More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2374 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  73.11 
 
 		 515 aa  716    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  75.3 
 
 		 501 aa  730    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2280  MATE efflux family protein  70.08 
 
 		 531 aa  678    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234689  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  100 
 
 		 509 aa  1009    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2765  MATE efflux family protein  69.74 
 
 		 503 aa  696    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.220572 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  71.73 
 
 		 520 aa  707    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  72.16 
 
 		 517 aa  707    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  73.51 
 
 		 515 aa  718    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  69.76 
 
 		 505 aa  672    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1591  MATE efflux family protein  71.03 
 
 		 521 aa  706    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  73.51 
 
 		 515 aa  719    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  71.54 
 
 		 520 aa  704    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1558  MATE efflux family protein  69.44 
 
 		 516 aa  671    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  73.11 
 
 		 515 aa  715    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1492  MATE efflux family protein  68.94 
 
 		 495 aa  660    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2111  MATE efflux family protein  66.73 
 
 		 505 aa  628  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01514  hypothetical protein  53.3 
 
 		 486 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2191  MATE efflux family protein  49.89 
 
 		 442 aa  428  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114435  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3527  MATE efflux family protein  49.43 
 
 		 443 aa  380  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0285  MATE efflux family protein  46.94 
 
 		 465 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.47505 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  44.77 
 
 		 459 aa  359  6e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3634  MATE efflux family protein  49.3 
 
 		 463 aa  352  5.9999999999999994e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1831  MATE efflux family protein  43.31 
 
 		 451 aa  342  1e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113537 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1992  multi antimicrobial extrusion protein MatE  38.95 
 
 		 483 aa  342  1e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2253  MATE efflux family protein  42.42 
 
 		 434 aa  330  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2619  multi antimicrobial extrusion protein MatE  42.39 
 
 		 479 aa  323  7e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2591  multi anti extrusion protein MatE  40.91 
 
 		 493 aa  318  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3952  multi anti extrusion protein MatE  41.91 
 
 		 481 aa  317  4e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.667584 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5118  multi anti extrusion protein MatE  42.82 
 
 		 453 aa  312  7.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2814  multi antimicrobial extrusion protein MatE  42.99 
 
 		 493 aa  300  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486087 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6022  multi anti extrusion protein MatE  42.98 
 
 		 481 aa  295  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  0.0180252 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7265  multi antimicrobial extrusion protein MatE  42.37 
 
 		 491 aa  295  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0370  MATE efflux family protein  32.43 
 
 		 458 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3037  hypothetical protein  31.92 
 
 		 453 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0928609  normal  0.0798256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3172  hypothetical protein  31.69 
 
 		 453 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0893735  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  32.47 
 
 		 454 aa  189  8e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2187  multi anti extrusion protein MatE  33.1 
 
 		 446 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.761127  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  32.69 
 
 		 462 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  28.37 
 
 		 451 aa  154  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  27.94 
 
 		 460 aa  151  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  27.84 
 
 		 453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  27.42 
 
 		 455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  27.42 
 
 		 455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  27.47 
 
 		 459 aa  147  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 455 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  28.24 
 
 		 455 aa  144  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  25.96 
 
 		 452 aa  144  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  28.37 
 
 		 454 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 456 aa  141  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  28.64 
 
 		 453 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  26 
 
 		 452 aa  137  5e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  31.09 
 
 		 478 aa  137  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 451 aa  136  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 476 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  26.59 
 
 		 439 aa  135  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  26.56 
 
 		 460 aa  133  6.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  24.83 
 
 		 428 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  25.73 
 
 		 452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  25.73 
 
 		 452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  24.69 
 
 		 456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  27.67 
 
 		 454 aa  126  7e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 455 aa  125  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05345  Na+-driven multidrug efflux pump  26.53 
 
 		 445 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  25.51 
 
 		 452 aa  124  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  29.3 
 
 		 460 aa  124  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  25.8 
 
 		 477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  26.57 
 
 		 462 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  26.97 
 
 		 462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4099  MATE efflux family protein  26.48 
 
 		 442 aa  119  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273315 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000543  Na+-driven multidrug efflux pump  27.03 
 
 		 427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.11 
 
 		 468 aa  114  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  27.54 
 
 		 461 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  27.15 
 
 		 466 aa  111  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  29.01 
 
 		 457 aa  110  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0249  hypothetical protein  26.98 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  25.55 
 
 		 468 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  27.63 
 
 		 461 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  27.36 
 
 		 455 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  27.37 
 
 		 467 aa  106  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  26.98 
 
 		 440 aa  105  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  28.01 
 
 		 454 aa  106  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  27.55 
 
 		 470 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  27.21 
 
 		 485 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3884  multi anti extrusion protein MatE  29.48 
 
 		 469 aa  104  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.316697 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  25.42 
 
 		 454 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  26.25 
 
 		 456 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  25.58 
 
 		 455 aa  101  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  26.27 
 
 		 454 aa  101  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  24.82 
 
 		 460 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  25.24 
 
 		 500 aa  100  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2709  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 454 aa  100  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.74149  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 440 aa  100  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  23.02 
 
 		 460 aa  100  7e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  25.78 
 
 		 485 aa  100  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  24.5 
 
 		 451 aa  100  9e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1317  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 443 aa  99.4  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.327813  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  25.67 
 
 		 457 aa  99.8  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>