More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3487 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  100 
 
 		 459 aa  921    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  46.36 
 
 		 515 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  46.36 
 
 		 515 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  46.36 
 
 		 515 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  44.77 
 
 		 509 aa  378  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2765  MATE efflux family protein  44.4 
 
 		 503 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.220572 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  46.68 
 
 		 515 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  45.77 
 
 		 520 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  45.29 
 
 		 517 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  46.1 
 
 		 520 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  45.08 
 
 		 505 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1492  MATE efflux family protein  45.05 
 
 		 495 aa  375  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  44.85 
 
 		 501 aa  375  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01514  hypothetical protein  44.52 
 
 		 486 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1558  MATE efflux family protein  47.47 
 
 		 516 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1591  MATE efflux family protein  45.45 
 
 		 521 aa  371  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2280  MATE efflux family protein  44.74 
 
 		 531 aa  362  8e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234689  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2111  MATE efflux family protein  44.32 
 
 		 505 aa  354  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3634  MATE efflux family protein  43.58 
 
 		 463 aa  351  2e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0285  MATE efflux family protein  43.42 
 
 		 465 aa  348  1e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.47505 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2191  MATE efflux family protein  39.91 
 
 		 442 aa  332  8e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114435  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3952  multi anti extrusion protein MatE  42.19 
 
 		 481 aa  322  7e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.667584 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1831  MATE efflux family protein  41.86 
 
 		 451 aa  318  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113537 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3527  MATE efflux family protein  40.14 
 
 		 443 aa  296  5e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2619  multi antimicrobial extrusion protein MatE  41.57 
 
 		 479 aa  295  8e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2591  multi anti extrusion protein MatE  41.36 
 
 		 493 aa  293  6e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2253  MATE efflux family protein  39.86 
 
 		 434 aa  288  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2814  multi antimicrobial extrusion protein MatE  41.36 
 
 		 493 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486087 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1992  multi antimicrobial extrusion protein MatE  36.62 
 
 		 483 aa  278  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5118  multi anti extrusion protein MatE  38.6 
 
 		 453 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6022  multi anti extrusion protein MatE  41.91 
 
 		 481 aa  270  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  0.0180252 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7265  multi antimicrobial extrusion protein MatE  40.77 
 
 		 491 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0370  MATE efflux family protein  30.17 
 
 		 458 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  27.62 
 
 		 462 aa  165  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3037  hypothetical protein  29.79 
 
 		 453 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0928609  normal  0.0798256 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  29.52 
 
 		 454 aa  154  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3172  hypothetical protein  28.33 
 
 		 453 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0893735  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  27.65 
 
 		 428 aa  149  9e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2187  multi anti extrusion protein MatE  29.25 
 
 		 446 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.761127  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  28.01 
 
 		 456 aa  147  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  26.29 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  25.92 
 
 		 451 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  26.93 
 
 		 476 aa  143  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  26.02 
 
 		 452 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  27.21 
 
 		 460 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 455 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 455 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 455 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  26.02 
 
 		 455 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 460 aa  138  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  27.43 
 
 		 478 aa  137  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 454 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 453 aa  134  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  25.76 
 
 		 456 aa  134  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  25.79 
 
 		 452 aa  133  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  25.79 
 
 		 452 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  25.79 
 
 		 452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.52 
 
 		 468 aa  130  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  25.56 
 
 		 453 aa  127  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  23.74 
 
 		 452 aa  127  4.0000000000000003e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  24.22 
 
 		 459 aa  126  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  25.29 
 
 		 455 aa  123  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4099  MATE efflux family protein  25.28 
 
 		 442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273315 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  26.03 
 
 		 462 aa  120  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  23.62 
 
 		 439 aa  120  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 460 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  26.99 
 
 		 454 aa  120  4.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  28.23 
 
 		 473 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  23.92 
 
 		 440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 437 aa  117  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05345  Na+-driven multidrug efflux pump  26.17 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  25.57 
 
 		 449 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  25.74 
 
 		 447 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 447 aa  113  9e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0249  hypothetical protein  25 
 
 		 444 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  26.05 
 
 		 460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000543  Na+-driven multidrug efflux pump  25.41 
 
 		 427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 451 aa  110  5e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  25.35 
 
 		 477 aa  110  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  28.07 
 
 		 457 aa  110  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  25 
 
 		 466 aa  109  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  25.66 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  24.82 
 
 		 447 aa  107  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  27.33 
 
 		 448 aa  106  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  28.27 
 
 		 462 aa  103  8e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  24.11 
 
 		 457 aa  103  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1820  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  24.53 
 
 		 461 aa  103  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  24.94 
 
 		 485 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  27.05 
 
 		 454 aa  102  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  25.76 
 
 		 454 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  23.33 
 
 		 466 aa  102  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2709  MATE efflux family protein  26.36 
 
 		 454 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.74149  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  26 
 
 		 455 aa  101  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3884  multi anti extrusion protein MatE  27.1 
 
 		 469 aa  100  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.316697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>