More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000543 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05345  Na+-driven multidrug efflux pump  89.46 
 
 
445 aa  772    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000543  Na+-driven multidrug efflux pump  100 
 
 
427 aa  841    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4099  MATE efflux family protein  71.43 
 
 
442 aa  626  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273315 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0249  hypothetical protein  71.19 
 
 
444 aa  616  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2709  MATE efflux family protein  56.4 
 
 
454 aa  458  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.74149  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  56.06 
 
 
440 aa  431  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  53.98 
 
 
466 aa  417  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1317  MATE efflux family protein  45.09 
 
 
443 aa  299  8e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.327813  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  36.32 
 
 
462 aa  239  8e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  32.94 
 
 
460 aa  212  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  32.71 
 
 
453 aa  209  7e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  33.17 
 
 
453 aa  187  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  31.72 
 
 
456 aa  186  7e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  30.28 
 
 
452 aa  186  8e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  31.28 
 
 
454 aa  184  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  31.63 
 
 
451 aa  182  7e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  30.43 
 
 
455 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  30.02 
 
 
455 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  30.21 
 
 
455 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  30.21 
 
 
455 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  31.03 
 
 
451 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  30.95 
 
 
455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  30.07 
 
 
452 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  30.05 
 
 
452 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  29.82 
 
 
452 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  32.87 
 
 
428 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  30.44 
 
 
459 aa  170  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  33.09 
 
 
456 aa  169  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  33.88 
 
 
460 aa  169  8e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  30.38 
 
 
455 aa  166  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  29.49 
 
 
476 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  28.47 
 
 
454 aa  160  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3884  multi anti extrusion protein MatE  29.8 
 
 
469 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.316697 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  29.33 
 
 
478 aa  122  9e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0285  MATE efflux family protein  27.53 
 
 
465 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.47505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2111  MATE efflux family protein  28.97 
 
 
505 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  25.95 
 
 
501 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1558  MATE efflux family protein  26.16 
 
 
516 aa  120  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  26.43 
 
 
520 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  26.43 
 
 
517 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  26.19 
 
 
520 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1492  MATE efflux family protein  26.15 
 
 
495 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  27.13 
 
 
515 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  26.9 
 
 
515 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  26.9 
 
 
515 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2280  MATE efflux family protein  26.38 
 
 
531 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234689  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  27.03 
 
 
509 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1591  MATE efflux family protein  25.98 
 
 
521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  26.67 
 
 
515 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  26.39 
 
 
455 aa  112  9e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  25.41 
 
 
505 aa  111  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  25.78 
 
 
499 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2765  MATE efflux family protein  25.46 
 
 
503 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.220572 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  25.47 
 
 
462 aa  108  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  25.41 
 
 
459 aa  107  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  24.42 
 
 
498 aa  106  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  26.02 
 
 
467 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1820  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  28.09 
 
 
461 aa  104  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  25.36 
 
 
453 aa  103  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  25.23 
 
 
485 aa  103  7e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  24.82 
 
 
452 aa  102  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  24.82 
 
 
439 aa  102  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3527  MATE efflux family protein  27.19 
 
 
443 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755877  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  27.48 
 
 
473 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  24.44 
 
 
462 aa  102  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2191  MATE efflux family protein  24.94 
 
 
442 aa  97.8  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114435  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  24.88 
 
 
454 aa  96.7  7e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  23.98 
 
 
460 aa  95.9  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  26.84 
 
 
458 aa  96.3  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  23.83 
 
 
440 aa  95.1  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  25.26 
 
 
478 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  24.1 
 
 
449 aa  95.5  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  23.8 
 
 
447 aa  94.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  25.93 
 
 
457 aa  94.4  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.43 
 
 
460 aa  94  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  24.94 
 
 
458 aa  93.6  6e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  23.47 
 
 
464 aa  93.6  7e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  26.87 
 
 
460 aa  93.2  8e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3634  MATE efflux family protein  25 
 
 
463 aa  93.2  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  23.71 
 
 
454 aa  92.8  1e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  27.16 
 
 
454 aa  92.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  25.12 
 
 
455 aa  92.8  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  25.22 
 
 
453 aa  92  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  23.96 
 
 
448 aa  92  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  24.74 
 
 
458 aa  92  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  24.7 
 
 
485 aa  91.3  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  25.47 
 
 
460 aa  91.3  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  25.95 
 
 
455 aa  90.5  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  26.15 
 
 
455 aa  89.7  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  23.86 
 
 
447 aa  89.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  21.97 
 
 
462 aa  89.4  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  21.46 
 
 
500 aa  88.6  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25 
 
 
468 aa  87.8  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1858  MATE efflux family protein  26.03 
 
 
467 aa  88.2  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0434953  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  24.22 
 
 
486 aa  87.8  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  24.77 
 
 
460 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  23.9 
 
 
538 aa  87.8  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  24.23 
 
 
467 aa  87.4  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  24.59 
 
 
456 aa  87.8  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  23.86 
 
 
485 aa  87.8  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>