 		 515 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  26.98 
 
 		 515 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  26.98 
 
 		 515 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  26.76 
 
 		 515 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3634  MATE efflux family protein  28.82 
 
 		 463 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 509 aa  113  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  24.64 
 
 		 439 aa  113  6e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  24.64 
 
 		 452 aa  113  8.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1820  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  26.61 
 
 		 461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1492  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 495 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  23.25 
 
 		 505 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  23.73 
 
 		 462 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  25.35 
 
 		 454 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  23.39 
 
 		 455 aa  109  8.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  23.92 
 
 		 449 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  26.36 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  28.53 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  21.38 
 
 		 462 aa  107  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  28.53 
 
 		 455 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  23.56 
 
 		 464 aa  107  6e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  24 
 
 		 456 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2765  MATE efflux family protein  23.43 
 
 		 503 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.220572 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  24.76 
 
 		 461 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  24.45 
 
 		 499 aa  104  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01514  hypothetical protein  25.52 
 
 		 486 aa  103  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  29.08 
 
 		 455 aa  103  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1558  MATE efflux family protein  22.59 
 
 		 516 aa  103  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1992  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.68 
 
 		 483 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2111  MATE efflux family protein  24.43 
 
 		 505 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.07 
 
 		 475 aa  102  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  25.87 
 
 		 447 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  24.64 
 
 		 477 aa  101  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  25.58 
 
 		 449 aa  99.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 447 aa  99.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  23.32 
 
 		 468 aa  99  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  24.4 
 
 		 460 aa  98.6  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2280  MATE efflux family protein  24.54 
 
 		 531 aa  97.8  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234689  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  24.02 
 
 		 462 aa  97.8  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3527  MATE efflux family protein  26.2 
 
 		 443 aa  97.1  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  25.31 
 
 		 451 aa  96.7  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  23.43 
 
 		 456 aa  96.3  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  24.2 
 
 		 485 aa  95.1  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  25.28 
 
 		 457 aa  95.1  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  24.56 
 
 		 451 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 451 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1591  MATE efflux family protein  24.6 
 
 		 521 aa  94  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  22.69 
 
 		 490 aa  94  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 451 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  24.81 
 
 		 451 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 451 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  25.06 
 
 		 451 aa  93.2  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  26.24 
 
 		 463 aa  93.2  8e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  24.81 
 
 		 451 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0370  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 458 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  24.56 
 
 		 452 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  26.25 
 
 		 470 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>