More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3952 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3952  multi anti extrusion protein MatE  100 
 
 		 481 aa  899    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.667584 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2619  multi antimicrobial extrusion protein MatE  66.38 
 
 		 479 aa  519  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2591  multi anti extrusion protein MatE  64.98 
 
 		 493 aa  521  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2814  multi antimicrobial extrusion protein MatE  68.35 
 
 		 493 aa  495  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7265  multi antimicrobial extrusion protein MatE  62.13 
 
 		 491 aa  405  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6022  multi anti extrusion protein MatE  60.04 
 
 		 481 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  0.0180252 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1831  MATE efflux family protein  51.03 
 
 		 451 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113537 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1992  multi antimicrobial extrusion protein MatE  46.2 
 
 		 483 aa  349  6e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  42.47 
 
 		 501 aa  344  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2253  MATE efflux family protein  49.77 
 
 		 434 aa  343  4e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  42.03 
 
 		 517 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  41.97 
 
 		 520 aa  335  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  41.76 
 
 		 520 aa  333  3e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2765  MATE efflux family protein  40.17 
 
 		 503 aa  332  9e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.220572 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  43.05 
 
 		 515 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  44.01 
 
 		 515 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  43.05 
 
 		 515 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  41.91 
 
 		 509 aa  331  2e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  44.01 
 
 		 515 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  40.49 
 
 		 505 aa  329  7e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1591  MATE efflux family protein  42.27 
 
 		 521 aa  329  8e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0285  MATE efflux family protein  44.87 
 
 		 465 aa  327  3e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.47505 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1558  MATE efflux family protein  44.11 
 
 		 516 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1492  MATE efflux family protein  44.62 
 
 		 495 aa  325  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5118  multi anti extrusion protein MatE  49.76 
 
 		 453 aa  321  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2280  MATE efflux family protein  44.7 
 
 		 531 aa  320  3e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234689  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2111  MATE efflux family protein  41.04 
 
 		 505 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  42.19 
 
 		 459 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3634  MATE efflux family protein  45.09 
 
 		 463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01514  hypothetical protein  42.09 
 
 		 486 aa  303  5.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2191  MATE efflux family protein  35.45 
 
 		 442 aa  282  8.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114435  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3527  MATE efflux family protein  40 
 
 		 443 aa  268  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755877  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0370  MATE efflux family protein  35.81 
 
 		 458 aa  217  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3037  hypothetical protein  34.81 
 
 		 453 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0928609  normal  0.0798256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3172  hypothetical protein  35.96 
 
 		 453 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0893735  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2187  multi anti extrusion protein MatE  36.39 
 
 		 446 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.761127  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  27.51 
 
 		 462 aa  140  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  29.98 
 
 		 454 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  28.12 
 
 		 452 aa  123  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  26.92 
 
 		 451 aa  123  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  26.41 
 
 		 460 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  26.64 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  29.06 
 
 		 453 aa  118  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  28.74 
 
 		 455 aa  117  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  27.33 
 
 		 451 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  27.51 
 
 		 454 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  27.98 
 
 		 452 aa  114  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  27.75 
 
 		 452 aa  114  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  28.37 
 
 		 460 aa  111  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  24.32 
 
 		 456 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  25.81 
 
 		 428 aa  110  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  28.12 
 
 		 455 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  26.64 
 
 		 467 aa  108  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  26.4 
 
 		 456 aa  107  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  26.44 
 
 		 452 aa  107  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 455 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 455 aa  106  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  26.74 
 
 		 455 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  26.47 
 
 		 455 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  29.87 
 
 		 478 aa  104  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  27.07 
 
 		 459 aa  99  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1317  MATE efflux family protein  29.19 
 
 		 443 aa  97.4  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.327813  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000543  Na+-driven multidrug efflux pump  29.35 
 
 		 427 aa  94.4  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05345  Na+-driven multidrug efflux pump  25.05 
 
 		 445 aa  93.2  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4099  MATE efflux family protein  27.13 
 
 		 442 aa  91.3  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273315 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 476 aa  90.5  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  28.71 
 
 		 466 aa  90.5  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  24.44 
 
 		 460 aa  88.2  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  26.01 
 
 		 470 aa  87.4  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 440 aa  87.4  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0249  hypothetical protein  26.74 
 
 		 444 aa  87  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  21.84 
 
 		 462 aa  86.7  8e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  30.87 
 
 		 500 aa  85.1  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  24.52 
 
 		 475 aa  84.7  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  30.75 
 
 		 457 aa  83.2  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.46 
 
 		 468 aa  82.4  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  23.64 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 454 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  25.3 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 498 aa  80.5  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  31.52 
 
 		 500 aa  79.7  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  26.95 
 
 		 477 aa  79  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  21.67 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  26.86 
 
 		 461 aa  77  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  31.32 
 
 		 496 aa  76.6  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  23.88 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  22.71 
 
 		 438 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  25.83 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  22.71 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  23.21 
 
 		 454 aa  73.9  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  23.17 
 
 		 460 aa  73.6  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  25.09 
 
 		 460 aa  73.2  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1790  hypothetical protein  25.56 
 
 		 443 aa  73.2  0.000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  21.77 
 
 		 456 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 475 aa  72.8  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  22.42 
 
 		 452 aa  72  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  21.97 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  23.96 
 
 		 454 aa  72.4  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  26.37 
 
 		 458 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  28.12 
 
 		 449 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>