More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01514 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01514  hypothetical protein  100 
 
 		 486 aa  972    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2765  MATE efflux family protein  51.75 
 
 		 503 aa  472  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.220572 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  54.71 
 
 		 505 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1558  MATE efflux family protein  49.2 
 
 		 516 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  53.3 
 
 		 509 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  53.9 
 
 		 520 aa  457  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  54.91 
 
 		 517 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1591  MATE efflux family protein  51.28 
 
 		 521 aa  457  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  54.67 
 
 		 520 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  53.32 
 
 		 501 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1492  MATE efflux family protein  54.69 
 
 		 495 aa  443  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  54.67 
 
 		 515 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  54.67 
 
 		 515 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  54.67 
 
 		 515 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  54.44 
 
 		 515 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2111  MATE efflux family protein  49.69 
 
 		 505 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2280  MATE efflux family protein  50.32 
 
 		 531 aa  427  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234689  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2191  MATE efflux family protein  47.6 
 
 		 442 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114435  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0285  MATE efflux family protein  48.28 
 
 		 465 aa  396  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.47505 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3634  MATE efflux family protein  50 
 
 		 463 aa  384  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  44.52 
 
 		 459 aa  360  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2253  MATE efflux family protein  45.12 
 
 		 434 aa  347  4e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3527  MATE efflux family protein  43.35 
 
 		 443 aa  336  5.999999999999999e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1831  MATE efflux family protein  44.68 
 
 		 451 aa  333  3e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113537 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1992  multi antimicrobial extrusion protein MatE  41.53 
 
 		 483 aa  318  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5118  multi anti extrusion protein MatE  44.21 
 
 		 453 aa  308  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3952  multi anti extrusion protein MatE  42.09 
 
 		 481 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.667584 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2619  multi antimicrobial extrusion protein MatE  41.05 
 
 		 479 aa  300  3e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7265  multi antimicrobial extrusion protein MatE  43.85 
 
 		 491 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6022  multi anti extrusion protein MatE  44.24 
 
 		 481 aa  294  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  0.0180252 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2591  multi anti extrusion protein MatE  40.87 
 
 		 493 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2814  multi antimicrobial extrusion protein MatE  41.1 
 
 		 493 aa  279  8e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0370  MATE efflux family protein  30.47 
 
 		 458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3037  hypothetical protein  29.53 
 
 		 453 aa  196  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0928609  normal  0.0798256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3172  hypothetical protein  30.25 
 
 		 453 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0893735  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  29.9 
 
 		 462 aa  163  8.000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  30.17 
 
 		 454 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  30.05 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2187  multi anti extrusion protein MatE  28.47 
 
 		 446 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.761127  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  27.8 
 
 		 453 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  27.75 
 
 		 460 aa  143  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  28.97 
 
 		 451 aa  143  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  25.75 
 
 		 456 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  29.74 
 
 		 452 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  30.21 
 
 		 455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  30.21 
 
 		 455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  27.97 
 
 		 459 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  29.98 
 
 		 455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  27.03 
 
 		 460 aa  131  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  25.43 
 
 		 428 aa  131  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  29.74 
 
 		 455 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  26.78 
 
 		 478 aa  130  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  29.88 
 
 		 456 aa  130  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  27.42 
 
 		 454 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  30.21 
 
 		 452 aa  126  7e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  29.98 
 
 		 452 aa  126  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  28.2 
 
 		 455 aa  126  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  26.33 
 
 		 477 aa  124  4e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  29.11 
 
 		 452 aa  124  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  26.6 
 
 		 454 aa  121  3e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 440 aa  121  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  28.44 
 
 		 453 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  27.49 
 
 		 455 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 462 aa  120  6e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  23.64 
 
 		 452 aa  119  9e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  26.78 
 
 		 454 aa  117  3.9999999999999997e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3884  multi anti extrusion protein MatE  29.38 
 
 		 469 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.316697 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  23.82 
 
 		 439 aa  117  5e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  29.51 
 
 		 476 aa  117  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 468 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  31.35 
 
 		 448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  26.36 
 
 		 498 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 466 aa  113  9e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  24.77 
 
 		 455 aa  109  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  26.45 
 
 		 485 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 454 aa  105  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  25.06 
 
 		 456 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  23.72 
 
 		 463 aa  100  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 457 aa  100  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2709  MATE efflux family protein  25.52 
 
 		 454 aa  100  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.74149  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 466 aa  99.8  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  23.81 
 
 		 460 aa  99.8  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  27.04 
 
 		 448 aa  99  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  26.15 
 
 		 470 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  24.54 
 
 		 455 aa  97.8  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  23.54 
 
 		 462 aa  97.4  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  25.44 
 
 		 461 aa  97.1  6e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  23.13 
 
 		 468 aa  97.1  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  26.69 
 
 		 455 aa  97.1  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  24.05 
 
 		 461 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  23.91 
 
 		 475 aa  94.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  24.88 
 
 		 455 aa  94.7  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  23.87 
 
 		 458 aa  94.4  5e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  24.23 
 
 		 451 aa  94  6e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  25.54 
 
 		 455 aa  93.6  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  25.29 
 
 		 462 aa  93.6  8e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  23.68 
 
 		 455 aa  93.2  9e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  23.84 
 
 		 453 aa  93.2  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  23.16 
 
 		 464 aa  92.4  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  28.04 
 
 		 477 aa  92.8  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>